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結(jié)核分枝桿菌非編碼RNA的系統(tǒng)發(fā)現(xiàn)和鑒定

發(fā)布時間:2021-08-08 16:18
  結(jié)核病(Tuberculosis,TB)仍然是世界性的公共衛(wèi)生學難題,其病原體是古老而進化很成功的結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis),簡稱結(jié)核桿菌。結(jié)核桿菌在感染宿主的過程中,為了適應宿主各種復雜的微環(huán)境,進化了能快速調(diào)節(jié)基因表達和轉(zhuǎn)換不同生理狀態(tài)來適應不利環(huán)境的特殊機制,這種調(diào)節(jié)機制在轉(zhuǎn)錄水平研究的較多,而轉(zhuǎn)錄后的調(diào)控機制研究卻非常少。非編碼RNA(non-coding RNAs,ncRNAs)在生物體的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控中發(fā)揮了重要作用,它們是一類不翻譯成蛋白質(zhì)的RNA分子,廣泛存在于各種生物中,幾乎在所有生理和病理過程中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。細菌ncRNAs不僅可以幫助細菌應對復雜的環(huán)境變化,也可以調(diào)節(jié)一些毒力基因的表達,影響細菌對人類的致病性。因此研究結(jié)核桿菌的ncRNAs對于了解TB的致病機制具有十分重要的意義,而系統(tǒng)地發(fā)現(xiàn)和鑒定結(jié)核桿菌的ncRNAs分子,是開展所有后續(xù)研究的基礎和前提。本課題采用最新的RNA測序(RNA-seq)方法,對構(gòu)建的對數(shù)生長期結(jié)核桿菌標準株H37Rv四個不同長度的cDNA文庫進行測序,結(jié)果發(fā)現(xiàn)結(jié)核桿菌中存在大量的ncRN... 

【文章來源】:北京市結(jié)核病胸部腫瘤研究所北京市

【文章頁數(shù)】:107 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

結(jié)核分枝桿菌非編碼RNA的系統(tǒng)發(fā)現(xiàn)和鑒定


核糖開關的基本組成和調(diào)控機理

序列,調(diào)節(jié)功能


圖 1-2 CRISPR RNAs 的結(jié)構(gòu)和調(diào)節(jié)功能(此圖引自[26])黑色三角為“重復”序列,黑色三角中間紅色盒為“間區(qū)”序列文的選題與研究目的核桿菌在感染宿主的過程中,為了生存必須適應宿主各種復雜的了能調(diào)節(jié)基因表達和轉(zhuǎn)換不同生理狀態(tài)來適應不利環(huán)境的特殊機菌的活躍繁殖狀態(tài)、非復制的潛伏狀態(tài)以及不同狀態(tài)的轉(zhuǎn)換。結(jié)境變化的轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控已經(jīng)采用 RT-PCR、芯片雜交等方法進行了0],不同生長條件下的調(diào)節(jié)因子得到了鑒定[51, 52],各種 sig控元件、絲氨酸-蘇氨酸蛋白激酶、以及各種轉(zhuǎn)錄因子也逐步明關結(jié)核桿菌轉(zhuǎn)錄起始后的調(diào)控作用卻很少有人關注,這些過程通涉及了轉(zhuǎn)錄、翻譯以及 mRNA 穩(wěn)定性的改變。

樣本,凝膠電泳,實驗結(jié)果,箭頭


RNA尿素變性6%PAGE凝膠電泳1泳道是總RNA,2泳道是總RNA去除rRNA后,箭頭位置為23S和16SrRNA


本文編號:3330277

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