本文關(guān)鍵詞：埃博拉病毒2014年毒株的基因組變異特征分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的通過(guò)對(duì)埃博拉病毒2014年毒株基因組共102株序列的分析,研究其變異特征,探討病毒基因組變異與其流行病學(xué)特征改變之間的關(guān)系。方法選取NCBI公共數(shù)據(jù)庫(kù)中埃博拉病毒全基因組序列,應(yīng)用Mummer3.0軟件分析病毒基因組變異特征;使用MEGA5軟件進(jìn)行蛋白進(jìn)化分析;應(yīng)用CPHmodels和PyMOL軟件,根據(jù)蛋白同源性模擬蛋白的三維構(gòu)型。結(jié)果埃博拉病毒2014年毒株(扎伊爾型)基因組中,共有606個(gè)位點(diǎn)發(fā)生變異,其中有49個(gè)變異位點(diǎn)是2014年毒株特有的、并導(dǎo)致所編碼的氨基酸發(fā)生非同義突變。特別是NP蛋白第128位、GP蛋白第82位和L蛋白第1 951位氨基酸,不僅在2014年之前所有的扎伊爾型毒株中是保守不變的,而且在其余埃博拉病毒亞型之間也是高度保守的,但在2014年毒株中卻發(fā)生了特異性的變異。結(jié)論埃博拉病毒2014年毒株基因組具有獨(dú)特的變異特征,使得NP、GP和L蛋白發(fā)生變異,特別是GP蛋白第82位氨基酸由丙氨酸突變?yōu)槔i氨酸,將影響其所在的α螺旋的穩(wěn)定性,這可能是2014年毒株致死能力減弱和傳播能力增強(qiáng)的原因之一�；蚪M變異是否直接導(dǎo)致此次疫情中病毒流行病學(xué)特征改變,還需要進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)研究證實(shí)。
【作者單位】： 上海人類基因組研究中心上海市疾病與健康基因組學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;第二軍醫(yī)大學(xué)熱帶醫(yī)學(xué)和公共衛(wèi)生學(xué)系生物防御(微生物)教研室;
【關(guān)鍵詞】： 埃博拉病毒 病毒基因組 變異(遺傳學(xué)) 計(jì)算生物學(xué)
【基金】：“艾滋病和病毒性肝炎等重大傳染病防治”科技重大專項(xiàng)“十二五”課題(2013ZX10004104) 國(guó)家自然科學(xué)基金(91331107) 上海市科委基礎(chǔ)研究課題(12ZR1421200)~~
【分類號(hào)】：R373
【正文快照】： 埃博拉病毒(Ebola virus,EBOV)是能夠在人類和靈長(zhǎng)類動(dòng)物中引起高死亡率的病毒,被WHO列為對(duì)人類危害最嚴(yán)重的病毒之一,位居第四級(jí)致病生物[1]。EBOV屬于絲狀病毒科(Filoviridae)、絲狀病毒屬(Filovirus),其基因組為不分節(jié)段的單股負(fù)鏈RNA,全長(zhǎng)約19kb,共有7個(gè)基因、9個(gè)開(kāi)放閱讀

【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 段虎;紅螯螯蝦（Cherax quadricarinatus）血細(xì)胞培養(yǎng)及細(xì)胞免疫學(xué)研究[D];中國(guó)科學(xué)院研究生院（海洋研究所）;2014年

2 王于;基于扎伊爾埃博拉病毒包膜蛋白的新抗原片段篩選及rVSV載體疫苗的構(gòu)建[D];中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2014年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 趙晨;埃博拉病毒糖蛋白的毒性研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2011年

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 ;埃博拉病毒[J];國(guó)外畜牧科技;2001年06期

2 楊濤;埃博拉病毒的研究概況[J];國(guó)外醫(yī)學(xué).病毒學(xué)分冊(cè);2002年05期

3 孫玉蘭,李德新;埃博拉病毒結(jié)構(gòu)蛋白研究進(jìn)展[J];中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志;2004年04期

4 ;干擾埃博拉病毒繁殖突破性進(jìn)展[J];臨床合理用藥雜志;2010年12期

5 ;美科學(xué)家揭開(kāi)埃博拉病毒之謎[J];生物學(xué)教學(xué);2014年01期

6 卞文;埃博拉病毒肆虐[J];國(guó)外科技動(dòng)態(tài);1996年11期

7 ;何謂埃博拉病毒[J];山西教育;2001年10期

8 楊世誠(chéng);前度“劉愞”今又來(lái)——埃博拉病毒的來(lái)龍去脈[J];百科知識(shí);2001年02期

9 李瀟;埃博拉病毒糖蛋白致命之謎[J];生物化學(xué)與生物物理學(xué)報(bào);2001年01期

10 聶福平;范泉水;王靈強(qiáng);郄翠仙;郭松輝;龍貴偉;李麗紅;張念祖;;埃博拉病毒的研究進(jìn)展[J];中國(guó)畜牧獸醫(yī);2006年10期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條

1 李霄;金寧一;米志強(qiáng);;埃博拉病毒疫苗及其治療方法相關(guān)研究進(jìn)展[A];人畜共患傳染病防治研究新成果匯編[C];2004年

2 張振清;袁志明;;卡爾扎伊型埃博拉病毒的重組病毒疫苗研究[A];2013年湖北省暨武漢微生物學(xué)會(huì)會(huì)員代表大會(huì)暨學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要集[C];2013年

3 夏咸柱;;野生動(dòng)物疫病與公共衛(wèi)生[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)養(yǎng)犬學(xué)分會(huì)第十二次全國(guó)養(yǎng)犬學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2007年

中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 ;美研究人員發(fā)現(xiàn)豬感染埃博拉病毒[N];新華每日電訊;2009年

2 王文成;埃博拉病毒加速大型類人猿滅亡[N];新華每日電訊;2005年

3 王雯婷;埃博拉病毒扯動(dòng)世界[N];人民日?qǐng)?bào)海外版;2014年

4 杜鵑;埃博拉病毒六問(wèn)[N];新華每日電訊;2014年

5 張忠霞;埃博拉病毒為何難降服[N];健康報(bào);2014年

6 徐蔚冰;埃博拉病毒離我們有多遠(yuǎn)[N];中國(guó)經(jīng)濟(jì)時(shí)報(bào);2014年

7 張?zhí)锟?埃博拉病毒的“零藥物”之憂[N];中國(guó)醫(yī)藥報(bào);2014年

8 編譯 許關(guān)煜;激戰(zhàn)埃博拉病毒[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報(bào);2014年

9 記者 郭思遠(yuǎn);中國(guó)：離埃博拉病毒有多遠(yuǎn)？[N];北京科技報(bào);2014年

10 張?zhí)锟?警報(bào) 嚴(yán)防埃博拉病毒全球擴(kuò)散[N];文匯報(bào);2014年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前4條

1 蓋微微;致死型埃博拉病毒核酸和抗體檢測(cè)方法的建立[D];吉林農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

2 趙晨;埃博拉病毒糖蛋白的毒性研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2011年

3 張桂根;埃博拉病毒包膜蛋白GP細(xì)胞毒性機(jī)理研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2011年

4 劉陽(yáng);熒光定量RT-PCR檢測(cè)埃博拉病毒方法的建立[D];黑龍江大學(xué);2012年

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