Epstein-Barr病毒(EBV)是一種普遍存在的人類皰疹病毒。EBV的基因組全長約為171Kb,包含至少86個開放性閱讀框。世界上大約90%的人口感染過EBV。EBV已經(jīng)被證實是淋巴瘤、鼻咽癌等多種惡性疾病重要的致病因子。EBV可以感染進入宿主細胞后編碼病毒蛋白,病毒蛋白可通過激活宿主細胞基因組原瘤基因表達、調(diào)節(jié)細胞周期蛋白,抑制細胞凋亡等不同機制作用于細胞,導致細胞惡性轉化及腫瘤形成。同時,EBV也可以整合進入宿主細胞基因組,引起宿主細胞基因組不穩(wěn)定性,并引起宿主細胞內(nèi)與一些癌基因和抑癌基因的異常表達。盡管EBV整合進入宿主細胞基因組已有報道,但是由于缺乏客觀、高效的研究技術去觀察EBV在宿主細胞全基因組的整合,目前我們對EBV的整合以及整合對宿主細胞基因組的影響還了解甚少。 Raji細胞和C666-1細胞分別是EBV陽性的淋巴瘤細胞系和鼻咽癌細胞系,它們是被全世界廣范使用的用來研究EBV和宿主相互作用的經(jīng)典細胞系。目前已經(jīng)有超過3000篇相關文獻使用了這2株細胞。另外,在Raji細胞中已經(jīng)有少量的整合位點通過傳統(tǒng)的實驗技術如基因組文庫構建、原位免疫熒光等被發(fā)現(xiàn)。為了觀察EBV...

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【學位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
目錄
英文縮寫注解
第一章 EBV在癌細胞基因組上的整合
    1.1 前言
    1.2 實驗材料和方法
        1.2.1 實驗材料
        1.2.2 主要實驗儀器
        1.2.3 主要試劑
        1.2.4 主要實驗方法
    1.3 實驗結果
        1.3.1 全基因組測序產(chǎn)出數(shù)據(jù)分析
        1.3.2 EBV整合位點檢測
        1.3.3 EBV整合對宿主基因組的影響
第二章 RAJI細胞和C666-1細胞中EBV基因組的變異和進化
    2.1 實驗方法
        2.1.1 C666-1和Raji細胞中EBV基因組的組裝
        2.1.2 EBV基因組分析
        2.1.3 EBV基因組中SNV的檢測
    2.2 結果
        2.2.1 C666-1和Raji細胞中EBV基因組及病毒基因進化比較分析
        2.2.2 C666-1和Raji細胞中EBV基因組及病毒基因SNV分析
第三章 鼻咽癌組織中EBV的整合和進化
    3.1 實驗材料和方法
        3.1.1 主要實驗材料
        3.1.2 主要儀器
        3.1.3 主要實驗方法
    3.2 結果
        3.2.1 EBV序列捕獲芯片測序數(shù)據(jù)分析
        3.2.2 18例鼻咽癌組織中EBV整合位點分析
        3.2.3 EBV相關鼻咽癌的EBV變異和進化分析
第四章 討論
總結
參考文獻
綜述
    參考文獻
攻讀學位期間主要的研究成果目錄
致謝



本文編號：3817738