氨基酸對秀麗隱桿線蟲壽命的影響及分子機制的初步研究
發(fā)布時間:2017-03-27 17:10
本文關(guān)鍵詞:氨基酸對秀麗隱桿線蟲壽命的影響及分子機制的初步研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:延年益壽是人類古往今來的共同夙愿,而延長壽命與減緩衰老也逐漸成為當(dāng)今生命科學(xué)研究領(lǐng)域的熱點課題之一。壽命的調(diào)控機制較為復(fù)雜,由基因遺傳和外界環(huán)境兩者共同作用,其中基因具有決定性的作用,但其作用機理尚未明確。本課題以秀麗隱桿線蟲(Caenorhabditis elegans,C.elegans)作為模式生物,通過氨基酸對其壽命及表型特征的影響,致力于從基因方面為切入點探究其壽命調(diào)控分子機理,最終可以通過控制飲食減緩甚至逆轉(zhuǎn)衰老進(jìn)程而延長壽命。 本文通過文獻(xiàn)查閱和相關(guān)信息收集,,對已明確報道與線蟲壽命關(guān)系密切的基因進(jìn)行歸納總結(jié),運用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫及KGML軟件成功構(gòu)建線蟲壽命局部基因網(wǎng)絡(luò),該網(wǎng)絡(luò)將壽命相關(guān)基因、小分子化合物以及代謝模塊通過相應(yīng)生物途徑緊密相連。該基因網(wǎng)絡(luò)打破了之前通過致使單個基因突變進(jìn)而調(diào)控壽命的研究模式,清晰的展現(xiàn)了基因之間的相互作用,小分子對基因表達(dá)的影響及對應(yīng)代謝通路的調(diào)控作用,為從一個全新的角度探尋壽命調(diào)控分子機理提供了較為可靠的技術(shù)平臺。 通過對線蟲喂食3種不同濃度梯度(0.1×、1×和10×)的21種氨基酸小分子,觀察對其壽命的影響,篩選出16種組合對線蟲壽命具有顯著影響效果。以此為基礎(chǔ)進(jìn)行2次平行實驗及生理特征觀察,發(fā)現(xiàn)10Cys、10Asn、10Thr、10Asp、1Tyr和1Met不僅可以影響線蟲壽命而且實驗重現(xiàn)性極好,其中10Cys顯著影響線蟲的生理特征,不僅可以提高活性而且喂食該種氨基酸的線蟲身體非常瘦小。經(jīng)過綜合考量確定10Cys、10Asn和10Asp為基因表達(dá)水平變化測試對象,這三種氨基酸對線蟲均有明顯的減壽作用。 使用實時熒光定量PCR技術(shù)檢測10Cys、10Asn和10Asp分別喂養(yǎng)5d、10d和15d的線蟲體內(nèi)相應(yīng)壽命相關(guān)基因的表達(dá)水平。實驗結(jié)果顯示:各基因的表達(dá)水平均發(fā)生不同程度的變化,其中age-1和pdk-1在喂食10Cys第5天的線蟲體內(nèi)與其他線蟲相比表達(dá)水平提高了2倍以上;age-1、pdk-1、akt-1和nmr-1四個基因在喂食10Asp線蟲體內(nèi),喂食時間越長基因表達(dá)越高。其中nmr-1在喂食10Asp線蟲體內(nèi),第15天時的表達(dá)量遠(yuǎn)高于第5天時的表達(dá)量,高達(dá)上萬倍。上述發(fā)現(xiàn)說明氨基酸會影響線蟲壽命相關(guān)基因的表達(dá)水平,但是從局部基因網(wǎng)絡(luò)角度并未發(fā)現(xiàn)明顯規(guī)律,有待進(jìn)一步深入探究。
【關(guān)鍵詞】:秀麗隱桿線蟲 壽命 局部基因網(wǎng)絡(luò) 氨基酸 實時熒光定量PCR
【學(xué)位授予單位】:哈爾濱工業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號】:R339.36
【目錄】:
- 摘要4-5
- Abstract5-7
- 目錄7-10
- 第1章 緒論10-21
- 1.1 課題背景10-11
- 1.2 研究目的及意義11
- 1.3 國內(nèi)外研究進(jìn)展11-20
- 1.3.1 秀麗隱桿線蟲11-16
- 1.3.2 氨基酸16-17
- 1.3.3 基因網(wǎng)絡(luò)17-18
- 1.3.4 實時熒光定量 PCR18-20
- 1.4 課題來源和研究內(nèi)容20-21
- 1.4.1 課題來源20
- 1.4.2 研究內(nèi)容20-21
