結核分枝桿菌PPE37蛋白對RAW264.7巨噬細胞NF-κB、TNF-α、IL-6mRNA表達的影響
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【摘要】:目的結核分枝桿菌全基因組測序完成后,研究者發(fā)現(xiàn)PE和PPE家族基因占結核分枝桿菌編碼區(qū)的10%,并且在致病分枝桿菌與非致病的分枝桿菌中存在差異表達。PPE家族中的PPE37蛋白同時位于結核分枝桿菌毒力有關的RD區(qū)。本論文研究PPE37蛋白在結核分枝桿菌感染機體過程中發(fā)揮的免疫調節(jié)機制。 方法1.利用生物信息學軟件(uniprot、protparam、GOR4、SignaIP4.1、Bcepred、NetMHC3.2Server)分析PPE37蛋白的理化性質、二級結構及其B細胞/T細胞抗原表位等結構特征,從而預測PPE37蛋白在結核分枝桿菌感染機體過程中發(fā)揮的免疫調控機制。 2.根據Gene Bank中登錄的ppe37基因序列(序列號BX842578),設計(primerpremier5軟件)并合成其引物。利用基因工程技術構建重組克隆載體pEasy E2-ppe37,經PCR、雙酶切、基因測序證實無誤后,克隆至表達載體pET30a。重組表達載體pET30a-ppe37經IPTG誘導表達后,利用SDS-PAGE、Western blot分析其表達形式。利用Ni-NTA瓊脂糖柱對表達蛋白進行純化,并通過AlpHaImager2200軟件分析其純化率。 3.建立重組PPE37蛋白(濃度為100ng/mL、500ng/mL、5000ng/mL)刺激小鼠RAW264.7巨噬細胞模型,在24h、48h、72h分別收集細胞,提取總RNA,利用反轉錄引物反轉錄為cDNA。建立1000ng/mLLPS刺激巨噬細胞模型作為陽性對照組。利用基因工程技術構建細胞因子NF-κB、TNF-α、IL-6的標準質粒,并繪制標準曲線。利用Real-Time PCR檢測上述各個組NF-κB、TNF-α、IL-6mRNA的表達量。 結果1.生物信息軟件分析證實PPE37蛋白結構穩(wěn)定、親水性強、無信號肽。在線軟件Bcepred顯示PPE37蛋白的B細胞優(yōu)勢抗原表位區(qū)域為191-192;288-294;332-336;376-387。在線軟件NetMHC3.2Server顯示PPE37蛋白的T細胞優(yōu)勢抗原表位區(qū)域為0-9;144-153;156-165;239-248。這些結果證明PPE37蛋白在結核分枝桿菌感染機體過程中能被B細胞/T細胞識別,從而發(fā)揮免疫調控機制。 2.經PCR、雙酶切、基因測序證實成功構建重組表達載體pET30a-ppe37。將其轉化到E.coli BL21中,,經IPTG誘導,重組蛋白以包涵體的形式大量表達。利用AlpHaImager2200軟件分析經Ni-NTA瓊脂糖柱純化后的重組蛋白純化率為96.2%。 3.通過檢測細胞因子NF-κB、TNF-α、IL-6mRNA表達量的變化,來觀察PPE37蛋白對小鼠RAW264.7巨噬細胞的免疫學效應。濃度分別為100ng/mL、500ng/mL、5000ng/mL的重組蛋白刺激巨噬細胞,24h后Real-Time PCR檢測結果顯示與空白對照組相比NF-κB、TNF-αmRNA的表達沒有影響(p0.05),而IL-6mRNA的表達上調(p0.05);48h后NF-κB、TNF-α、IL-6mRNA的表達顯著上調(p0.05);72h后NF-κB、TNF-α、IL-6mRNA的表達顯著上調(p0.05)。1000ng/ml LPS刺激巨噬細胞,24h、48h、72h均能使NF-κB、TNF-α、IL-6mRNA的表達顯著上調(p0.05)。這些差異表達證實ppe37蛋白能引起的巨噬細胞免疫應答反應。 結論在結核分枝桿菌感染機體的過程中PPE37蛋白能夠被B細胞、T細胞識別,從而發(fā)揮相應的體液免疫、細胞免疫反應。與此同時PPE37蛋白也可以通過調控細胞因子NF-κB、TNF-α、IL-6的表達引起巨噬細胞免疫應答反應?傊,PPE37蛋白在結核分枝桿菌感染機體的過程中發(fā)揮重要的免疫學效應。
【關鍵詞】:結核分枝桿菌 PPE37蛋白 RAW264.7巨噬細胞
【學位授予單位】:寧夏醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2013
【分類號】:R378.911
【目錄】:
- 摘要5-7
- ABSTRACT7-12
- 前言12-14
- 第一部分 PPE37 蛋白的生物信息學分析以及重組原核表達載體構建14-26
- 材料與方法14-22
- 實驗材料14-15
- 實驗方法15-22
- 實驗結果22-26
- 第二部分 重組 PPE37 蛋白的原核表達與純化26-33
- 材料與方法26-31
- 實驗材料26-27
- 實驗方法27-31
- 實驗結果31-33
- 第三部分 重組 PPE37 蛋白與巨噬細胞相互作用的研究33-43
- 材料與方法33-38
- 實驗材料33-34
- 實驗方法34-38
- 實驗結果38-43
- 討論43-46
- 結論46-47
- 參考文獻47-51
- 附錄51-59
- 文獻綜述59-72
- 參考文獻65-72
- 致謝72-73
- 攻讀學位期間發(fā)表的學術論文73-74
- 個人簡歷74
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