目的：了解肺癌發(fā)展的早期分子改變對肺癌的預防和早診有重要意義,然而癌前組織通常難以獲取,因此本研究選取可能和肺癌癌前病變具有相似分子特征的人支氣管上皮永生化細胞作為癌前模型,對比肺癌細胞系,檢測分析其拷貝數(shù)變異和表達模式,以獲得可能對肺癌發(fā)展早期階段有意義的染色體或基因改變。方法：利用array-CGH和表達譜芯片技術獲得永生化上皮細胞系Y-BE和肺鱗癌細胞系NCI-H2170的拷貝數(shù)變異譜和mRNA表達譜,并利用生物信息學分析手段和GO富集分析得到有意義的拷貝數(shù)或表達改變。結果：永生化上皮細胞系Y-BE早代發(fā)生了染色體20q區(qū)段的顯著擴增,而這種擴增現(xiàn)象同時存在于NCI-H2170細胞系中；相較于Y-BE早代細胞,Y-BE晚代細胞和NCI-H2170細胞都存在炎癥反應及胚胎發(fā)育相關基因的表達改變。結論：染色體20q的擴增可能是重要的肺癌早期事件,而炎癥反應和胚胎發(fā)育相關基因的調節(jié)作用可能只在腫瘤發(fā)展過程的某個特定階段起重要作用。 目的：神經膠質瘤的通用分級WHO分級因可能引入主觀因素并難以適應個性化醫(yī)療等原因需要改進與細化,本研究利用神經膠質瘤患者間的mRNA表達差異對其進行生存分析...

【文章頁數(shù)】：70 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
圖表索引
英語縮略詞表
摘要
Abstract
第一部分 永生化上皮細胞拷貝數(shù)變異和表達數(shù)據(jù)的研究
    前言
        1. 肺癌及其癌前病變
        2. 腫瘤與細胞永生化
        3. 肺癌及癌前組織的基因組變化
        4. 研究目的及研究策略
    材料和方法
        1. 細胞培養(yǎng)
        2. 主要試劑或試劑盒
        3. 細胞收集及生物大分子的提取
        4. array-CGH實驗流程
        5. mRNA表達譜芯片實驗流程
        6. 數(shù)據(jù)分析
    結果
        1. DNA及RNA樣本的各項質量控制
        2. array-CGH檢測的細胞拷貝數(shù)變異
            1) 永生化上皮細胞Y-BE的拷貝數(shù)變異
            2) 肺鱗癌NCI-H2170細胞的拷貝數(shù)變異
            3) 三組細胞拷貝數(shù)變異的對比觀察
        3. 表達譜芯片檢測的不同細胞系間基因表達情況
            1) 表達譜差異的整體情況及GO富集結果
            2) 表達譜與array-CGH結果的整合情況
    討論
        1. array-CGH芯片拷貝數(shù)變異分析
            1) 永生化上皮細胞Y-BE的拷貝數(shù)變異情況
            2) 肺鱗癌細胞NCI-H2170的拷貝數(shù)變異情況
            3) 拷貝數(shù)變異在三組細胞間的整體情況
        2. 表達譜芯片結果分析
            1) 永生化上皮細胞早晚代間的表達差異
            2) 腫瘤細胞相對于永生化上皮細胞的表達差異
            3) 表達譜芯片與array-CGH結果的整合情況
    小結
第二部分 基因組表達譜數(shù)據(jù)與神經膠質瘤的預后分析
    前言
        1. 神經膠質瘤及其通用分級
        2. 神經膠質瘤的分子特征與預后的關系
        3. 研究目的及研究策略
    材料和方法
        1. 臨床樣本的收集及患者隨訪
        2. 主要試劑或試劑盒
        3. RNA的提取及保存
        4. 利用Agilent(?)2100平臺對樣本RNA質量進行檢測
        5. 表達譜芯片實驗
        6. 生物信息學分析
    結果
        1. RNA樣本的質量檢驗
        2. 用2512個基因對樣本進行聚類及主成分分析分析
        3. 分子網絡的獲得與分析
        4. 分子網絡的表達特點及關鍵基因
        5. 利用篩選基因對樣本的預后重新分析
    討論
        1. WHO分級對神經膠質瘤預后的作用及影響
        2. 分子網絡與神經膠質瘤的關系
        3. 神經膠質瘤的分子分型：問題與展望
    小結
參考文獻
文獻綜述
    參考文獻
致謝
個人簡歷



本文編號：3753231