CpG-ODN c41免疫特性及無刺激性內(nèi)化機制研究
本文關鍵詞:CpG-ODN c41免疫特性及無刺激性內(nèi)化機制研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:在固有免疫中,TLR9能特異性識別微生物非甲基化CpG-DNA(CpG-ODN),激發(fā)MyD88信號級聯(lián),釋放促炎因子TNF-α,IL-6等,對消除病原體入侵具有十分重要的意義。然而,當TLR過度活化,大量促炎因子釋放,又會引起針對宿主自身的炎性病理損傷。在前期研究中,本課題組新發(fā)現(xiàn)的一種特殊的CpG-ODN分子,命名為CpG-ODN c41(CpG-c41),它內(nèi)化入胞后并不引起細胞因子釋放,無免疫刺激性。由此我們將CpG-c41的內(nèi)化稱為“無刺激性內(nèi)化”。此外,CpG-c41能抑制刺激性CpG-ODN誘導的促炎因子釋放,具有顯著的抑炎作用,但其分子作用機制和免疫特性尚不完全清楚。本課題從多角度對CpG-c41的免疫特性,及其對TLR9信號通路抑制機制進行深入研究。 此外,在TLR9信號抑制途徑研究中,除了作為TLR9配體的CpG-c41之外,miRNA作為一種負調(diào)控機制也引起了廣泛關注。為了突破實驗方法的局限性,尋找更多的與TLR9乃至整個Toll-樣受體家族信號通路相關miRNA,本研究建立了一種目前最為完整的直接從前體miRNA預測成熟miRNA的miRNA預測模型,F(xiàn)OMmiR,并嘗試用FOMmiR從非編碼RNA中預測成熟miRNA后,在整個Toll-樣受體信號通路相關分子的mRNA3’UTR中進行局部序列比對(Blast),探索miRNA的靶基因。 CpG-c41產(chǎn)生的TLR9信號通路抑制機制研究,以及探尋Toll-樣受體相關信號通路miRNA有助于為臨床抗炎抗過敏治療提供新的策略。 目的: 明確CpG-c41的免疫特性及其無刺激性內(nèi)化的機制,包括CpG-c41與刺激性CpG-ODN之間的競爭入胞如何發(fā)生,以及這種競爭在信號通路中所處位置。并建立準確的miRNA預測模型,探尋TLR9信號通路相關miRNA。 方法: 1.通過ELISA實驗觀察不同劑量CpG-c41對CpG-1826誘導的TLR9活化的影響,CpG-c41對CpG-1826誘導的TLR9活化不同的影響,CpG-c41對小鼠巨噬細胞免疫應答能力的影響; 2.采用免疫熒光實驗和激光共聚焦定位來觀察CpG-c41在胞內(nèi)的內(nèi)化轉運過程; 3.采用蛋白印記實驗檢測在CpG-c41作用下TLR9-MyD88下游信號通路的活化情況; 4.運用生物信息學方法建立miRNA預測模型,并探尋TLR9信號通路相關miRNA。 結果: 1. CpG-c41作用細胞后,不引起細胞因子釋放,表現(xiàn)出無免疫刺激性。 2. CpG-c41與CpG-1826同時作用于細胞情況下, CpG-c41能夠有效抑制CpG-1826誘導的炎性細胞因子釋放,產(chǎn)生了抑炎作用,且存在顯著的量效關系。 3.在CpG-1826誘導的TLR9活化的不同時相點加入CpG-c41,對TLR9早期TNF-α釋放和晚期IL-6均有顯著的抑制作用,且越早加入CpG-c41,抑制效果越明顯。 4. CpG-1826作用細胞24h后,顯微鏡觀察到明顯的凋亡泡,而CpG-c41作用后的細胞細胞形態(tài)正常。接受再次CpG-1826刺激時,CpG-1826預處理組喪失免疫應答能力,細胞因子釋放水平顯著降低;CpG-c41預處理組免疫應答能力受影響較小,細胞因子釋放保持較高水平。 5.免疫熒光實驗結果顯示CpG-c41在早期內(nèi)體中被TLR9識別。 6.蛋白印記實驗結果顯示CpG-c41并未激活TLR9-MyD88信號通路的下游通路;較單獨CpG-1826刺激,用CpG-c41和CpG-1826的混合物作用于細胞后MyD88信號級聯(lián)的下游子通路均受到顯著的抑制。 