目的通過生物信息學(xué)方法分析特發(fā)性癲癇患者外周血中關(guān)鍵的差異表達(dá)基因（Differentially expressed genes,DEGs）及其生物學(xué)功能、細(xì)胞定位、參與的信號(hào)通路等,為特發(fā)性癲癇的發(fā)病機(jī)制及其防治研究提供新思路。方法從基因表達(dá)匯編（Gene expression omnibus,GEO）數(shù)據(jù)庫下載了于2020年1月共享的GEO數(shù)據(jù)系列GSE143272中的6個(gè)未用藥的特發(fā)性癲癇患者外周血樣本,8個(gè)丙戊酸鈉治療有效的特發(fā)性癲癇患者外周血樣本,以及10個(gè)健康對(duì)照樣本的基因芯片數(shù)據(jù);其次,在R軟件中使用limma包等篩選鑒定出DEGs。然后對(duì)所有74個(gè)DEGs采用了包括DAVID、STRING及Cytoscape里的Cytohubba應(yīng)用程序等方法進(jìn)行了基因功能注釋和通路富集分析、PPI網(wǎng)絡(luò)分析和關(guān)鍵基因分析。結(jié)果篩選確定了部分重要的關(guān)鍵DEGs,包括:TREML3P、KCNJ15、ORM1、RNA28S5、ELANE、RETN、ARG1、LCN2、SLPI、HP、PGLYRP1、BPI、DEFA4、TCN1、MPO、MMP9、CTSG、CXCL8、RNASE3、RNASE... 

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【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]癲癇遺傳學(xué)研究新進(jìn)展[J]. 蔣永莉,楊西愛,楊穎,江文.  中華神經(jīng)科雜志. 2017 (06)
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本文編號(hào)：3730706