研究目的:通過生物信息學方法分析缺血性腦卒中后的差異表達基因,探究該基因在缺血性腦卒中的作用靶點以及具體的機制。研究方法:從GEO數(shù)據(jù)庫中下載GSE1357數(shù)據(jù)集的原始數(shù)據(jù),利用R語言對數(shù)據(jù)進行預處理后篩選出差異表達基因。利用DAVID數(shù)據(jù)庫和蛋白互作網(wǎng)絡分析,篩選出關鍵的靶基因。隨后在大鼠腦組織、原代神經(jīng)元以及SH-SY5Y細胞上進行驗證其表達量的變化。最后通過TTC染色、FJC染色、CCK8和水腫測量等驗證該靶點對缺血性腦卒中的作用。結果:通過生物信息學分析,我們從2個正常海馬組織樣本和6個缺氧后海馬組織樣本得到了82個差異基因,包括66個下調(diào)的差異基因和16個上調(diào)的差異基因。GO分析顯示這些差異主要參與基因表達的正性調(diào)節(jié)、中樞神經(jīng)系統(tǒng)的發(fā)育、參與對脂多糖的應答反應、病毒遷入宿主細胞內(nèi)、參與對乙醇的應答反應等過程。KEGG通路富集分析顯示這些差異基因參與氧化磷酸化、帕金森的生成和可卡因的成癮等。通過PPI網(wǎng)絡分析,發(fā)現(xiàn)了6個關鍵基因:JUN、ATF3、HSPA1A、IMMT、PHB和TIMM44。最終進行后續(xù)實驗的差異基因:PHB1。經(jīng)過驗證,發(fā)現(xiàn)PHB1在腦組織的白質(zhì)和灰質(zhì)區(qū)域,... 

【文章頁數(shù)】：56 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
引言
實驗材料與方法
    1 實驗材料
    2 實驗項目、分組及方法
        2.1 實驗項目與分組
        2.2 生物信息學分析
        2.3 細胞實驗
        2.4 動物實驗
    3 統(tǒng)計學分析
結果
    1 差異基因的篩選
    2 差異基因的GO功能注釋和KEGG富集分析
    3 PPI網(wǎng)路分析和關鍵基因的篩選
    4 細胞OGD模型中PHB1的表達變化情況
    5 動物MCAO模型中PHB1的表達情況
    6 構建過表達PHB1的慢病毒
    7 PHB1可以減少大鼠的腦梗死體積
    8 PHB1可以改善神經(jīng)元受損的情況
    9 PHB1降低腦水腫含量
    10 PHB1降低OGD后SH-SY5Y細胞的死亡情況
討論
結論
參考文獻
綜述
    綜述參考文獻
攻讀學位期間的研究成果
附錄或縮略詞表
致謝



本文編號：3717588