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基于融合模型的遺傳位點(diǎn)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-02-10 15:55
  為了解決人類遺傳性疾病和性狀與基因組上位點(diǎn)間的關(guān)聯(lián)性問題,通過全基因組關(guān)聯(lián)分析,提出一種融合模型,建立了單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)與疾病的關(guān)聯(lián)分析。首先,將16維數(shù)據(jù)做降維處理;以位點(diǎn)集與類標(biāo)間的卡方統(tǒng)計(jì)量作為評價(jià)函數(shù)建立基于二階段蟻群算法的SNP關(guān)聯(lián)分析模型;選取與致病位點(diǎn)相似度最大的位點(diǎn),構(gòu)成新的位點(diǎn)集合,建立二元邏輯回歸模型,分析遺傳疾病與新的位點(diǎn)集合的關(guān)聯(lián)性;并使用隨機(jī)森林算法驗(yàn)證該模型的準(zhǔn)確率。數(shù)據(jù)測試驗(yàn)證表明了此融合模型的識(shí)別率達(dá)到85.8%,該模型比傳統(tǒng)方法的識(shí)別能力有明顯增強(qiáng),可以有效地進(jìn)行遺傳疾病、基因和位點(diǎn)多層次相關(guān)性分析。 

【文章來源】:計(jì)算機(jī)與數(shù)字工程. 2019,47(09)

【文章頁數(shù)】:6 頁

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
[1]蟻群算法在基因與疾病關(guān)聯(lián)性分析上的應(yīng)用與實(shí)驗(yàn)研究[D]. 劉丹.西安電子科技大學(xué) 2013



本文編號(hào):3027614

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