尿毒癥合并腦出血患者血清早期預(yù)警蛋白標記物的篩選
發(fā)布時間:2022-02-22 02:10
目的比較和鑒定尿毒癥及尿毒癥合并腦出血患者血清差異表達蛋白,篩選“特異性的蛋白質(zhì)分子”作為尿毒癥合并腦出血患者診斷及早期預(yù)警的生物標志物。方法收集南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院急診科尿毒癥患者血清及尿毒癥合并腦出血患者血清各6例,另收集健康成人血清標本6例,將標本分為3組:(1)尿毒癥患者組;(2)尿毒癥合并腦出血患者組;(3)健康成人對照組。將各組患者血清進行蛋白提取及酶解,再將樣品取適量肽段使用納升流速Easy nLC 1200色譜系(Thermo Scientific)進行色譜分離,肽段分離后用Q-Exactive Plus質(zhì)譜儀(Thermo Scientific)進行DDA(數(shù)據(jù)依賴采集)質(zhì)譜分,最終得到的LC-MS/MS原始數(shù)據(jù)導(dǎo)入Proteome Discoverer軟件(版本號2.2)中的搜索引擎Sequest HT進行數(shù)據(jù)庫檢索。利用生物信息學(xué)分析及其在尿毒癥腦出血病理生理學(xué)機制中的作用,篩選并鑒定差異表達蛋白作為生物標記物的候選蛋白,通過PRM方法對所篩選差異蛋白質(zhì)進行驗證。結(jié)果通過顯著性差異分析,共得出三組實驗結(jié)果,其中尿毒癥與正常對比組顯著差異表達蛋白共77個,上調(diào)蛋白7...
【文章來源】:南昌大學(xué)江西省211工程院校
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第1章 引言
第2章 材料與方法
2.1 材料
2.2 儀器和試劑
2.3 蛋白質(zhì)提取及酶解
2.4 LC-MS/MS分析
2.5 數(shù)據(jù)庫檢索
2.6 生物信息學(xué)分析
2.7 靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)
2.7.1 樣品制備
2.7.2 LC-PRM/MS分析
2.7.3 質(zhì)譜數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析
第3章 結(jié)果
3.1 蛋白濃度的測定
3.2 蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果統(tǒng)計
3.3 蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果比較
3.4 生物信息學(xué)分析
3.4.1 差異蛋白質(zhì)Gene ontology(GO)富集分析
3.4.2 差異性蛋白質(zhì)KEGG通路富集分析
3.4.3 差異性蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析
3.5 候選標記蛋白的確定
3.6 候選標記蛋白的驗證(PRM驗證)
3.6.1 質(zhì)譜Basepeak圖
3.6.2 目標肽段結(jié)果
3.6.3 目標蛋白質(zhì)定量結(jié)果
第4章 討論
第5章 結(jié)論
致謝
參考文獻
附錄
綜述
參考文獻
【參考文獻】:
期刊論文
[1]枸櫞酸抗凝行連續(xù)腎臟替代治療成功救治尿毒癥并發(fā)腦出血1例[J]. 丁道銀,胡泉,李雪,胡望平. 中國急救復(fù)蘇與災(zāi)害醫(yī)學(xué)雜志. 2019 (09)
[2]大鼠腦出血后72h腦組織的定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析[J]. 李曉芳,楊國鋒,劉麗,王魯寧. 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)雜志. 2017(02)
[3]腦出血中豆紋動脈出血易發(fā)點的流固耦合分析[J]. 許長興,張華,胡文超. 重慶理工大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)). 2016(04)
[4]α-內(nèi)收蛋白基因多態(tài)性與小動脈彈性的關(guān)系研究[J]. 蔣素華,李新立,張海鋒,王震震,德偉,袁櫟,黃峻. 中華心血管病雜志. 2004(04)
本文編號:3638480
【文章來源】:南昌大學(xué)江西省211工程院校
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第1章 引言
第2章 材料與方法
2.1 材料
2.2 儀器和試劑
2.3 蛋白質(zhì)提取及酶解
2.4 LC-MS/MS分析
2.5 數(shù)據(jù)庫檢索
2.6 生物信息學(xué)分析
2.7 靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)
2.7.1 樣品制備
2.7.2 LC-PRM/MS分析
2.7.3 質(zhì)譜數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析
第3章 結(jié)果
3.1 蛋白濃度的測定
3.2 蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果統(tǒng)計
3.3 蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果比較
3.4 生物信息學(xué)分析
3.4.1 差異蛋白質(zhì)Gene ontology(GO)富集分析
3.4.2 差異性蛋白質(zhì)KEGG通路富集分析
3.4.3 差異性蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析
3.5 候選標記蛋白的確定
3.6 候選標記蛋白的驗證(PRM驗證)
3.6.1 質(zhì)譜Basepeak圖
3.6.2 目標肽段結(jié)果
3.6.3 目標蛋白質(zhì)定量結(jié)果
第4章 討論
第5章 結(jié)論
致謝
參考文獻
附錄
綜述
參考文獻
【參考文獻】:
期刊論文
[1]枸櫞酸抗凝行連續(xù)腎臟替代治療成功救治尿毒癥并發(fā)腦出血1例[J]. 丁道銀,胡泉,李雪,胡望平. 中國急救復(fù)蘇與災(zāi)害醫(yī)學(xué)雜志. 2019 (09)
[2]大鼠腦出血后72h腦組織的定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析[J]. 李曉芳,楊國鋒,劉麗,王魯寧. 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)雜志. 2017(02)
[3]腦出血中豆紋動脈出血易發(fā)點的流固耦合分析[J]. 許長興,張華,胡文超. 重慶理工大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)). 2016(04)
[4]α-內(nèi)收蛋白基因多態(tài)性與小動脈彈性的關(guān)系研究[J]. 蔣素華,李新立,張海鋒,王震震,德偉,袁櫟,黃峻. 中華心血管病雜志. 2004(04)
本文編號:3638480
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