缺血性腦卒中不同亞型患者血漿miRNAs表達譜變化分析
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【摘要】:目的:研究缺血性腦卒中不同亞型患者血漿中mi RNAs(micro RNA)表達譜的差異。方法:1.選取2012年11—12月于青島大學附屬醫(yī)院神經內科就診的首次發(fā)病的16例患者,按TOAST分型將其分為大動脈粥樣硬化性(large artery atherosclerotic,LAA)卒中組8例,小動脈閉塞性(small artery occlusion,SAO)卒中組8例,以及同期健康體檢者8名作為對照組,應用高通量測序法檢測各組血漿中mi RNAs的表達譜,篩選出差異表達的mi RNAs。2.采用實時熒光定量PCR法對其中的mi R-146b-5p、mi R-23a-3p、mi R-451a進行驗證。3.對篩選出的差異表達的mi RNAs進行靶基因預測及生物信息學分析。結果:1.LAA組、SAO組及對照組血漿中分別檢測到369個mi RNAs成熟體。通過mi RNAs差異分析,發(fā)現let-7a-5p、mi R-744-5p等12個mi RNAs在3組中均呈現差異性表達(表達差異均大于2倍,P0.01);與對照組比較,mi R-126-5p、mi R-23a-3p、mi R-143-3p等34個mi RNAs在LAA組表達顯著下調(表達差異均大于2倍,P0.01);在SAO組中mi R-1304-3p、mi R-451a較對照組表達顯著下調(表達差異均大于2倍,P0.01),而mi R-320a、mi R-320b、mi R-99b-5p等27個mi RNAs較對照組表達則顯著上調(表達差異均大于2倍,P0.01)。2.實時熒光定量PCR對其中的mi R-146b-5p、mi R-23a-3p、mi R-451a的驗證結果與高通量檢測結果一致。3.生物信息學分析表明,差異表達的mi RNAs調控的靶基因主要與細胞增殖、黏附、代謝等生物學功能相關。結論:LAA型卒中患者及SAO型卒中患者血漿mi RNAs表達譜存在明顯差異,提示mi RNAs可能通過靶基因在LAA及SAO的發(fā)病過程中發(fā)揮不同的調節(jié)作用。
【關鍵詞】:微小RNA 高通量測序 缺血性腦卒中 TOAST分型
【學位授予單位】:青島大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:R743.3
【目錄】:
- 摘要2-3
- Abstract3-7
- 引言7-9
- 第1章 材料9-11
- 1.1 研究對象9-10
- 1.2 實驗儀器及設備10
- 1.3 主要實驗試劑10-11
- 第2章 方法11-13
- 2.1 血液標本采集11
- 2.2 高通量測序檢測血漿miRNAs11
- 2.3 數據處理及分析11
- 2.4 熒光定量PCR驗證11-12
- 2.4.1 總RNA的提取11-12
- 2.4.2 qRT-PCR檢測目的miRNAs表達量12
- 2.5 miRNA的靶基因預測及功能分析12
- 2.6 統(tǒng)計學分析12-13
- 第3章 結果13-21
- 3.1 3組差異性表達的miRNAs13-14
- 3.2 實時熒光定量PCR驗證miRNAs高通量測序結果14-18
- 3.3 差異表達miRNAs的靶基因預測及生物學過程分析18
- 3.4 生物學過程分析結果18-21
- 第4章 討論21-23
- 第5章 結論23-24
- 參考文獻24-27
- 綜述27-38
- 參考文獻33-38
- 攻讀學位期間的研究成果38-39
- 致謝39-40
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