為了解決人類遺傳性疾病和性狀與基因組上位點間的關聯(lián)性問題,通過全基因組關聯(lián)分析,提出一種融合模型,建立了單核苷酸多態(tài)性（Single Nucleotide Polymorphisms,SNP）與疾病的關聯(lián)分析。首先,將16維數(shù)據(jù)做降維處理;以位點集與類標間的卡方統(tǒng)計量作為評價函數(shù)建立基于二階段蟻群算法的SNP關聯(lián)分析模型;選取與致病位點相似度最大的位點,構成新的位點集合,建立二元邏輯回歸模型,分析遺傳疾病與新的位點集合的關聯(lián)性;并使用隨機森林算法驗證該模型的準確率。數(shù)據(jù)測試驗證表明了此融合模型的識別率達到85.8%,該模型比傳統(tǒng)方法的識別能力有明顯增強,可以有效地進行遺傳疾病、基因和位點多層次相關性分析。 

【文章來源】：計算機與數(shù)字工程. 2019,47(09)

【文章頁數(shù)】：6 頁

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
[1]《比較統(tǒng)計學》框架的構建及在回歸分析中的示范研究[D]. 鮑曉蕾.中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院 2014

碩士論文
[1]蟻群算法在基因與疾病關聯(lián)性分析上的應用與實驗研究[D]. 劉丹.西安電子科技大學 2013



本文編號：3027614