幽門(mén)螺桿菌臨床株cagA基因克隆及序列分析
本文關(guān)鍵詞:幽門(mén)螺桿菌臨床株cagA基因克隆及序列分析,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的分離鑒定臨床分離株幽門(mén)螺桿菌(Helicobacter pylori,Hp),分析其CagA蛋白的磷酸化基序EPIYA,探討東亞株Hp CagA序列的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)。方法選取胃相關(guān)疾病患者的胃黏膜組織,剪碎后接種于哥倫比亞血瓊脂平板,微需氧培養(yǎng),菌落生長(zhǎng)后通過(guò)尿素酶試驗(yàn)、革蘭染色及顯微鏡檢查對(duì)Hp進(jìn)行初步鑒定。提取菌落基因組,PCR擴(kuò)增Hp 16SrRNA基因并進(jìn)行測(cè)序鑒定;擴(kuò)增cagA基因全長(zhǎng)序列,連接入pMD18-T載體。將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)入感受態(tài)E.coli DH5α,測(cè)序鑒定重組質(zhì)粒,利用DNAStar和MEGA 6軟件對(duì)cagA序列進(jìn)行比對(duì)及聚類(lèi)分析。結(jié)果成功分離Hp共26株。構(gòu)建pMD18-T/cagA克隆載體后對(duì)26株Hp的cagA基因全長(zhǎng)測(cè)序,序列比對(duì)分析顯示有6株為西方型,20株為東亞型。東亞型CagA第815~834位點(diǎn)存在13個(gè)氨基酸的缺失、部分缺失或變異,西方型中有3株丟失磷酸化位點(diǎn)EPIYA-C;聚類(lèi)分析顯示Hp分離株分別聚類(lèi)為東亞群、西方型東亞群以及西方群3群。結(jié)論 Hp分離株以東亞株為主,但也存在西方株感染;東、西方型CagA在EPIYA基序及側(cè)翼序列顯著差異,菌株之間存在聚類(lèi)關(guān)系。
【作者單位】: 貴陽(yáng)醫(yī)學(xué)院分子生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;貴陽(yáng)醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院微生物教研室;
【關(guān)鍵詞】: 幽門(mén)螺桿菌 CagA蛋白 EPIYA基序 聚類(lèi)分析
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.81260303) 貴州省2011協(xié)同創(chuàng)新中心項(xiàng)目(黔教合協(xié)同創(chuàng)新中心[2014]06) 貴州省科技攻關(guān)計(jì)劃基金項(xiàng)目(黔科合SY字[2011]3067號(hào))
【分類(lèi)號(hào)】:R378
【正文快照】: ***幽門(mén)螺桿菌(Helicobacter pylori,Hp)是一種螺桿狀革蘭陰性微需氧菌,具有高變異性和顯著的地域流行差異,長(zhǎng)期定植于人類(lèi)胃腸道,是慢性胃炎、胃潰瘍的主要致病因素之一,與胃癌的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)[1-3]。CagA(cytotoxin associated protein A)是目前已知的唯一能被Hp注入胃上
【參考文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條
1 吳鶯;張尤歷;范鈺;魏金文;何亞龍;沈琰;陳勁頻;印亦萍;王文兵;;鎮(zhèn)江地區(qū)H pylori的cagA基因及其3′可變區(qū)結(jié)構(gòu)的變化[J];世界華人消化雜志;2007年29期
2 楊澤民;陳蔚文;;幽門(mén)螺桿菌vacA和cagA基因全長(zhǎng)分子系統(tǒng)發(fā)育分析[J];遺傳;2012年07期
【共引文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 姜成;林瑜;王曉寧;劉芬;;不同胃痛證型幽門(mén)螺桿菌vacA基因亞型和胃上皮核因子-κB的表達(dá)[J];福建中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào);2014年01期
2 廖盛濤;張開(kāi)元;蘭春慧;;幽門(mén)螺桿菌CagA與胃癌的研究進(jìn)展[J];國(guó)際消化病雜志;2014年04期
3 張雁;張姝;羅昭遜;孫朝琴;渠巍;熊麗娟;莫非;;中藥頭花蓼對(duì)幽門(mén)螺桿菌CagA及VacA表達(dá)的影響[J];貴陽(yáng)醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2015年05期