- 第2章 線蟲壽命局部基因網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建21-30
- 2.1 引言21
- 2.2 材料與方法21-24
- 2.2.1 實驗材料21-24
- 2.2.2 實驗方法24
- 2.3 結(jié)果與分析24-28
- 2.3.1 線蟲壽命相關(guān)基因的查找與篩選結(jié)果24-25
- 2.3.2 壽命相關(guān)基因所參與代謝通路的查找結(jié)果25-27
- 2.3.3 線蟲壽命局部基因網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建27-28
- 2.4 討論28-29
- 2.5 本章小結(jié)29-30
- 第3章 氨基酸對線蟲壽命影響的初步篩選實驗30-52
- 3.1 引言30
- 3.2 材料與方法30-34
- 3.2.1 實驗材料與儀器30-32
- 3.2.2 實驗方法32-34
- 3.3 結(jié)果與分析34-50
- 3.3.1 半胱氨酸(Cys)對線蟲壽命的影響34-35
- 3.3.2 甘氨酸(Gly)對線蟲壽命的影響35-36
- 3.3.3 谷氨酸(Glu)對線蟲壽命的影響36
- 3.3.4 絲氨酸(Ser)對線蟲壽命的影響36-37
- 3.3.5 精氨酸(Arg)對線蟲壽命的影響37-38
- 3.3.6 丙氨酸(Ala)對線蟲壽命的影響38-39
- 3.3.7 天冬氨酸(Asp)對線蟲壽命的影響39
- 3.3.8 鳥氨酸(Orn)對線蟲壽命的影響39-40
- 3.3.9 天冬酰胺(Asn)對線蟲壽命的影響40-41
- 3.3.10 谷氨酰胺(Gln)對線蟲壽命的影響41-42
- 3.3.11 苯丙氨酸(Phe)對線蟲壽命的影響42
- 3.3.12 酪氨酸(Tyr)對線蟲壽命的影響42-43
- 3.3.13 色氨酸(Try)對線蟲壽命的影響43-44
- 3.3.14 蘇氨酸(Thr)對線蟲壽命的影響44-45
- 3.3.15 賴氨酸(Lys)對線蟲壽命的影響45
- 3.3.16 組氨酸(His)對線蟲壽命的影響45-46
- 3.3.17 甲硫氨酸(Met)對線蟲壽命的影響46-47
- 3.3.18 脯氨酸(Pro)對線蟲壽命的影響47-48
- 3.3.19 纈氨酸(Val)對線蟲壽命的影響48-49
- 3.3.20 亮氨酸(Leu)對線蟲壽命的影響49
- 3.3.21 異亮氨酸(Ile)對線蟲壽命的影響49-50
- 3.4 討論50-51
- 3.5 本章小結(jié)51-52
- 第4章 氨基酸對線蟲壽命影響的重復(fù)驗證及生理特征觀察52-66
- 4.1 引言52
- 4.2 材料與方法52-53
- 4.2.1 實驗材料與儀器52
- 4.2.2 實驗方法52-53
- 4.3 結(jié)果與分析53-64
- 4.3.1 差異極顯著組重復(fù)驗證實驗及生理特征觀察53-59
- 4.3.2 差異顯著組重復(fù)驗證實驗及生理特征觀察59-64
- 4.4 討論64-65
- 4.5 本章小結(jié)65-66
- 第5章 線蟲壽命相關(guān)基因表達(dá)水平的檢測66-88
- 5.1 引言66
- 5.2 材料與方法66-71
- 5.2.1 實驗材料66-67
- 5.2.2 實驗方法67-71
- 5.3 結(jié)果與分析71-86
- 5.3.1 RNA 質(zhì)量的驗證71
- 5.3.2 用于 Q-PCR 的引物篩選結(jié)果71-72
- 5.3.3 各基因 Q-PCR 體系的確定72-73
- 5.3.4 實時熒光定量 PCR 檢測壽命相關(guān)基因表達(dá)水平結(jié)果73-86
- 5.4 討論86-87
- 5.5 本章小結(jié)87-88
- 結(jié)論88-89
- 參考文獻(xiàn)89-93
- 附錄93-102
- 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文102-104
- 致謝104
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7 王
本文編號:270724
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