近年來,柯薩奇病毒A組10型（Coxsackievirus A10,CV-A10）逐漸成為手足口病（Hand,foot and mouth disease,HFMD）最重要的病原體之一。相比腸道病毒A組71型（Enterovirus 71,EV-A71）,CV-A10尚未有上市的疫苗,其構(gòu)象表位也缺乏系統(tǒng)性研究。本研究利用實驗室發(fā)展的人腸道病毒構(gòu)象表位的生物信息學(xué)預(yù)測算法,對CV-A10的構(gòu)象表位進行系統(tǒng)性預(yù)測。結(jié)果顯示:45個氨基酸殘基聚集成三簇構(gòu)象表位:site 1、site 2和site 3。site 1位于病毒衣殼表面峽谷的北側(cè),site 2和site 3位于峽谷南側(cè),三者呈現(xiàn)"品"字形分布。site 2和site 3與已報道的兩個表位2G8和VP2-P28高度重疊,說明預(yù)測結(jié)果具有較高準確性。鼻病毒B種14型（Rhinovirus B14,RV-B14）、脊髓灰質(zhì)炎病毒1型（Poliovirus type 1,PV1）和CV-A10同屬于人腸道病毒。已有研究表明,RVB14和PV1的抗原表位也呈三簇分布,且每一簇都與CV-A10的預(yù)測結(jié)果高度重疊。這既說明了預(yù)測結(jié)果的準確性,... 

【文章來源】：病毒學(xué)報. 2019,35(05)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【文章目錄】：
材料與方法
    1 CV-A10結(jié)構(gòu)蛋白的一級結(jié)構(gòu)、二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)的特征分析
    2 CV-A10構(gòu)象表位的生物信息學(xué)預(yù)測算法
        2.1選擇代表株和PDB文件
        2.2構(gòu)建CV-A10結(jié)構(gòu)蛋白的復(fù)合鏈
        2.3計算病毒衣殼相對暴露面
        2.4以復(fù)合鏈為基礎(chǔ)，利用投票法預(yù)測CV-A10構(gòu)象表位
    3預(yù)測準確性分析
結(jié)果
    1 CV-A10結(jié)構(gòu)蛋白的一級結(jié)構(gòu)、二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)的基本特征
    2 CV-A10構(gòu)象表位的預(yù)測結(jié)果
    3構(gòu)象表位的預(yù)測準確性
討論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]基于RIVEM的人腸道病毒衣殼表面結(jié)構(gòu)繪制流程[J]. 高柳鶯,戎浩,祝苗,董長征.  病毒學(xué)報. 2018(05)
[2]人腸道病毒71型抗原表位的研究進展[J]. 祝苗,張?zhí)矸?高柳鶯,董長征.  中國細胞生物學(xué)學(xué)報. 2017(09)



本文編號：3388353