4 劉鹿;王林;劉純杰;;幽門(mén)螺桿菌毒力相關(guān)基因A及其亞型多樣性與胃癌的關(guān)系[J];解放軍醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2015年06期
5 吳鶯;艾寬寬;沈琰;李翔;賀明潔;穆原;周紅;;幽門(mén)螺桿菌對(duì)人胃上皮細(xì)胞β-catenin蛋白信號(hào)途徑影響意義的研究[J];中華腫瘤防治雜志;2014年02期
6 盧曉敏;王振寧;楊軍;;潰瘍性結(jié)腸炎合并幽門(mén)螺桿菌感染患者清除幽門(mén)螺桿菌治療對(duì)預(yù)后的影響[J];山西醫(yī)藥雜志;2015年01期
7 吳鶯;李翔;周紅;范鈺;張尤歷;沈琰;何亞龍;;幽門(mén)螺桿菌對(duì)胃癌細(xì)胞BGC-823形態(tài)及凋亡相關(guān)基因表達(dá)的影響[J];世界華人消化雜志;2011年17期
8 陳玉林;徐燦霞;陳雄;;湖南地區(qū)幽門(mén)螺桿菌CagA基因3'端多態(tài)性與胃十二指腸疾病的關(guān)系[J];分子診斷與治療雜志;2010年04期
9 蔣雙紅;吳鶯;賀明潔;余小燕;王靜;蔣曉猛;周紅;;鎮(zhèn)江地區(qū)胃腸病患者幽門(mén)螺桿菌vacA基因i、d區(qū)分型特點(diǎn)及臨床關(guān)聯(lián)[J];江蘇大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版);2013年02期
10 Yang Zhao;Jing-Wen Wang;Tsutomu Tanaka;Akihiro Hosono;Ryosuke Ando;Shinkan Tokudome;Soeripto;FX Ediati Triningsih;Tegu Triono;Suwignyo Sumoharjo;EY Wenny Astuti Achwan;Stephanus Gunawan;Yu-Min Li;;Association between TNF-a and IL-1β genotypes vs Helicobacter pylori infection in Indonesia[J];World Journal of Gastroenterology;2013年46期
中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條
1 陳建國(guó);幽門(mén)螺桿菌CagA/UreB口服減毒沙門(mén)氏菌活載體疫苗的研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年
2 FAISAL AZIZ(非索阿茲斯);巖藻糖化寡糖Lewis Y抗原及其合成酶FUT4的表達(dá)與胃癌幽門(mén)螺桿菌相關(guān)性的研究[D];大連醫(yī)科大學(xué);2014年
3 陳帥印;幽門(mén)螺桿菌CagA蛋白調(diào)控α-烯醇酶表達(dá)的機(jī)制[D];鄭州大學(xué);2014年
中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前5條
1 張雙霞;MIF在Hp感染相關(guān)性胃病中的表達(dá)與Hp cagA相關(guān)性研究[D];蘭州大學(xué);2009年
2 陳玉林;不同類(lèi)型幽門(mén)螺桿菌對(duì)GES-1細(xì)胞Cx32、Cx43表達(dá)及GJIC功能的影響[D];中南大學(xué);2010年
3 林維石;幽門(mén)螺桿菌cagA轉(zhuǎn)基因小鼠胃病理表型與分析[D];中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2013年
4 莫瑞峰;基于DNA條形碼的系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)構(gòu)建[D];吉林大學(xué);2014年
5 楊斐;漢、瑤民族慢性胃炎、胃潰瘍患者中Hp cagA、vacA表達(dá)的相關(guān)性研究[D];南華大學(xué);2014年
【二級(jí)參考文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前6條
1 周建嫦;張建中;徐采樸;何利華;;幽門(mén)螺桿菌cagA長(zhǎng)度多態(tài)性及其臨床意義[J];解放軍醫(yī)學(xué)雜志;2005年12期
2 王晶桐;劉玉蘭;;87株幽門(mén)螺旋桿菌VacA等位基因的分析[J];中國(guó)消化內(nèi)鏡;2008年11期
