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中國(guó)漢族特發(fā)性肌萎縮側(cè)索硬化全基因組關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時(shí)間:2022-08-01 17:17
  目的:肌萎縮側(cè)索硬化是一種運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元變性性疾病,目前發(fā)病機(jī)制尚不明確,但遺傳因素在發(fā)病機(jī)制中可能起很大作用。基因組篩查是一種有效尋找易感基因的方法,前期研究已發(fā)現(xiàn)了一些候選基因,但其研究對(duì)象多為歐美人群。為此,我們對(duì)中國(guó)漢族人群特發(fā)性肌萎縮側(cè)索硬化(sALS)進(jìn)行全基因組掃描,以期發(fā)現(xiàn)新的易感基因。方法:收集200名臨床確診中國(guó)漢族sALS患者和200健康中國(guó)漢族人血樣,提取基因組DNA,每個(gè)試驗(yàn)亞組樣品DNA等量混合,構(gòu)建病例組和對(duì)照組DNA混合池,通過全基因組SNP芯片高密度雜交分型,比較分析病例/對(duì)照各位點(diǎn)的等位基因頻率差異。找出與sALS相關(guān)差異有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的基因位點(diǎn)。結(jié)果:①經(jīng)臨床資料分析,病例組平均發(fā)病年齡(48.5±8.4)歲,40歲以前和80歲以后發(fā)病少見,男女發(fā)病比例1.5∶1;對(duì)照組平均年齡(59.8±11.6)歲,男女比例1.3:1;②通過質(zhì)量控制的有基因詮釋信息的SNPs位點(diǎn)859311個(gè),無基因詮釋信息的SNPs位點(diǎn)12670個(gè);發(fā)現(xiàn)8個(gè)新的可疑sALS風(fēng)險(xiǎn)基因位點(diǎn):INPP5B (kgp15327256), IQCF5/IQCF1(rs1605070),... 

【文章頁(yè)數(shù)】:53 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
中英文縮略詞
第1章 引言
第2章 材料與方法
    2.1 材料
        2.1.1 臨床實(shí)驗(yàn)對(duì)象來源
        2.1.2 主要試劑
        2.1.3 主要實(shí)驗(yàn)設(shè)備和儀器
    2.2 方法
        2.2.1 實(shí)驗(yàn)對(duì)象的分組及資料收集
        2.2.2 DNA 的提取
        2.2.3 DNA 質(zhì)量檢測(cè)
        2.2.4 基因芯片掃描
        2.2.5 臨床資料統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
        2.2.6 基因芯片掃描數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
        2.2.7 計(jì)算假陽性結(jié)果報(bào)告率
第3章 結(jié)果
    3.1 實(shí)驗(yàn)對(duì)象
        3.1.1 樣品構(gòu)成
        3.1.2 多態(tài)位點(diǎn)的等位基因頻率估計(jì)
    3.2 離群位點(diǎn)的確定
    3.3 樣品 DNA 中 ALS 相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)基因與國(guó)內(nèi)外已發(fā)現(xiàn)的 ALS 易感基因的對(duì)比
    3.4 通路分析
第4章 討論
    4.1 臨床資料分析
    4.2 本次研究新發(fā)現(xiàn)的最可能與中國(guó)漢族 sALS 發(fā)病相關(guān)的基因
        4.2.1 ITGA925
        4.2.2 ALCAM
        4.2.3 OPCML
第5章 結(jié)論
    5.1 結(jié)論
    5.2 進(jìn)一步工作的方向
致謝
參考文獻(xiàn)
附表 本次實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)的 SNP 及基因
攻讀學(xué)位期間的研究成果
綜述
    參考文獻(xiàn)



本文編號(hào):3667858

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