基于MassARRAY的人多瘤病毒高通量檢測方法的建立與應用
發(fā)布時間:2017-05-11 23:00
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【摘要】:人多瘤病毒(human polyomaviruses, HPyVs)是一種在人體里廣泛存在的病毒。早期的人多瘤病毒家族只有BK多瘤病毒(BK polyomavirus, BKPyV)和JC多瘤病毒(JC polyomavirus, JCPyV)兩個成員,因其可在免疫功能不全的個體分別造成多瘤病毒腎炎和進行性多灶性白質腦病而被人們所關注。過去七年里,10種新型人多瘤病毒陸續(xù)被發(fā)現(xiàn),其中除可引發(fā)默克細胞癌的默克細胞多瘤病毒(Merkel cell polyomavirus, MCPyV)及可引發(fā)Trichodysplasia spinulosa的TS多瘤病毒(Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus, TSPyV)外,其余病毒的病原學角色均尚不明確。人多瘤病毒頻繁在人糞便和胃腸道組織中被檢出,特別是人多瘤病毒中最新的三個成員MW多瘤病毒(Malawi polyomavirus, MWPyV),STL多瘤病毒(Saint Louis polyomavirus, STLPyV)和人多瘤病毒12型(Human polyomavirus12, HPyV12)最初均被發(fā)現(xiàn)于糞便或消化系統(tǒng)器官組織中,這使得人多瘤病毒與人體胃腸道疾病,尤其是腹瀉的關系引起人們關注。 本研究應用美國西格諾公司的基質輔助激光解析串聯(lián)飛行時間質譜儀(MALDI-TOFMS)檢測平臺(MassARRAY),建立了一種基于多重PCR的高通量檢測方法,可同時檢測全部12種已知的人多瘤病毒。本實驗運用該方法進行病例-對照研究,篩查了包含211份嬰幼兒腹瀉病人樣本和208份正常嬰幼兒樣本在內的總計419份糞便樣本。本研究在樣本中篩查到五種人多瘤病毒:KI多瘤病毒(KI polyomavirus, KIPyV), WU多瘤病毒(WU Polyomavirus, WUPyV), MCPyV, MWPyV和STLPyV。結果顯示人多瘤病毒在病例組和對照組中的檢出率差異沒有顯著性;兩組中MWPyV的病毒載量差異沒有顯著性(p0.05);研究結果不支持人多瘤病毒作為腹瀉相關病原體的猜測。此外,本研究獲得了16條人多瘤病毒的全基因組序列,其中KIPyV,MCPyV, MWPyV和STLPyV的全基因組序列均為國內首次報道。本研究為深入開展人多瘤病毒的病原學研究和基因組進化提供了依據(jù)。
【關鍵詞】:人多瘤病毒 腹瀉 基質輔助激光解析電離飛行時間質譜 MassARRAY
【學位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學院
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R373
【目錄】:
- 目錄3-4
- 摘要4-5
- Abstract5-6
- 前言6-9
- 材料與方法9-24
- 1. 樣本9
- 2. 儀器9-10
- 3. 耗材10-11
- 4. 試劑與試劑盒11
- 5. 試劑配置11
- 6. 方法11-24
- 結果24-46
- 1. 基于MassARRAY的人多瘤病毒檢測方法的特異性與敏感度驗證24-26
- 2. 十二種人多瘤病毒與嬰幼兒腹瀉的相關性研究26-46
- 討論46-50
- 文獻綜述50-61
- 1. 新型人多瘤病毒發(fā)現(xiàn)史概述50-56
- 2. 新人多瘤病毒與相關疾病研究進展56-61
- 參考文獻61-68
- 碩士期間發(fā)表文章68-69
- 致謝69-71
【共引文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前4條
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中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前3條
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本文關鍵詞:基于MassARRAY的人多瘤病毒高通量檢測方法的建立與應用,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
,本文編號:358217
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