志賀氏菌VirB蛋白激活毒力基因轉(zhuǎn)錄的分子機(jī)理研究
發(fā)布時(shí)間:2024-05-11 23:54
在現(xiàn)代社會(huì)中,細(xì)菌性痢疾仍然是全球公共衛(wèi)生安全面臨重大威脅之一。在發(fā)展中國(guó)家,細(xì)菌性痢疾的危害尤為嚴(yán)重。志賀氏菌屬于革蘭氏陰性桿菌,是導(dǎo)致細(xì)菌性痢疾的首要病原體。志賀氏菌可分為四個(gè)血清群,包括了A群:志賀氏痢疾桿菌(S.dysenteriae),B群:福氏痢疾桿菌(S.flexneri),C群:鮑氏痢疾桿菌(S.boydii)和D群:宋內(nèi)氏痢疾桿菌(S. sonnei)。在我國(guó),福氏痢疾桿菌為主要的流行菌株。在以往的研究工作中,我們于2001年完成了福氏痢疾桿菌2a301株的全基因組序列測(cè)定,是我國(guó)首個(gè)獨(dú)立完成的微生物基因組項(xiàng)目,為志賀氏菌的致病機(jī)理研究提供了完整的遺傳背景信息。 志賀氏菌的基因組序列與大腸桿菌高度同源,其致病性主要基于細(xì)菌中約230Kb的侵襲性大質(zhì)粒。痢疾桿菌的毒力基因集中分布在侵襲性大質(zhì)粒中約31Kb的”entry region"中。這些毒力基因編碼了包括細(xì)菌毒素,三型分泌系統(tǒng)(T3SS)的結(jié)構(gòu)蛋白及效應(yīng)因子等大量蛋白質(zhì)。因此,毒力基因的表達(dá)無(wú)疑為細(xì)菌造成巨大的代謝負(fù)擔(dān)。因此,在進(jìn)化的過(guò)程中,志賀氏菌形成了一個(gè)精巧的毒力基因轉(zhuǎn)錄和表達(dá)調(diào)控體系,由來(lái)自侵襲性大質(zhì)粒的調(diào)...
【文章頁(yè)數(shù)】:105 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
引言
志賀氏菌致病機(jī)理
志賀氏菌致病的分子機(jī)制
志賀氏菌毒力大質(zhì);蚪M
志賀氏菌毒力大質(zhì)粒編碼蛋白
志賀氏菌毒力大質(zhì)粒的毒力調(diào)控
志賀氏菌T3SS
志賀氏菌T3SS的粘附和誘導(dǎo)
志賀氏菌T3SS誘導(dǎo)引發(fā)細(xì)菌侵襲
志賀氏菌細(xì)胞內(nèi)移動(dòng)和細(xì)胞間播散
總結(jié)
志賀氏菌毒力調(diào)控因子VirB蛋白研究進(jìn)展
VirB蛋白的主要結(jié)構(gòu)域
VirB蛋白轉(zhuǎn)錄調(diào)控的分子遺傳學(xué)基礎(chǔ)
VirB蛋白通過(guò)佶抗H-NS蛋白實(shí)現(xiàn)基因轉(zhuǎn)錄
VirB 同源蛋白 ParB,KorB,SopB 和 SpoOJ 結(jié)構(gòu)
VirB蛋白措抗H-NS的分子機(jī)制
總結(jié)
本課題研究擬解決科學(xué)問(wèn)題
本課題研究?jī)?nèi)容和意義
1. VirB蛋白結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究
2. VirB蛋白的生物物理及生物化學(xué)的研究
3. VirB蛋白的體內(nèi)細(xì)菌學(xué)研究
1. 材料
1.1 菌株
1.2 DNA
1.3 質(zhì)粒
1.4 常用試劑和耗材
1.5 常用溶液
1.6 常用儀器和設(shè)備
2. 方法
2.1 質(zhì)粒構(gòu)建
2.2 virB基因突變菌株的構(gòu)建
2.3 蛋白表達(dá)純化
2.4 硒代蛋白表達(dá)純化
2.5 熒光光譜實(shí)驗(yàn)
2.6 復(fù)合物的組裝
2.7 晶體的初篩
2.8 晶體優(yōu)化
2.9 晶體數(shù)據(jù)收集與結(jié)構(gòu)解析
2.10 凝膠阻滯實(shí)驗(yàn)
2.11 beta半乳糖苷酶活性測(cè)定
3. 結(jié)果
3.1 VirB蛋白同源于質(zhì)粒分離蛋白
3.2 蛋白表達(dá)和純化
3.3 VirB蛋白結(jié)合DNA的模式
3.4 VirB蛋白晶體學(xué)研究
3.5 VirB蛋白核心結(jié)構(gòu)域與DNA復(fù)合物的結(jié)構(gòu)
3.6 VirB蛋白體外結(jié)合DNA特性
3.7 VirB蛋白結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系
3.8 VirB蛋白R(shí)167氨基酸功能
4. 討論
4.1 VirB蛋白核心結(jié)構(gòu)域與質(zhì)粒分離蛋白ParB高度類似
