丙型肝炎病毒部分蛋白區(qū)段T、B淋巴細(xì)胞抗原表位的研究
發(fā)布時間:2021-02-28 23:31
HCV是輸血后肝炎的主要病因之一,感染后慢性化率高,部分慢性感染者可發(fā)展成為肝硬變及肝癌。HCV屬黃病毒科,為單股正鏈RNA病毒。由于RNA復(fù)制酶的差錯率較高,HCV基因組表現(xiàn)出很高的變異率。變異可能是HCV逃避獲得性免疫系統(tǒng)的壓力,在宿主體內(nèi)持續(xù)感染的機制之一。我們對兩例慢性HCV攜帶者及一例HCV RNA轉(zhuǎn)陰者的HCV HVR1及NS3區(qū)部分區(qū)段測序,研究包含B細(xì)胞抗原表位(HVR1)和CTL抗原表位區(qū)段(NS3)的演變規(guī)律。 本研究選擇兩例HCV持續(xù)感染者,一例HCV RNA轉(zhuǎn)陰者,分三個時間點對兩個區(qū)段進(jìn)行五年隨訪研究。采用單鏈?zhǔn)止y序的方法,連續(xù)觀察HCV兩個區(qū)段5年中的變異情況(HVR1平均每個時相測27個克隆,NS3每個時相測5個克隆的序列)。三例感染者用抗體進(jìn)行HLA分型。分析序列資料時,建立了通用軟件和免費序列分析軟件相結(jié)合的分析方法。編寫了預(yù)測T細(xì)胞抗原表位的軟件GUOTIF(http://www.fmmu.edu.cn/GUOTIF.htm)。 研究有如下發(fā)現(xiàn): 1.三例感染者的HCV基因分型為1b,三者感染源可能相同,或存在交叉感染。 2...
【文章來源】:中國人民解放軍空軍軍醫(yī)大學(xué)陜西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:80 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
Ⅰ 中文摘要
Ⅱ 英文摘要
Ⅲ 縮寫詞、常用名詞及符號表
Ⅳ 前言
Ⅴ 文獻(xiàn)回顧
1 丙型肝炎基本情況
2 丙型肝炎病毒的分子生物學(xué)
3 RNA病毒相似株的概念及理論
4 丙型肝炎病毒持續(xù)性感染與免疫逃避
5 T淋巴細(xì)胞抗原表位預(yù)測
6 生物信息學(xué)
Ⅵ 材料與方法
1 實驗材料
2 實驗方法
3 測序資料的分析方法
Ⅶ 結(jié)果
1 HLA分型
2 核酸序列測定及注冊
3 序列資料初步分析
4 多序列對齊
5 遺傳距離及進(jìn)化樹分析
6 變異對螺旋酶高級結(jié)構(gòu)的影響
7 T細(xì)胞抗原表位預(yù)測
Ⅷ 討論
1 HCV相似株
2 CTL抗原表位
3 序列分析
4 T細(xì)胞抗原表位預(yù)測
Ⅸ 小結(jié)
Ⅹ 致謝
Ⅺ 附圖
Ⅻ 附錄
ⅩⅢ 參考文獻(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]用計算機程序預(yù)測可與HLA-A2分子結(jié)合的HCV抗原肽[J]. 周紅超,董明清,徐德忠,閆永平,張景霞,宋宏彬,李遠(yuǎn)貴. 細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志. 1996(04)
[2]中國人丙型肝炎病毒基因組的一級結(jié)構(gòu)及其變異[J]. 畢勝利,白憲鶴,叢勉爾,田厚文,孫得貴,H.S.Margolis,劉崇柏. 病毒學(xué)報. 1993(02)
本文編號:3056612
【文章來源】:中國人民解放軍空軍軍醫(yī)大學(xué)陜西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:80 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
Ⅰ 中文摘要
Ⅱ 英文摘要
Ⅲ 縮寫詞、常用名詞及符號表
Ⅳ 前言
Ⅴ 文獻(xiàn)回顧
1 丙型肝炎基本情況
2 丙型肝炎病毒的分子生物學(xué)
3 RNA病毒相似株的概念及理論
4 丙型肝炎病毒持續(xù)性感染與免疫逃避
5 T淋巴細(xì)胞抗原表位預(yù)測
6 生物信息學(xué)
Ⅵ 材料與方法
1 實驗材料
2 實驗方法
3 測序資料的分析方法
Ⅶ 結(jié)果
1 HLA分型
2 核酸序列測定及注冊
3 序列資料初步分析
4 多序列對齊
5 遺傳距離及進(jìn)化樹分析
6 變異對螺旋酶高級結(jié)構(gòu)的影響
7 T細(xì)胞抗原表位預(yù)測
Ⅷ 討論
1 HCV相似株
2 CTL抗原表位
3 序列分析
4 T細(xì)胞抗原表位預(yù)測
Ⅸ 小結(jié)
Ⅹ 致謝
Ⅺ 附圖
Ⅻ 附錄
ⅩⅢ 參考文獻(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]用計算機程序預(yù)測可與HLA-A2分子結(jié)合的HCV抗原肽[J]. 周紅超,董明清,徐德忠,閆永平,張景霞,宋宏彬,李遠(yuǎn)貴. 細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志. 1996(04)
[2]中國人丙型肝炎病毒基因組的一級結(jié)構(gòu)及其變異[J]. 畢勝利,白憲鶴,叢勉爾,田厚文,孫得貴,H.S.Margolis,劉崇柏. 病毒學(xué)報. 1993(02)
本文編號:3056612
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