7.建立了一種新的基于二級結構模式的定階馬爾科夫模型的miRNA預測算法,F(xiàn)OMmiR實現(xiàn)了從發(fā)夾結構序列預測成熟miRNA的全功能識別。 8.通過將由FOMmiR從非編碼RNA中預測的成熟miRNA的反向互補鏈與Toll-樣受體信號通路相關分子的mRNA3’UTR序列進行Blast比對,發(fā)現(xiàn)785條序列的907條miRNA與82個基因之間存在1340個交互作用,其中2條miRNA(miR-15a和miR-146a)在文獻中有報道。 結論: 1. CpG-c41的免疫學特性 CpG-c41對刺激性CpG-ODN的抑炎效應具有顯著的量效關系與時效關系。CpG-c41與CpG-1826濃度比為1:1時,TNF-α釋放水平降低約50%,當濃度比為4:1時,TNF-α釋放水平降低超過90%。在刺激性CpG-ODN作用細胞3h內(nèi)加入CpG-c41,對早期TNF-α釋放均有顯著的抑制效果,30min中內(nèi)加入效果最好;后期在20h內(nèi)加入CpG-c41對晚期IL-6的釋放均有顯著的抑制效果,在16h之前加入效果更明顯。 2. CpG-c41的抑炎作用機制 免疫熒光結果顯示CpG-c41通過比CpG-1826更高效的內(nèi)化過程入胞,并在早期內(nèi)體中被TLR9識別。正是CpG-c41對受體的高親和力使其與刺激性CpG-ODN爭奪受體,阻礙了刺激性CpG-ODN內(nèi)化入胞與TLR9結合。 盡管CpG-c41與TLR9發(fā)生結合,然而蛋白印記結果顯示CpG-c41并未激活TLR9-MyD88信號通路的下游NF-κB和MAPKs通路,因此CpG-c41并不引起細胞因子的釋放,無免疫刺激性。加入CpG-c41后,CpG-1826誘導的TLR9-MyD88信號通路的下游通路活性顯著降低,從而產(chǎn)生抑炎效應。 3. TLR9通路相關miRNA 為了突破實驗方法的局限性,尋找更多的與TLR9乃至整個Toll-樣受體家族信號通路相關miRNA,我們建立了一種最為完整的直接從前體miRNA預測成熟miRNA的miRNA預測模型,F(xiàn)OMmiR。并嘗試用FOMmiR從非編碼RNA中預測成熟miRNA,并在整個Toll-樣受體信號通路相關分子的mRNA3’UTR中進行局部序列比對(Blast),探索miRNA的靶基因,結果中有2條miRNA已有文獻報道。
【關鍵詞】:TLR9 CpG-c41 無刺激性內(nèi)化 FOMmiR miRNA
【學位授予單位】:第三軍醫(yī)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2013
【分類號】:R392
【目錄】:
- 縮略語表4-6
- Abstract6-10
- 中文摘要10-13
- 第一章 前言13-17
- 1.1 選題緣由13
- 1.2 研究背景13-14
- 1.3 研究意義14-15
- 1.4 研究內(nèi)容15
- 1.5 研究方法15-17
- 第二章 CpG-c41 的免疫特性17-27
- 2.1 材料和方法17-20
- 2.2 結果20-25
- 2.3 小結25-27
- 第三章 CpG-c41 無刺激性內(nèi)化機制27-41
- 3.1 材料和方法27-34
- 3.2 結果34-39
- 3.3 小結39-41
- 第四章 探尋 TLR9 信號通路相關 miRNA41-50
- 4.1 材料和方法42-44
- 4.2 結果44-48
- 4.3 小結48-50
- 全文總結50-52
- 參考文獻52-58
- 文獻綜述58-70
- 參考文獻64-70
- 攻讀學位期間的研究成果70-71
- 致謝71
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2 李s,
本文編號:290524
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