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缺血性腦卒中患者急性期與恢復期全血轉錄組測序對比分析

發(fā)布時間:2022-12-09 04:41
  【目的】通過對比分析缺血性腦卒中患者的急性期與恢復期全血轉錄組測序結果的差異性,探索缺血性腦卒中神經(jīng)功能缺損改善的可能機制。【方法】采用縱向研究方法,納入6名符合納排標準的缺血性腦卒中患者,收集患者急性期與恢復期的全血并提取總RNA,對同一患者進行急性期與恢復期轉錄組測序,前后比較得到差異表達基因并進行GO分析和KEGG代謝通路分析!窘Y果】1.神經(jīng)功能缺損改善患者恢復期與急性期全血轉錄組測序結果對比發(fā)現(xiàn)差異表達基因共290條,其中上調(diào)的有177條,下調(diào)的有113條。2.通過GO分析,發(fā)現(xiàn)差異表達基因的功能主要富集在細胞內(nèi)外結構組成、線粒體呼吸鏈復合體、組蛋白去乙;恼{(diào)節(jié)、核轉錄mRNA分解代謝過程、T細胞分化調(diào)節(jié)、先天免疫激活信號轉導等方面。3.通過KEGG代謝通路分析,上調(diào)基因富集在Toll樣受體信號轉導途徑、IL-17信號傳導途徑、NOD信號傳導通路、NF-Kappa信號通路、MAPK信號通路、EB病毒感染、神經(jīng)營養(yǎng)素傳導途徑、血管內(nèi)皮生長因子信號傳導途徑等途徑、溶酶體、鞘脂信號通路等方面;下調(diào)基因富集在核糖體、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、酒精中毒、病毒致癌、DNA復制、蛋白質輸出、亨廷頓... 

【文章頁數(shù)】:69 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
主要英文縮略語索
第1章 緒論
第2章 材料與方法
    2.1 主要儀器與試劑
    2.2 研究對象
    2.3 實驗方法
第3章 結果
    3.1 病例信息
    3.2 樣本質控結果
    3.3 測序數(shù)據(jù)對比
    3.4 表達定量分析
    3.5 基因/轉錄本差異表達分析
    3.6 mRNA功能富集分析
第4章 討論
第5章 結論
參考文獻
綜述
    參考文獻
致謝



本文編號:3714844

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