霍亂弧菌溶源性噬菌體CTXΦ攜帶霍亂毒素基因ctxAB,通過其結(jié)構(gòu)基因gⅢ編碼產(chǎn)生的PⅢ蛋白識別霍亂弧菌毒素共調(diào)菌毛（toxin co-regulated pilus, TCP）的主要結(jié)構(gòu)亞單位TcpA,從而感染具有TCP的霍亂弧菌,使之成為產(chǎn)毒菌株。CTXΦ還有不攜帶ctxAB的前體pre-CTXΦ,根據(jù)CTXΦ基因組中調(diào)控基因rstR序列型不同,可分成不同的型別。在不同霍亂弧菌菌株的基因組中,已發(fā)現(xiàn)CTXΦ/pre-CTXΦ基因組及其亞型的多種組合排列方式。研究該噬菌體家族的基因組多樣性,能夠分析其進化及在霍亂弧菌產(chǎn)毒株形成中的作用。本研究發(fā)現(xiàn)了4株O1和O139群霍亂弧菌非產(chǎn)毒株具有pre-CTXΦ基因組及多樣的rstR序列型,進一步對pre-CTXΦ在4株菌株中的基因組特征進行了分析。利用第3代基因測序法（短讀長測序技術(shù)和單分子長讀長測序技術(shù)）,獲得了4株菌株的基因組序列。利用長讀長測序和拼接分析,精確地獲得了具有長片段重復(fù)序列結(jié)構(gòu)的pre-CTXΦ基因組排列,明確了4株測序菌株中多樣的pre-CTXΦ基因組排列。在非產(chǎn)毒株基因組菌株VC3193中發(fā)現(xiàn)了攜帶古典型pre-CTX... 

【文章來源】：微生物與感染. 2019,14(04)

【文章頁數(shù)】：9 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 菌株和染色體DNA提取
    1.2 基因組框架圖測定
    1.3 基因組完成圖測定
    1.4 pre-CTXΦ基因組序列的獲取
    1.5 tcpA和gⅢ進化樹的構(gòu)建及比較
2 結(jié)果
    2.1 基因組測序及與產(chǎn)毒流行株的進化關(guān)系
    2.2 4株非產(chǎn)毒菌株染色體上的pre-CTXΦ基因組結(jié)構(gòu)
    2.3 非產(chǎn)毒株pre-CTXΦ的受體識別蛋白PⅢ及所在菌株的感染受體TcpA序列的多樣性
3 討論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]霍亂弧菌JS9803株CTXEI Torφ和nct-CTXnewO139φ基因組克隆、測序及序列分析[J]. 芮勇宇,闞飆,高守一,劉延清,祁國明.  熱帶醫(yī)學(xué)雜志. 2006(08)
[2]O139群霍亂弧菌染色體中整合兩種CTXΦ前噬菌體基因組的多樣性[J]. 陳愛平,闞飆,陳拱立,陳亢川,劉延清.  中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2002(03)
[3]霍亂弧菌中存在不含霍亂毒素基因的噬菌體CTXΦ基因組[J]. 闞飆,祁國明,劉延清,劉彩蓮,高守一.  中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 1999(03)



本文編號：3480837