SARS冠狀病毒檢測寡核苷酸基因芯片的研制及應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-07-28 10:33
SARS冠狀病毒(SARS-CoV)感染所引起的嚴(yán)重急性呼吸綜合征(SARS),2003年冬春之際在我國以及世界上多個(gè)國家和地區(qū)的爆發(fā)流行,對(duì)人類健康、經(jīng)濟(jì)發(fā)展和社會(huì)穩(wěn)定造成了嚴(yán)重的危害。早期、快速、準(zhǔn)確的診斷,對(duì)于SARS的預(yù)防和隔離至關(guān)重要。目前常用的診斷措施包括病毒分離培養(yǎng)、免疫學(xué)方法、基于PCR的檢測技術(shù)等等,但分別存在難以早期診斷、敏感度低、實(shí)施困難或假陽性高等缺陷。本課題研究采用基因芯片技術(shù),探索對(duì)SARS冠狀病毒感染的早期、敏感、準(zhǔn)確和快速檢測。 基因芯片是近年來興起的基因檢測新技術(shù)。特別是最近迅速發(fā)展的長鏈寡核苷酸基因芯片技術(shù)(60-70 mer Oligo Microarray),為從基因水平高度特異性的檢測SARS-CoV提供了可能。本研究還采用一種全基因組的標(biāo)記方法,與基因芯片檢測的大規(guī)模、高通量特性相配合,為基因芯片在臨床診斷中的應(yīng)用做出了貢獻(xiàn)。 本研究首先確立了長鏈寡核苷酸基因芯片實(shí)驗(yàn)的基本條件,通過采用幾種不同的基質(zhì)材料進(jìn)行點(diǎn)樣雜交,以獲得最適合長鏈寡核苷酸點(diǎn)樣的片基材料以及最適的點(diǎn)樣濃度和特異性。進(jìn)而確定了用于寡核苷酸芯片雜交檢測所需要的最佳探...
【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:99 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
種不同玻片固定率檢測結(jié)果
玻片為固定率以及雜交后信噪比最高的片基材料。abCd圖1一14種不同玻片固定率檢測結(jié)果Fig.l一1Resultofirnrnobili乙時(shí)ionratioexPerimentof4differentslidesa.pely一L一lysineeoatedslideb.Co而ngCMT-GAPSslidee.U一Version01190slided.TelechemSuPerAmineslide圖1一2四種不同玻片固定率檢測熒光強(qiáng)度、信號(hào)強(qiáng)度、背景值Fig.1一2Floreseentdensity,signalandbaekgroundofirnrnobiliZationratioexPerimentof4differentslidese.poly一L一lysineeoatedslideb.Co而ngCMT-GAPSslidee.U一Version01190slided.TeleehemSuPe。勺rnineslide
度探針點(diǎn)樣的pely一L一lysine處理玻片固定率檢測結(jié)果濃度分ZlJ為0.25林g/林L,0.5林g/林L,l林g/卜L,1.5林g/林L,2林g/卜L,2.5林留匹的70mer寡核普酸探針點(diǎn)樣后雜交后結(jié)果如圖1一3所示,探針濃度與熒光強(qiáng)度的相關(guān)關(guān)系曲線如圖1一所示。由圖中可以看出用poly一L一lysine做片基,探針的固定率有隨探針濃度增加而升高的趨勢,探針濃度在1林歲林L以下時(shí),固定率非常低,在1林歲林L~2.5林創(chuàng)林L之間時(shí),固定率顯著升高,并隨探針濃度的遞增呈逐步升高,在2.5抖留林L左右基本達(dá)到飽和。def圖1一36種不同濃度探針點(diǎn)樣固定率檢測結(jié)果Fig.l一3Hybridizationresultsof而eroaJ汀aysPriniedby6differentProbeeoncentrationa.2.5林g/林Lb.2抖g/林L,e.1.5林g/林L,d.1林g/林L,e.0.5林g/林L
