目的:利用生物信息學(xué)方法對小鼠NFATc1及相關(guān)蛋白功能進行預(yù)測與分析,為探討NFATc1生物學(xué)功能及作用機制提供借鑒。方法:利用在線數(shù)據(jù)庫STRING,選取系統(tǒng)打分高于0.800的20種蛋白質(zhì)與NFATc1構(gòu)建蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖,并對該蛋白集合進行后續(xù)分析;采用DAVID在線分析工具對以上蛋白進行GO功能富集和KEGG信號通路分析。結(jié)果:GO富集分析顯示,該蛋白集合參與CaN/NFAT信號通路、轉(zhuǎn)錄正調(diào)控、JUN蛋白磷酸化、基因表達正調(diào)控等生物學(xué)過程。具體分子功能主要是結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子、鈣依賴蛋白絲氨酸/蘇氨酸磷酸酶活性、JUN蛋白激酶活性及RNA聚合酶Ⅱ核心啟動子近端序列特異性結(jié)合DNA等;KEGG信號通路分析顯示,該蛋白集合主要富集于破骨細胞分化代謝、Wnt信號通路、T細胞受體信號通路、B細胞受體信號通路等。結(jié)論:NFATc1及其相關(guān)蛋白生物學(xué)功能具有廣泛性,其原因可能與參與多種細胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路相關(guān)。 

【文章頁數(shù)】：4 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
2 結(jié)果
    2.1 構(gòu)建蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)圖
    2.2 GO富集分析
    2.3 KEGG信號通路分析
3 討論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]核因子κB受體活化因子通過TRPC6?NFATc1信號通路介導(dǎo)足細胞損傷[J]. 張鴻,梁順,杜玥,竇曹帥,張麗,談錦萍,劉雙信,梁馨苓,章斌.  實用醫(yī)學(xué)雜志. 2019(01)
[2]NFATc1對裸鼠上皮性卵巢癌移植瘤脈管生成的影響[J]. 龍麗,段趙寧,蔡海貝,唐良萏.  中國病理生理雜志. 2016(02)



本文編號：3646908