4.2 VirB蛋白結(jié)構(gòu)核心結(jié)構(gòu)域C端螺旋束的功能
4.3 VirB蛋白核心結(jié)構(gòu)域結(jié)合box2生物學(xué)意義
4.4 VirB蛋白C端結(jié)構(gòu)域參與蛋白與DNA高分子復(fù)合物的組裝
4.5 VirB蛋白特異性和非特異性結(jié)合DNA
4.6 R167為VirB蛋白特異性識(shí)別DNA的重要氨基酸
5. 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷及發(fā)表文章
本文編號(hào):3970555
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【學(xué)位級(jí)別】:博士
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摘要
Abstract
引言
志賀氏菌致病機(jī)理
志賀氏菌致病的分子機(jī)制
志賀氏菌毒力大質(zhì);蚪M
志賀氏菌毒力大質(zhì)粒編碼蛋白
志賀氏菌毒力大質(zhì)粒的毒力調(diào)控
志賀氏菌T3SS
志賀氏菌T3SS的粘附和誘導(dǎo)
志賀氏菌T3SS誘導(dǎo)引發(fā)細(xì)菌侵襲
志賀氏菌細(xì)胞內(nèi)移動(dòng)和細(xì)胞間播散
總結(jié)
志賀氏菌毒力調(diào)控因子VirB蛋白研究進(jìn)展
VirB蛋白的主要結(jié)構(gòu)域
VirB蛋白轉(zhuǎn)錄調(diào)控的分子遺傳學(xué)基礎(chǔ)
VirB蛋白通過(guò)佶抗H-NS蛋白實(shí)現(xiàn)基因轉(zhuǎn)錄
VirB 同源蛋白 ParB,KorB,SopB 和 SpoOJ 結(jié)構(gòu)
VirB蛋白措抗H-NS的分子機(jī)制
總結(jié)
本課題研究擬解決科學(xué)問(wèn)題
本課題研究?jī)?nèi)容和意義
1. VirB蛋白結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究
2. VirB蛋白的生物物理及生物化學(xué)的研究
3. VirB蛋白的體內(nèi)細(xì)菌學(xué)研究
1. 材料
1.1 菌株
1.2 DNA
1.3 質(zhì)粒
1.4 常用試劑和耗材
1.5 常用溶液
1.6 常用儀器和設(shè)備
2. 方法
2.1 質(zhì)粒構(gòu)建
2.2 virB基因突變菌株的構(gòu)建
2.3 蛋白表達(dá)純化
2.4 硒代蛋白表達(dá)純化
2.5 熒光光譜實(shí)驗(yàn)
2.6 復(fù)合物的組裝
2.7 晶體的初篩
2.8 晶體優(yōu)化
2.9 晶體數(shù)據(jù)收集與結(jié)構(gòu)解析
2.10 凝膠阻滯實(shí)驗(yàn)
2.11 beta半乳糖苷酶活性測(cè)定
3. 結(jié)果
3.1 VirB蛋白同源于質(zhì)粒分離蛋白
3.2 蛋白表達(dá)和純化
3.3 VirB蛋白結(jié)合DNA的模式
3.4 VirB蛋白晶體學(xué)研究
3.5 VirB蛋白核心結(jié)構(gòu)域與DNA復(fù)合物的結(jié)構(gòu)
3.6 VirB蛋白體外結(jié)合DNA特性
3.7 VirB蛋白結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系
3.8 VirB蛋白R(shí)167氨基酸功能
4. 討論
4.1 VirB蛋白核心結(jié)構(gòu)域與質(zhì)粒分離蛋白ParB高度類似
4.2 VirB蛋白結(jié)構(gòu)核心結(jié)構(gòu)域C端螺旋束的功能
4.3 VirB蛋白核心結(jié)構(gòu)域結(jié)合box2生物學(xué)意義
4.4 VirB蛋白C端結(jié)構(gòu)域參與蛋白與DNA高分子復(fù)合物的組裝
4.5 VirB蛋白特異性和非特異性結(jié)合DNA
4.6 R167為VirB蛋白特異性識(shí)別DNA的重要氨基酸
5. 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
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本文編號(hào):3970555
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