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]SARS患者及其醫(yī)護(hù)人員血中特異IgG抗體變化規(guī)律的初步研究[J]. 徐國賓,陸海英,李杰,李勇華,馮珍如,霍娜,王廣發(fā),趙振東,張國華,閆存玲,李海霞,高曉明,徐小元,王貴強(qiáng),莊輝. 北京大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2003(S1)
[2]嚴(yán)重急性呼吸綜合征病毒的形態(tài)與發(fā)生[J]. 廣東省防治非典型肺炎科技攻關(guān)專題組,張勤奮,崔金明,黃小俊,林偉,譚冬艷,徐潔薇,楊藝峰,張景強(qiáng),張欣,李暉,鄭煥英,陳秋霞,鄭夔,鄢心革,萬卓越,黃吉城. 廣東醫(yī)學(xué). 2003(S1)
[3]SARS病變組織細(xì)胞凋亡檢測及其意義[J]. 張慶玲,丁彥青,賀莉,王蔚,張進(jìn)華,王慧君,蔡俊杰,耿艦,陸藥丹,羅元龍. 第一軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2003(08)
[4]五種SARS冠狀病毒-IgG抗體檢測試劑的比較[J]. 萬卓越,李杰,謝展鴻,鄢心革,張欣,李暉,周惠瓊,黃平,方苓,陳秋霞. 華南預(yù)防醫(yī)學(xué). 2003(04)
[5]嚴(yán)重急性呼吸綜合征患者血清中SARS相關(guān)抗體的特異性研究[J]. 趙軍,陳昊,鄭宇,李伯安,何衛(wèi)平,李靖,高蓉,程云. 第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2003(06)
[6]用于SARS冠狀病毒檢測的60mer寡核苷酸基因芯片的設(shè)計(jì)及應(yīng)用[J]. 石嶸,馬文麗,吳清華,張寶,宋艷斌,郭秋野,肖維威,王艷,鄭文嶺. 科學(xué)通報(bào). 2003(12)
[7]嚴(yán)重急性呼吸綜合征的病理改變[J]. 陳詠儀,鄭堅(jiān),王瑞琳,杜家輝,謝文杰,羅穎業(yè),許伯均. 中華病理學(xué)雜志. 2003(03)
[8]廣東省傳染性非典型肺炎病例的SARS冠狀病毒分離株的分子生物學(xué)鑒定[J]. 陳秋霞,黃吉城,鄭夔,周惠瓊,鄭煥英,鄢心革,黃平,刁麗梅,張萬里,陳經(jīng)雕. 華南預(yù)防醫(yī)學(xué). 2003(03)
[9]間接免疫熒光抗體試驗(yàn)在傳染性非典型肺炎診斷中的應(yīng)用[J]. 方立群,張泮河,楊寶安,吳曉明,趙秋敏,劉瑋,劉洪,鄧永強(qiáng),詹琳,韓偉國,呂富雙,吳勁松,楊紅,祝慶余,曹務(wù)春. 中華流行病學(xué)雜志. 2003(06)
[10]反轉(zhuǎn)錄巢式PCR方法檢測SARS冠狀病毒[J]. 王艷,馬文麗,宋艷斌,肖維威,張寶,黃海,王洪敏,馬曉冬,鄭文嶺. 第一軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2003(05)
本文編號(hào):3307749
【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:99 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
種不同玻片固定率檢測結(jié)果
玻片為固定率以及雜交后信噪比最高的片基材料。abCd圖1一14種不同玻片固定率檢測結(jié)果Fig.l一1Resultofirnrnobili乙時(shí)ionratioexPerimentof4differentslidesa.pely一L一lysineeoatedslideb.Co而ngCMT-GAPSslidee.U一Version01190slided.TelechemSuPerAmineslide圖1一2四種不同玻片固定率檢測熒光強(qiáng)度、信號(hào)強(qiáng)度、背景值Fig.1一2Floreseentdensity,signalandbaekgroundofirnrnobiliZationratioexPerimentof4differentslidese.poly一L一lysineeoatedslideb.Co而ngCMT-GAPSslidee.U一Version01190slided.TeleehemSuPe。勺rnineslide
