目的運(yùn)用生物信息學(xué)手段預(yù)測(cè)Mmu-miR-124靶基因,并進(jìn)一步揭示Mmu-miR-124在神經(jīng)發(fā)育中的作用。方法從StarBase數(shù)據(jù)庫(kù)中預(yù)測(cè)出Mmu-miR-124的潛在靶基因。運(yùn)用GO、Reactome通路、KEGG通路和PPI分析方法,對(duì)預(yù)測(cè)的靶基因的可能機(jī)制進(jìn)行分析。采用逆轉(zhuǎn)錄實(shí)時(shí)熒光定量PCR（qRT-PCR）技術(shù)驗(yàn)證神經(jīng)發(fā)育通路關(guān)鍵基因預(yù)測(cè)結(jié)果的可信度。結(jié)果 GO、KEGG與Reactome通路提示,Mmu-miR-124靶基因在軸突導(dǎo)向、長(zhǎng)時(shí)程壓抑和鞘脂類代謝通路中發(fā)揮作用;PPI分析表明,GSK3B、NRAS和ITGB1是關(guān)鍵基因;qRT-PCR結(jié)果顯示,在神經(jīng)發(fā)育過(guò)程中Mmu-miR-124表達(dá)明顯升高,GSK3B表達(dá)略下降。結(jié)論 Mmu-miR-124通過(guò)調(diào)控靶基因廣泛參與多種生物學(xué)過(guò)程,Mmu-miR-124可能通過(guò)靶向GSK3B調(diào)控神經(jīng)發(fā)育。 

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【部分圖文】：

Mmu-miR-124在基因組中所處的位置Fig.1ThelocationofMmu-miR-124inthegenome

靶點(diǎn)基因的Reactome通路Fig.2Reactomepathwayoftargetgenes


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