非O1/O139群霍亂弧菌廣泛的分布于自然界,尤其是水體及海產(chǎn)品中,可引起霍亂樣腹瀉的散發(fā)和局部暴發(fā)。然而,到目前為止,還缺少針對非O1/O139群霍亂弧菌的分子檢測方法：同時,非O1/O139群霍亂弧菌的環(huán)境分離株中,毒力相關(guān)基因的分布特征及菌株之間的種群關(guān)系并不清楚。針對以上問題,我們對非O1/O139群霍亂弧菌進(jìn)行了以下方面的研究。首先,我們建立了檢測非O1/O139群霍亂弧菌的多重PCR和SYBR Green實時PCR方法。根據(jù)特異性條帶（多重PCR）和特異性熔解溫度（SYBR Green實時PCR）,兩種方法均能特異地檢測非O1/O139群霍亂弧菌,并且能將霍亂弧菌從其它弧菌（5種）和腸道桿菌（3種）中鑒別出來；兩種方法的檢測下限分別為7×104cfu/ml（多重PCR）和7×102cfu/ml （SYBR Green實時PCR）,且檢測下限有統(tǒng)計學(xué)差異（P<0.05）；對實時PCR的重復(fù)性檢測,批內(nèi)變異系數(shù)（CV）的范圍是0.22%～0.92%,批間變異系數(shù)的范圍是0.27%～1.41%；經(jīng)370株非O1/O139群霍亂弧菌的檢測,兩種方法的一致性均為100%。其次,... 

【文章來源】：中國疾病預(yù)防控制中心北京市

【文章頁數(shù)】：90 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

非01/0139群霍亂弧菌中COeB的氨基酸序列比對結(jié)果

菌株和１６株ＶＳＰ－Ｉ／ＩＩ陽性菌株，散布在最小生成樹的各個部分，分屬于不同的ＳＴｓ。??需要強(qiáng)調(diào)的是，除了兩株０１３９群非產(chǎn)毒株，盡管分離年代和地區(qū)都不同，其余??不同ＳＴｓ的０１３９非產(chǎn)毒株組成了一個與０１３９產(chǎn)毒株不同的克隆簇（見圖１０）。??ｎｎｊｕｊ?—??ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ??／?－＊■?９?／?０１，ｃｔｘＢ?－．ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ??■■?０１３９?．ｃｔｘＳ＋巧?ｆｅｒｅｎｃｏ??！?０１３９．ｃｔｘＢ＊．ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ??ｊＴ＊?Ｎｏｎ＊０１／０１３９．ｃｔｘＢ＊?．ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ??ｖＭ?畫圓Ｉ?Ｎｏｎ＊０１／０１?泌，ｃｂＢ．．ｒｅｆｅ巧ｎｅｅ??９?參說別?Ｎｏｎ－０１／０１３９．ｃｔｘＢ＋．ｔｅｓｔ??／?Ｉ?！?Ｎｏｎ＇０１／〇，３９，ｉ：ｂ（Ｂ－化到??驚呼峰裘??＾．１／??若＼｜?／?一…?遂－??，?ｌＡＭ?．－Ｗ??／?，?…皆’?？?…??參、＜?二；、…??恣?Ｗ?一。，??注：圖中毎一個圓代表一個ＳＴ，圓的面積反應(yīng)菌株的數(shù)量，陰影部分代表一個簇。線段的長短代表不同ＳＴｓ之間位??點數(shù)量的不同

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]實時聚合酶鏈反應(yīng)檢測O1群和O139群霍亂弧菌方法的建立及應(yīng)用[J]. 王曉梅,王多春,譚海玲,鐘豪杰,陳經(jīng)雕,李柏生,柯昌文,閆梅英,張靜,闞飆.  中華流行病學(xué)雜志. 2007(08)
[2]廣州海珠地區(qū)非O1/非O139群霍亂弧菌流行狀況調(diào)查及生物學(xué)特征研究[J]. 許少洪,李映霞,李少彤,吳琪,孫鳳琪,黃芳,曾愛芳.  中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2010 (12)



本文編號：3244352