目的：了解肺癌發(fā)展的早期分子改變對(duì)肺癌的預(yù)防和早診有重要意義,然而癌前組織通常難以獲取,因此本研究選取可能和肺癌癌前病變具有相似分子特征的人支氣管上皮永生化細(xì)胞作為癌前模型,對(duì)比肺癌細(xì)胞系,檢測(cè)分析其拷貝數(shù)變異和表達(dá)模式,以獲得可能對(duì)肺癌發(fā)展早期階段有意義的染色體或基因改變。方法：利用array-CGH和表達(dá)譜芯片技術(shù)獲得永生化上皮細(xì)胞系Y-BE和肺鱗癌細(xì)胞系NCI-H2170的拷貝數(shù)變異譜和mRNA表達(dá)譜,并利用生物信息學(xué)分析手段和GO富集分析得到有意義的拷貝數(shù)或表達(dá)改變。結(jié)果：永生化上皮細(xì)胞系Y-BE早代發(fā)生了染色體20q區(qū)段的顯著擴(kuò)增,而這種擴(kuò)增現(xiàn)象同時(shí)存在于NCI-H2170細(xì)胞系中；相較于Y-BE早代細(xì)胞,Y-BE晚代細(xì)胞和NCI-H2170細(xì)胞都存在炎癥反應(yīng)及胚胎發(fā)育相關(guān)基因的表達(dá)改變。結(jié)論：染色體20q的擴(kuò)增可能是重要的肺癌早期事件,而炎癥反應(yīng)和胚胎發(fā)育相關(guān)基因的調(diào)節(jié)作用可能只在腫瘤發(fā)展過程的某個(gè)特定階段起重要作用。 目的：神經(jīng)膠質(zhì)瘤的通用分級(jí)WHO分級(jí)因可能引入主觀因素并難以適應(yīng)個(gè)性化醫(yī)療等原因需要改進(jìn)與細(xì)化,本研究利用神經(jīng)膠質(zhì)瘤患者間的mRNA表達(dá)差異對(duì)其進(jìn)行生存分析...

【文章頁數(shù)】：70 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
圖表索引
英語縮略詞表
摘要
Abstract
第一部分 永生化上皮細(xì)胞拷貝數(shù)變異和表達(dá)數(shù)據(jù)的研究
    前言
        1. 肺癌及其癌前病變
        2. 腫瘤與細(xì)胞永生化
        3. 肺癌及癌前組織的基因組變化
        4. 研究目的及研究策略
    材料和方法
        1. 細(xì)胞培養(yǎng)
        2. 主要試劑或試劑盒
        3. 細(xì)胞收集及生物大分子的提取
        4. array-CGH實(shí)驗(yàn)流程
        5. mRNA表達(dá)譜芯片實(shí)驗(yàn)流程
        6. 數(shù)據(jù)分析
    結(jié)果
        1. DNA及RNA樣本的各項(xiàng)質(zhì)量控制
        2. array-CGH檢測(cè)的細(xì)胞拷貝數(shù)變異
            1) 永生化上皮細(xì)胞Y-BE的拷貝數(shù)變異
            2) 肺鱗癌NCI-H2170細(xì)胞的拷貝數(shù)變異
            3) 三組細(xì)胞拷貝數(shù)變異的對(duì)比觀察
        3. 表達(dá)譜芯片檢測(cè)的不同細(xì)胞系間基因表達(dá)情況
            1) 表達(dá)譜差異的整體情況及GO富集結(jié)果
            2) 表達(dá)譜與array-CGH結(jié)果的整合情況
    討論
        1. array-CGH芯片拷貝數(shù)變異分析
            1) 永生化上皮細(xì)胞Y-BE的拷貝數(shù)變異情況
            2) 肺鱗癌細(xì)胞NCI-H2170的拷貝數(shù)變異情況
            3) 拷貝數(shù)變異在三組細(xì)胞間的整體情況
        2. 表達(dá)譜芯片結(jié)果分析
            1) 永生化上皮細(xì)胞早晚代間的表達(dá)差異
            2) 腫瘤細(xì)胞相對(duì)于永生化上皮細(xì)胞的表達(dá)差異
            3) 表達(dá)譜芯片與array-CGH結(jié)果的整合情況
    小結(jié)
第二部分 基因組表達(dá)譜數(shù)據(jù)與神經(jīng)膠質(zhì)瘤的預(yù)后分析
    前言
        1. 神經(jīng)膠質(zhì)瘤及其通用分級(jí)
        2. 神經(jīng)膠質(zhì)瘤的分子特征與預(yù)后的關(guān)系
        3. 研究目的及研究策略
    材料和方法
        1. 臨床樣本的收集及患者隨訪
        2. 主要試劑或試劑盒
        3. RNA的提取及保存
        4. 利用Agilent(?)2100平臺(tái)對(duì)樣本RNA質(zhì)量進(jìn)行檢測(cè)
        5. 表達(dá)譜芯片實(shí)驗(yàn)
        6. 生物信息學(xué)分析
    結(jié)果
        1. RNA樣本的質(zhì)量檢驗(yàn)
        2. 用2512個(gè)基因?qū)颖具M(jìn)行聚類及主成分分析分析
        3. 分子網(wǎng)絡(luò)的獲得與分析
        4. 分子網(wǎng)絡(luò)的表達(dá)特點(diǎn)及關(guān)鍵基因
        5. 利用篩選基因?qū)颖镜念A(yù)后重新分析
    討論
        1. WHO分級(jí)對(duì)神經(jīng)膠質(zhì)瘤預(yù)后的作用及影響
        2. 分子網(wǎng)絡(luò)與神經(jīng)膠質(zhì)瘤的關(guān)系
        3. 神經(jīng)膠質(zhì)瘤的分子分型：?jiǎn)栴}與展望
    小結(jié)
參考文獻(xiàn)
文獻(xiàn)綜述
    參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷



本文編號(hào)：3753231