Mmu-miR-124靶基因預(yù)測及通過GSK3B調(diào)控神經(jīng)發(fā)育的可能性:基于生物信息學(xué)和qPT-PCR分析
發(fā)布時(shí)間:2022-09-29 19:34
目的運(yùn)用生物信息學(xué)手段預(yù)測Mmu-miR-124靶基因,并進(jìn)一步揭示Mmu-miR-124在神經(jīng)發(fā)育中的作用。方法從StarBase數(shù)據(jù)庫中預(yù)測出Mmu-miR-124的潛在靶基因。運(yùn)用GO、Reactome通路、KEGG通路和PPI分析方法,對預(yù)測的靶基因的可能機(jī)制進(jìn)行分析。采用逆轉(zhuǎn)錄實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)技術(shù)驗(yàn)證神經(jīng)發(fā)育通路關(guān)鍵基因預(yù)測結(jié)果的可信度。結(jié)果 GO、KEGG與Reactome通路提示,Mmu-miR-124靶基因在軸突導(dǎo)向、長時(shí)程壓抑和鞘脂類代謝通路中發(fā)揮作用;PPI分析表明,GSK3B、NRAS和ITGB1是關(guān)鍵基因;qRT-PCR結(jié)果顯示,在神經(jīng)發(fā)育過程中Mmu-miR-124表達(dá)明顯升高,GSK3B表達(dá)略下降。結(jié)論 Mmu-miR-124通過調(diào)控靶基因廣泛參與多種生物學(xué)過程,Mmu-miR-124可能通過靶向GSK3B調(diào)控神經(jīng)發(fā)育。
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
Mmu-miR-124在基因組中所處的位置Fig.1ThelocationofMmu-miR-124inthegenome
靶點(diǎn)基因的Reactome通路Fig.2Reactomepathwayoftargetgenes
本文編號(hào):3683182
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Mmu-miR-124在基因組中所處的位置Fig.1ThelocationofMmu-miR-124inthegenome
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