病毒性肝炎基因芯片診斷技術(shù)研究和臨床應(yīng)用
發(fā)布時間:2021-02-07 20:52
基因芯片,又稱微型DNA陣列(microarry),是按特定的排列方式,將大量基因探針/基因片段固定在硅片、玻片和塑料片上,通過計算機處理,高效、大規(guī)模獲取相關(guān)生物信息。目前,該技術(shù)已用于基因表達譜分析、新基因發(fā)現(xiàn)、基因突變、基因多態(tài)性分析、藥物篩選和基因測序及疾病的診斷。 中國是肝炎大國,有近1.2億乙肝病毒攜帶者,1500萬丙型肝炎患者。目前,對于肝炎病毒的檢測,主要是通過測定抗原、抗體(病毒蛋白質(zhì))來完成,在診斷上存在免疫滯后性。對肝炎病毒基因亞型分型和基因突變檢測,多用核苷酸測序的方法,該方法試劑昂貴,操作復(fù)雜。 我們將基因芯片技術(shù)應(yīng)用到肝炎病毒的診斷上,通過生物醫(yī)學數(shù)據(jù)庫(美國生物技術(shù)信息中心NCBI)對乙型和丙型肝炎病毒基因進行檢索和篩選,應(yīng)用分子生物學軟件,進行序列分析、引物及探針設(shè)計,制成病毒性肝炎基因診斷芯片,并在臨床實踐中應(yīng)用,可快速、敏感、經(jīng)濟地完成對病人血清及肝組織中肝炎病毒DNA、RNA的基因診斷、亞型分型和基因突變檢測。目前已完成以下工作,并得出主要研究結(jié)論如下: 1.本科研通過生物信息方法從基因庫中篩選出代表乙型、丙型病毒性肝炎的基因特征...
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:129 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
BLAST界面圖
heDi銘nostieTeehniqueandCliniealApplieationofGeneehipofHepatitiSvirus·芯片制作對野生型序列以及突變型序列做多重序列比較,找出各序列相同的區(qū)域,即高度保守區(qū)。區(qū)域內(nèi)設(shè)計引物,可以成功地擴增出各亞型和突變型的序列。另外,找出各亞型或各突變同的區(qū)域設(shè)計探針,就可以檢測出待測序列屬于何種亞型或突變型。
多重序列比較結(jié)果
【參考文獻】:
期刊論文
[1]80例乙型、丙型病毒性肝炎血清、組織基因芯片檢測分析[J]. 趙偉,劉偉,劉新鈺,周鎮(zhèn)先,張林,羅嬋. 臨床肝膽病雜志. 2002(01)
[2]慢乙肝患者血清及肝組織HBVDNA表達及基因芯片檢測研究[J]. 趙偉,劉偉,張林,周鎮(zhèn)先,劉新鈺,劉全俊. 山東醫(yī)藥. 2002(01)
[3]基因芯片技術(shù)診斷乙型病毒性肝炎的初步研究[J]. 趙偉,劉偉,劉新鈺,周鎮(zhèn)先,張林. 江蘇醫(yī)藥. 2001(06)
[4]基因表達譜芯片在胰腺癌相關(guān)基因篩選中的應(yīng)用研究[J]. 金鋼,胡先貴,應(yīng)康,李瑤,唐榕,唐巖,景在平,謝毅,毛裕民. 第二軍醫(yī)大學學報. 2000(09)
[5]幾種新型生物芯片的研究進展[J]. 徐炳森,邵健忠,mail.hz.zj.cn. 生物化學與生物物理進展. 2000(03)
[6]微芯片——生命科學領(lǐng)域的新工具[J]. 陳亞利,陸祖宏. 生物化學與生物物理進展. 1998(06)
[7]生物芯片的研究、發(fā)展和應(yīng)用[J]. 陸祖宏. 電子科技導報. 1998(11)
[8]生物芯片的原理和制作方法[J]. 甘霖,陳亞利,陸祖宏. 傳感技術(shù)學報. 1998(02)
[9]乙型肝炎病毒前S/S基因變異及臨床意義[J]. 王國棠,田庚善. 中華內(nèi)科雜志. 1994(04)
本文編號:3022810
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:129 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
BLAST界面圖
heDi銘nostieTeehniqueandCliniealApplieationofGeneehipofHepatitiSvirus·芯片制作對野生型序列以及突變型序列做多重序列比較,找出各序列相同的區(qū)域,即高度保守區(qū)。區(qū)域內(nèi)設(shè)計引物,可以成功地擴增出各亞型和突變型的序列。另外,找出各亞型或各突變同的區(qū)域設(shè)計探針,就可以檢測出待測序列屬于何種亞型或突變型。
多重序列比較結(jié)果
【參考文獻】:
期刊論文
[1]80例乙型、丙型病毒性肝炎血清、組織基因芯片檢測分析[J]. 趙偉,劉偉,劉新鈺,周鎮(zhèn)先,張林,羅嬋. 臨床肝膽病雜志. 2002(01)
[2]慢乙肝患者血清及肝組織HBVDNA表達及基因芯片檢測研究[J]. 趙偉,劉偉,張林,周鎮(zhèn)先,劉新鈺,劉全俊. 山東醫(yī)藥. 2002(01)
[3]基因芯片技術(shù)診斷乙型病毒性肝炎的初步研究[J]. 趙偉,劉偉,劉新鈺,周鎮(zhèn)先,張林. 江蘇醫(yī)藥. 2001(06)
[4]基因表達譜芯片在胰腺癌相關(guān)基因篩選中的應(yīng)用研究[J]. 金鋼,胡先貴,應(yīng)康,李瑤,唐榕,唐巖,景在平,謝毅,毛裕民. 第二軍醫(yī)大學學報. 2000(09)
[5]幾種新型生物芯片的研究進展[J]. 徐炳森,邵健忠,mail.hz.zj.cn. 生物化學與生物物理進展. 2000(03)
[6]微芯片——生命科學領(lǐng)域的新工具[J]. 陳亞利,陸祖宏. 生物化學與生物物理進展. 1998(06)
[7]生物芯片的研究、發(fā)展和應(yīng)用[J]. 陸祖宏. 電子科技導報. 1998(11)
[8]生物芯片的原理和制作方法[J]. 甘霖,陳亞利,陸祖宏. 傳感技術(shù)學報. 1998(02)
[9]乙型肝炎病毒前S/S基因變異及臨床意義[J]. 王國棠,田庚善. 中華內(nèi)科雜志. 1994(04)
本文編號:3022810
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