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中國結(jié)核菌耐多藥和廣泛耐藥相關(guān)基因突變特征及MAS-PCR研究

發(fā)布時(shí)間:2017-04-10 15:02

  本文關(guān)鍵詞:中國結(jié)核菌耐多藥和廣泛耐藥相關(guān)基因突變特征及MAS-PCR研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:目的:分析中國耐多藥(MDR TB)和廣泛耐藥結(jié)核分枝桿菌(XDR TB)耐藥相關(guān)基因的突變特征;建立與之相應(yīng)的等位基因特異性多重聚合酶鏈反應(yīng)(multiplex allele specific PCR,MAS PCR)技術(shù),以實(shí)現(xiàn)對MDR TB與XDR TB的快速檢測,為MDR TB與XDR TB的診斷和監(jiān)測提供新的技術(shù)手段。 材料和方法: 1.采用比例法藥敏試驗(yàn),從全國23省收集的結(jié)核分枝桿菌菌株中篩選了230株MDR TB,27株XDR TB及64株敏感菌株用于本研究。研究菌株由中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所結(jié)核病實(shí)驗(yàn)室收集保藏并提供。 2.采用L-J培養(yǎng)基培養(yǎng)菌株,并通過CTAB(溴化十六烷基三甲銨)法提取全基因組DNA用于耐藥相關(guān)基因的聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物采用脫氧核糖核酸(DNA)測序分析。 3.利用基因測序技術(shù),分別對321株試驗(yàn)菌株的katG基因,inhA調(diào)控區(qū),ahpC-oxyR基因間隔區(qū),,rpoB基因,gyrA, gyrB基因及rrs基因進(jìn)行序列分析。 4.根據(jù)我國MDR TB及XDR TB耐藥相關(guān)基因的突變特點(diǎn),篩選與耐藥高度相關(guān)的基因突變位點(diǎn),建立與之相應(yīng)的MAS PCR檢測技術(shù),對MDR TB及XDR TB進(jìn)行快速檢測。 5.利用MAS PCR技術(shù)對湖南省200株結(jié)核分枝桿菌臨床分離株(含MDR TB,XDR TB,敏感菌株)進(jìn)行檢測驗(yàn)證,并與傳統(tǒng)比例法藥敏試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行比較,評價(jià)MAS PCR技術(shù)的實(shí)用性。 結(jié)果: 1.257株耐多藥和廣泛耐藥結(jié)核分枝桿菌中,14.0%的菌株inhA基因發(fā)生突變,58.4%菌株的katG基因發(fā)生突變,16.7%菌株的oxyR-ahpC基因發(fā)生突變,同時(shí)考慮這三種基因,異煙肼耐藥相關(guān)基因突變檢出率可達(dá)79.8%;91.1%菌株的rpoB基因發(fā)生突變,67.1%菌株的gyrA基因發(fā)生突變,7.6%菌株的gyrB基因發(fā)生突變,40.0%菌株的rrs基因發(fā)生突變;蛲蛔兊闹饕稽c(diǎn)為katG315(49.8%),inhA-15(9.4%),rpoB531(49.8%),526(22.6%)和516(10.5%),gyrA94(43.0%)和90(21.5%),rrs1401(40%)。 2.根據(jù)我國MDR TB及XDR TB耐藥相關(guān)基因的特點(diǎn),建立了與之相應(yīng)的MAS PCR耐藥檢測技術(shù)。對200株臨床分離株(43株MDR,其中4株XDR)進(jìn)行了MAS-PCR檢測。MAS-PCR與比例法藥敏試驗(yàn)比較,異煙肼耐藥檢測的敏感性為72.5%(50/69),對利福平檢測的敏感性為77.0%(40/52),檢測氧氟沙星敏感性為66.7%(14/21),而卡那霉素為75%(3/4),四種藥物檢測的特異性均為100%。 結(jié)論: 1.我國耐多藥結(jié)核菌異煙肼、利福平、氧氟沙星和卡那霉素耐藥相關(guān)基因最常見突變?yōu)閗atG315、inhA-15,rpoB531、526和516, gyrA94和90,rrs1401。 2. MAS-PCR技術(shù)檢測MDR-及XDR-TB耐藥性簡便、快速、特異性高,對MDR-及XDR-TB耐藥早期診斷具有重要意義。
【關(guān)鍵詞】:結(jié)核分枝桿菌 耐多藥結(jié)核病 廣泛耐藥結(jié)核病 基因突變 MAS-PCR技術(shù)
【學(xué)位授予單位】:南華大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號】:R446.5;R378.911
【目錄】:
  • Abbreviation(縮略詞)4-5
  • 中文摘要5-7
  • ABSTRACT7-10
  • 前言10-13
  • 第一部分 中國耐多藥和廣泛耐藥結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)基因突變特征分析13-32
  • 材料與方法13-19
  • 一、實(shí)驗(yàn)材料13-15
  • 二、試驗(yàn)方法15-19
  • 實(shí)驗(yàn)結(jié)果19-26
  • 一、藥物敏感性實(shí)驗(yàn)結(jié)果19-20
  • 二、耐藥相關(guān)基因測序結(jié)果20-26
  • 討論26-28
  • 結(jié)論28-29
  • 參考文獻(xiàn)29-32
  • 第二部分 MAS-PCR 技術(shù)用于診斷耐多藥和廣泛耐藥結(jié)核病的研究32-51
  • 材料與方法32-39
  • 一、實(shí)驗(yàn)材料32
  • 二、實(shí)驗(yàn)方法32-39
  • 結(jié)果39-44
  • 1. 比例法檢測藥敏結(jié)果39-40
  • 2. 測序結(jié)果40-42
  • 3. MAS PCR 檢測結(jié)核分枝桿菌耐藥性結(jié)果42-44
  • 討論44-48
  • 結(jié)論48-49
  • 參考文獻(xiàn)49-51
  • 本研究基金資助項(xiàng)目51-52
  • 已發(fā)表文章52-53
  • 文獻(xiàn)綜述53-65
  • 參考文獻(xiàn)61-65
  • 致謝65

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前6條

1 譚昌淵;羅九甫;任兆瑞;;高分辨率熔解曲線分析—分子診斷的新技術(shù)[J];生命科學(xué)研究;2009年03期

2 劉宇紅,姜廣路,趙立平,李云絮,付育紅,畢志強(qiáng),王u&民;第四次全國結(jié)核病流調(diào)分支桿菌藥敏試驗(yàn)的方法學(xué)探討[J];中國防癆雜志;2003年01期

3 程曉東,于文彬,別良峰,蘇明權(quán),張榮,郝曉柯;多重聚合酶鏈反應(yīng)-單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析檢測耐異煙肼結(jié)核分枝桿菌[J];中華結(jié)核和呼吸雜志;2004年01期

4 韓喜琴,馬s

本文編號:296945


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