3 楊澤民;;中國(guó)幽門(mén)螺桿菌強(qiáng)細(xì)胞毒株和弱細(xì)胞毒株vacA基因全長(zhǎng)序列特征與VacA活性的關(guān)系[J];世界華人消化雜志;2011年33期
4 朱永良,杜勤,錢(qián)可大,方平楚,鄭樹(shù);幽門(mén)螺桿菌CagA C-端功能域特征及其生物學(xué)功能研究[J];中華消化雜志;2004年05期
5 陳學(xué)軍,嚴(yán)杰,毛亞飛,李立偉;浙江地區(qū)幽門(mén)螺桿菌臨床菌株vacA優(yōu)勢(shì)基因型及其核苷酸序列分析[J];浙江大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版);2003年01期
6 Takafumi Ando;Yasuyuki Goto;Osamu Maeda;Osamu Watanabe;Kazuhiro Ishiguro;Hidemi Goto;;Causal role of Helicobacter pylori infection in gastric cancer[J];World Journal of Gastroenterology;2006年02期
【相似文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 ;芳環(huán)上96種常用取代基的 Q 型聚類(lèi)分析法[J];南京藥學(xué)院學(xué)報(bào);1984年01期
2 成啟威;李鳳華;金維哲;張雅茹;原德新;王大江;;胎兒十六項(xiàng)指標(biāo)的聚類(lèi)分析[J];黑龍江醫(yī)藥科學(xué);1987年03期
3 廖建華;崔君兆;張玲;;一種新的聚類(lèi)分析[J];中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì);1987年03期
4 聶瀅;沈安;;采用聚類(lèi)分析方法評(píng)價(jià)10歲男生的生長(zhǎng)發(fā)育水平[J];中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì);1988年01期
5 蘇薇薇;聚類(lèi)分析法在黃芩鑒別分類(lèi)中的應(yīng)用[J];中國(guó)中藥雜志;1991年10期
6 譚遠(yuǎn)德,吳昌謀;核型似近系數(shù)的聚類(lèi)分析方法[J];遺傳學(xué)報(bào);1993年04期
7 李少英;李月秋;王維人;白建明;閆莉薔;劉景順;王景華;張淑芹;;藏族七個(gè)群體皮紋參數(shù)的聚類(lèi)分析[J];佳木斯醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);1993年01期
8 李少英;李月秋;王維人;閆莉薔;白建明;王景華;張淑芹;;彝族6個(gè)群體皮紋參數(shù)的聚類(lèi)分析[J];佳木斯醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);1993年03期
9 段東平;簡(jiǎn)易聚類(lèi)分析在飛機(jī)衛(wèi)生狀況評(píng)價(jià)中的應(yīng)用[J];中國(guó)國(guó)境衛(wèi)生檢疫雜志;1995年01期
10 石曙光;人體生理節(jié)律聚類(lèi)分析與正交試驗(yàn)設(shè)想[J];延邊大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);1997年04期
中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 李均立;傅國(guó)華;;海南各縣(市)經(jīng)濟(jì)實(shí)力的聚類(lèi)分析[A];中國(guó)現(xiàn)場(chǎng)統(tǒng)計(jì)研究會(huì)第12屆學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2005年
2 梅翠;;我國(guó)各地區(qū)居民收入差距及其對(duì)消費(fèi)的制約[A];中國(guó)現(xiàn)場(chǎng)統(tǒng)計(jì)研究會(huì)第12屆學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2005年
3 劉黃金;曹林峰;;南京服務(wù)業(yè)發(fā)展的聚類(lèi)分析[A];江蘇省現(xiàn)場(chǎng)統(tǒng)計(jì)研究會(huì)第十次學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2006年
