基于融合模型的遺傳位點(diǎn)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-02-10 15:55
為了解決人類遺傳性疾病和性狀與基因組上位點(diǎn)間的關(guān)聯(lián)性問題,通過全基因組關(guān)聯(lián)分析,提出一種融合模型,建立了單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)與疾病的關(guān)聯(lián)分析。首先,將16維數(shù)據(jù)做降維處理;以位點(diǎn)集與類標(biāo)間的卡方統(tǒng)計(jì)量作為評價(jià)函數(shù)建立基于二階段蟻群算法的SNP關(guān)聯(lián)分析模型;選取與致病位點(diǎn)相似度最大的位點(diǎn),構(gòu)成新的位點(diǎn)集合,建立二元邏輯回歸模型,分析遺傳疾病與新的位點(diǎn)集合的關(guān)聯(lián)性;并使用隨機(jī)森林算法驗(yàn)證該模型的準(zhǔn)確率。數(shù)據(jù)測試驗(yàn)證表明了此融合模型的識(shí)別率達(dá)到85.8%,該模型比傳統(tǒng)方法的識(shí)別能力有明顯增強(qiáng),可以有效地進(jìn)行遺傳疾病、基因和位點(diǎn)多層次相關(guān)性分析。
【文章來源】:計(jì)算機(jī)與數(shù)字工程. 2019,47(09)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蟻群算法和蛙跳算法的融合研究[J]. 蔣萍,唐天兵. 物流技術(shù). 2014(05)
[2]基于蟻群算法的行為識(shí)別特征優(yōu)選方法[J]. 王忠民,曹棟. 西安郵電大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(01)
[3]基于隨機(jī)森林的特征選擇算法[J]. 姚登舉,楊靜,詹曉娟. 吉林大學(xué)學(xué)報(bào)(工學(xué)版). 2014(01)
[4]隨機(jī)森林方法在致病SNPs檢測中的應(yīng)用[J]. 姚俊杰,駱嘉偉. 世界科技研究與發(fā)展. 2012 (04)
[5]Logistic回歸模型的統(tǒng)計(jì)診斷與實(shí)例分析[J]. 謝書培,韓俊林. 聊城大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2011(01)
[6]基于數(shù)據(jù)挖掘的瓦斯災(zāi)害信息融合模型的研究[J]. 付華,王雨虹. 傳感器與微系統(tǒng). 2008(01)
[7]基于數(shù)據(jù)融合模型的網(wǎng)絡(luò)安全分析評估系統(tǒng)[J]. 劉超,謝寶陵,祝偉玲,徐國明,劉萬立. 計(jì)算機(jī)工程. 2005(13)
博士論文
[1]《比較統(tǒng)計(jì)學(xué)》框架的構(gòu)建及在回歸分析中的示范研究[D]. 鮑曉蕾.中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 2014
碩士論文
[1]蟻群算法在基因與疾病關(guān)聯(lián)性分析上的應(yīng)用與實(shí)驗(yàn)研究[D]. 劉丹.西安電子科技大學(xué) 2013
本文編號(hào):3027614
【文章來源】:計(jì)算機(jī)與數(shù)字工程. 2019,47(09)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蟻群算法和蛙跳算法的融合研究[J]. 蔣萍,唐天兵. 物流技術(shù). 2014(05)
[2]基于蟻群算法的行為識(shí)別特征優(yōu)選方法[J]. 王忠民,曹棟. 西安郵電大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(01)
[3]基于隨機(jī)森林的特征選擇算法[J]. 姚登舉,楊靜,詹曉娟. 吉林大學(xué)學(xué)報(bào)(工學(xué)版). 2014(01)
[4]隨機(jī)森林方法在致病SNPs檢測中的應(yīng)用[J]. 姚俊杰,駱嘉偉. 世界科技研究與發(fā)展. 2012 (04)
[5]Logistic回歸模型的統(tǒng)計(jì)診斷與實(shí)例分析[J]. 謝書培,韓俊林. 聊城大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2011(01)
[6]基于數(shù)據(jù)挖掘的瓦斯災(zāi)害信息融合模型的研究[J]. 付華,王雨虹. 傳感器與微系統(tǒng). 2008(01)
[7]基于數(shù)據(jù)融合模型的網(wǎng)絡(luò)安全分析評估系統(tǒng)[J]. 劉超,謝寶陵,祝偉玲,徐國明,劉萬立. 計(jì)算機(jī)工程. 2005(13)
博士論文
[1]《比較統(tǒng)計(jì)學(xué)》框架的構(gòu)建及在回歸分析中的示范研究[D]. 鮑曉蕾.中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 2014
碩士論文
[1]蟻群算法在基因與疾病關(guān)聯(lián)性分析上的應(yīng)用與實(shí)驗(yàn)研究[D]. 劉丹.西安電子科技大學(xué) 2013
本文編號(hào):3027614
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