度探針點(diǎn)樣的pely一L一lysine處理玻片固定率檢測結(jié)果濃度分ZlJ為0.25林g/林L,0.5林g/林L,l林g/卜L,1.5林g/林L,2林g/卜L,2.5林留匹的70mer寡核普酸探針點(diǎn)樣后雜交后結(jié)果如圖1一3所示,探針濃度與熒光強(qiáng)度的相關(guān)關(guān)系曲線如圖1一所示。由圖中可以看出用poly一L一lysine做片基,探針的固定率有隨探針濃度增加而升高的趨勢,探針濃度在1林歲林L以下時(shí),固定率非常低,在1林歲林L~2.5林創(chuàng)林L之間時(shí),固定率顯著升高,并隨探針濃度的遞增呈逐步升高,在2.5抖留林L左右基本達(dá)到飽和。def圖1一36種不同濃度探針點(diǎn)樣固定率檢測結(jié)果Fig.l一3Hybridizationresultsof而eroaJ汀aysPriniedby6differentProbeeoncentrationa.2.5林g/林Lb.2抖g/林L,e.1.5林g/林L,d.1林g/林L,e.0.5林g/林L
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]SARS患者及其醫(yī)護(hù)人員血中特異IgG抗體變化規(guī)律的初步研究[J]. 徐國賓,陸海英,李杰,李勇華,馮珍如,霍娜,王廣發(fā),趙振東,張國華,閆存玲,李海霞,高曉明,徐小元,王貴強(qiáng),莊輝. 北京大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2003(S1)
[2]嚴(yán)重急性呼吸綜合征病毒的形態(tài)與發(fā)生[J]. 廣東省防治非典型肺炎科技攻關(guān)專題組,張勤奮,崔金明,黃小俊,林偉,譚冬艷,徐潔薇,楊藝峰,張景強(qiáng),張欣,李暉,鄭煥英,陳秋霞,鄭夔,鄢心革,萬卓越,黃吉城. 廣東醫(yī)學(xué). 2003(S1)
[3]SARS病變組織細(xì)胞凋亡檢測及其意義[J]. 張慶玲,丁彥青,賀莉,王蔚,張進(jìn)華,王慧君,蔡俊杰,耿艦,陸藥丹,羅元龍. 第一軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2003(08)
[4]五種SARS冠狀病毒-IgG抗體檢測試劑的比較[J]. 萬卓越,李杰,謝展鴻,鄢心革,張欣,李暉,周惠瓊,黃平,方苓,陳秋霞. 華南預(yù)防醫(yī)學(xué). 2003(04)
[5]嚴(yán)重急性呼吸綜合征患者血清中SARS相關(guān)抗體的特異性研究[J]. 趙軍,陳昊,鄭宇,李伯安,何衛(wèi)平,李靖,高蓉,程云. 第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2003(06)
[6]用于SARS冠狀病毒檢測的60mer寡核苷酸基因芯片的設(shè)計(jì)及應(yīng)用[J]. 石嶸,馬文麗,吳清華,張寶,宋艷斌,郭秋野,肖維威,王艷,鄭文嶺. 科學(xué)通報(bào). 2003(12)
[7]嚴(yán)重急性呼吸綜合征的病理改變[J]. 陳詠儀,鄭堅(jiān),王瑞琳,杜家輝,謝文杰,羅穎業(yè),許伯均. 中華病理學(xué)雜志. 2003(03)
[8]廣東省傳染性非典型肺炎病例的SARS冠狀病毒分離株的分子生物學(xué)鑒定[J]. 陳秋霞,黃吉城,鄭夔,周惠瓊,鄭煥英,鄢心革,黃平,刁麗梅,張萬里,陳經(jīng)雕. 華南預(yù)防醫(yī)學(xué). 2003(03)
[9]間接免疫熒光抗體試驗(yàn)在傳染性非典型肺炎診斷中的應(yīng)用[J]. 方立群,張泮河,楊寶安,吳曉明,趙秋敏,劉瑋,劉洪,鄧永強(qiáng),詹琳,韓偉國,呂富雙,吳勁松,楊紅,祝慶余,曹務(wù)春. 中華流行病學(xué)雜志. 2003(06)
[10]反轉(zhuǎn)錄巢式PCR方法檢測SARS冠狀病毒[J]. 王艷,馬文麗,宋艷斌,肖維威,張寶,黃海,王洪敏,馬曉冬,鄭文嶺. 第一軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2003(05)
本文編號(hào):3307749
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