4 肖靜;楊澤峰;徐辰武;;微陣列表達(dá)譜監(jiān)督聚類(lèi)分析方法的比較研究[A];江蘇省遺傳學(xué)會(huì)第七屆代表大會(huì)暨學(xué)術(shù)研討會(huì)論文摘要匯編[C];2006年
5 路愛(ài)峰;崔玉杰;;滬市電力上市公司經(jīng)營(yíng)業(yè)績(jī)的聚類(lèi)分析[A];中國(guó)數(shù)學(xué)力學(xué)物理學(xué)高新技術(shù)交叉研究學(xué)會(huì)第十二屆學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2008年
6 陳國(guó)華;廖小蓮;夏君;;證券投資分析的聚類(lèi)分析方法[A];中國(guó)企業(yè)運(yùn)籌學(xué)[2011(1)][C];2011年
7 牛東曉;乞建勛;;網(wǎng)絡(luò)資源平衡問(wèn)題的聚類(lèi)分析優(yōu)化遺傳算法研究[A];2001年中國(guó)管理科學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];2001年
8 張紅衛(wèi);隗金水;;聚類(lèi)分析評(píng)價(jià)與測(cè)量效度關(guān)系探討[A];第九屆全國(guó)體育科學(xué)大會(huì)論文摘要匯編(4)[C];2011年
9 詹原瑞;彭書(shū)杰;李如一;;基于聚類(lèi)分析的企業(yè)信用等級(jí)評(píng)價(jià)方法[A];西部開(kāi)發(fā)與系統(tǒng)工程——中國(guó)系統(tǒng)工程學(xué)會(huì)第12屆年會(huì)論文集[C];2002年
10 鄒曉玫;修春波;;基于聚類(lèi)分析的犯罪率相關(guān)因素的研究[A];當(dāng)代法學(xué)論壇(二○一○年第3輯)[C];2010年
中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前5條
1 張建萍;基于計(jì)算智能技術(shù)的聚類(lèi)分析研究與應(yīng)用[D];山東師范大學(xué);2014年
2 李成安;分布式環(huán)境下聚類(lèi)分析新方法的研究[D];浙江大學(xué);2006年
3 楊旭杰;基于統(tǒng)計(jì)方法模型分析的中藥復(fù)方專(zhuān)利保護(hù)研究[D];北京中醫(yī)藥大學(xué);2012年
4 李寶玲;王裕頤教授學(xué)術(shù)思想與臨床經(jīng)驗(yàn)總結(jié)及治療眩暈證治規(guī)律研究[D];北京中醫(yī)藥大學(xué);2012年
5 周韜;鹽脅迫下胡楊的生理響應(yīng)及miRNA表達(dá)動(dòng)態(tài)變化[D];北京林業(yè)大學(xué);2014年
中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 馮文鍇;聚類(lèi)分析在古生物學(xué)和礦物學(xué)中的應(yīng)用[D];蘭州大學(xué);2009年
2 馮偉;聚類(lèi)分析在金融數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用研究[D];遼寧師范大學(xué);2009年
3 鄒家興;基于混合多指標(biāo)信息的聚類(lèi)分析[D];東北大學(xué);2008年
4 陳艷伍;聚類(lèi)分析模型在納稅評(píng)估中的應(yīng)用[D];湖北大學(xué);2013年
5 張中月;影響聚類(lèi)分析方法應(yīng)用效果的因素分析[D];沈陽(yáng)體育學(xué)院;2012年
6 陳毅;基于基因表達(dá)式編程的大壩位移強(qiáng)度聚類(lèi)分析模型研究[D];江西理工大學(xué);2014年
7 曾玉鈺;定性數(shù)據(jù)的聚類(lèi)方法及其應(yīng)用探析[D];廈門(mén)大學(xué);2008年
8 楊磊;一種兩總體聚類(lèi)判別算法及其應(yīng)用研究[D];四川大學(xué);2005年
9 孫冰心;基于譜系聚類(lèi)分析的集裝箱裝箱方案優(yōu)化研究[D];河北工業(yè)大學(xué);2003年
10 李黎;基于聚類(lèi)分析的負(fù)荷數(shù)據(jù)分類(lèi)方法的研究[D];華北電力大學(xué)(北京);2004年
本文關(guān)鍵詞:幽門(mén)螺桿菌臨床株cagA基因克隆及序列分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號(hào):401655
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/shiyanyixue/401655.html