本文關(guān)鍵詞：基于隱馬爾可夫模型對原核生物編碼序列的識別，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的探討隱馬爾可夫模型在大腸桿菌編碼序列識別中的應(yīng)用,為生物信息挖掘、致病位點研究提供方法參考。方法對大腸桿菌訓(xùn)練集數(shù)據(jù)進行訓(xùn)練建模,并對測試序列進行識別,用特異度、靈敏度以及精確度三個指標(biāo)進行評價。結(jié)果利用本試驗的方法識別編碼序列的靈敏度為73.33%,特異度為67.78%,精確度為70.56%。結(jié)論隱馬爾可夫模型能很好地模擬離散狀態(tài)間的轉(zhuǎn)換,適用于識別有狀態(tài)轉(zhuǎn)移、線性序列的數(shù)據(jù)。
【作者單位】： 山西醫(yī)科大學(xué)衛(wèi)生統(tǒng)計教研室;
【關(guān)鍵詞】： 隱馬爾可夫模型 編碼區(qū)序列識別 大腸桿菌
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項目(31071156)
【分類號】：Q93;Q78
【正文快照】： 隨著2003年人類基因組測序的完成,快速、準(zhǔn)確的基因注釋對進一步識別基因,解釋生命的起源和進化等具有重要的意義[1]�；蜃⑨尠ㄗR別出基因序列中的啟動子、編碼區(qū)、調(diào)控區(qū)等區(qū)域以及其他一些未被發(fā)現(xiàn)的功能片段,其關(guān)鍵問題是找出基因組中所有的基因,即基因識別過程[2]。其

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本文編號：384704