中國結(jié)核菌耐多藥和廣泛耐藥相關(guān)基因突變特征及MAS-PCR研究
發(fā)布時間:2017-04-10 15:02
本文關(guān)鍵詞:中國結(jié)核菌耐多藥和廣泛耐藥相關(guān)基因突變特征及MAS-PCR研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的:分析中國耐多藥(MDR TB)和廣泛耐藥結(jié)核分枝桿菌(XDR TB)耐藥相關(guān)基因的突變特征;建立與之相應的等位基因特異性多重聚合酶鏈反應(multiplex allele specific PCR,MAS PCR)技術(shù),以實現(xiàn)對MDR TB與XDR TB的快速檢測,為MDR TB與XDR TB的診斷和監(jiān)測提供新的技術(shù)手段。 材料和方法: 1.采用比例法藥敏試驗,從全國23省收集的結(jié)核分枝桿菌菌株中篩選了230株MDR TB,27株XDR TB及64株敏感菌株用于本研究。研究菌株由中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所結(jié)核病實驗室收集保藏并提供。 2.采用L-J培養(yǎng)基培養(yǎng)菌株,并通過CTAB(溴化十六烷基三甲銨)法提取全基因組DNA用于耐藥相關(guān)基因的聚合酶鏈反應(PCR)擴增,PCR產(chǎn)物采用脫氧核糖核酸(DNA)測序分析。 3.利用基因測序技術(shù),分別對321株試驗菌株的katG基因,inhA調(diào)控區(qū),ahpC-oxyR基因間隔區(qū),,rpoB基因,gyrA, gyrB基因及rrs基因進行序列分析。 4.根據(jù)我國MDR TB及XDR TB耐藥相關(guān)基因的突變特點,篩選與耐藥高度相關(guān)的基因突變位點,建立與之相應的MAS PCR檢測技術(shù),對MDR TB及XDR TB進行快速檢測。 5.利用MAS PCR技術(shù)對湖南省200株結(jié)核分枝桿菌臨床分離株(含MDR TB,XDR TB,敏感菌株)進行檢測驗證,并與傳統(tǒng)比例法藥敏試驗結(jié)果進行比較,評價MAS PCR技術(shù)的實用性。 結(jié)果: 1.257株耐多藥和廣泛耐藥結(jié)核分枝桿菌中,14.0%的菌株inhA基因發(fā)生突變,58.4%菌株的katG基因發(fā)生突變,16.7%菌株的oxyR-ahpC基因發(fā)生突變,同時考慮這三種基因,異煙肼耐藥相關(guān)基因突變檢出率可達79.8%;91.1%菌株的rpoB基因發(fā)生突變,67.1%菌株的gyrA基因發(fā)生突變,7.6%菌株的gyrB基因發(fā)生突變,40.0%菌株的rrs基因發(fā)生突變;蛲蛔兊闹饕稽c為katG315(49.8%),inhA-15(9.4%),rpoB531(49.8%),526(22.6%)和516(10.5%),gyrA94(43.0%)和90(21.5%),rrs1401(40%)。 2.根據(jù)我國MDR TB及XDR TB耐藥相關(guān)基因的特點,建立了與之相應的MAS PCR耐藥檢測技術(shù)。對200株臨床分離株(43株MDR,其中4株XDR)進行了MAS-PCR檢測。MAS-PCR與比例法藥敏試驗比較,異煙肼耐藥檢測的敏感性為72.5%(50/69),對利福平檢測的敏感性為77.0%(40/52),檢測氧氟沙星敏感性為66.7%(14/21),而卡那霉素為75%(3/4),四種藥物檢測的特異性均為100%。 結(jié)論: 1.我國耐多藥結(jié)核菌異煙肼、利福平、氧氟沙星和卡那霉素耐藥相關(guān)基因最常見突變?yōu)閗atG315、inhA-15,rpoB531、526和516, gyrA94和90,rrs1401。 2. MAS-PCR技術(shù)檢測MDR-及XDR-TB耐藥性簡便、快速、特異性高,對MDR-及XDR-TB耐藥早期診斷具有重要意義。
【關(guān)鍵詞】:結(jié)核分枝桿菌 耐多藥結(jié)核病 廣泛耐藥結(jié)核病 基因突變 MAS-PCR技術(shù)
【學位授予單位】:南華大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R446.5;R378.911
【目錄】:
- Abbreviation(縮略詞)4-5
- 中文摘要5-7
- ABSTRACT7-10
- 前言10-13
- 第一部分 中國耐多藥和廣泛耐藥結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)基因突變特征分析13-32
- 材料與方法13-19
- 一、實驗材料13-15
- 二、試驗方法15-19
- 實驗結(jié)果19-26
- 一、藥物敏感性實驗結(jié)果19-20
- 二、耐藥相關(guān)基因測序結(jié)果20-26
- 討論26-28
- 結(jié)論28-29
- 參考文獻29-32
- 第二部分 MAS-PCR 技術(shù)用于診斷耐多藥和廣泛耐藥結(jié)核病的研究32-51
- 材料與方法32-39
- 一、實驗材料32
- 二、實驗方法32-39
- 結(jié)果39-44
- 1. 比例法檢測藥敏結(jié)果39-40
- 2. 測序結(jié)果40-42
- 3. MAS PCR 檢測結(jié)核分枝桿菌耐藥性結(jié)果42-44
- 討論44-48
- 結(jié)論48-49
- 參考文獻49-51
- 本研究基金資助項目51-52
- 已發(fā)表文章52-53
- 文獻綜述53-65
- 參考文獻61-65
- 致謝65
【參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前6條
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4 韓喜琴,馬s
本文編號:296945
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