尿毒癥合并腦出血患者血清早期預(yù)警蛋白標(biāo)記物的篩選
發(fā)布時(shí)間:2022-02-22 02:10
目的比較和鑒定尿毒癥及尿毒癥合并腦出血患者血清差異表達(dá)蛋白,篩選“特異性的蛋白質(zhì)分子”作為尿毒癥合并腦出血患者診斷及早期預(yù)警的生物標(biāo)志物。方法收集南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院急診科尿毒癥患者血清及尿毒癥合并腦出血患者血清各6例,另收集健康成人血清標(biāo)本6例,將標(biāo)本分為3組:(1)尿毒癥患者組;(2)尿毒癥合并腦出血患者組;(3)健康成人對(duì)照組。將各組患者血清進(jìn)行蛋白提取及酶解,再將樣品取適量肽段使用納升流速Easy nLC 1200色譜系(Thermo Scientific)進(jìn)行色譜分離,肽段分離后用Q-Exactive Plus質(zhì)譜儀(Thermo Scientific)進(jìn)行DDA(數(shù)據(jù)依賴采集)質(zhì)譜分,最終得到的LC-MS/MS原始數(shù)據(jù)導(dǎo)入Proteome Discoverer軟件(版本號(hào)2.2)中的搜索引擎Sequest HT進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)檢索。利用生物信息學(xué)分析及其在尿毒癥腦出血病理生理學(xué)機(jī)制中的作用,篩選并鑒定差異表達(dá)蛋白作為生物標(biāo)記物的候選蛋白,通過(guò)PRM方法對(duì)所篩選差異蛋白質(zhì)進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果通過(guò)顯著性差異分析,共得出三組實(shí)驗(yàn)結(jié)果,其中尿毒癥與正常對(duì)比組顯著差異表達(dá)蛋白共77個(gè),上調(diào)蛋白7...
【文章來(lái)源】:南昌大學(xué)江西省211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:54 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第1章 引言
第2章 材料與方法
2.1 材料
2.2 儀器和試劑
2.3 蛋白質(zhì)提取及酶解
2.4 LC-MS/MS分析
2.5 數(shù)據(jù)庫(kù)檢索
2.6 生物信息學(xué)分析
2.7 靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)
2.7.1 樣品制備
2.7.2 LC-PRM/MS分析
2.7.3 質(zhì)譜數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
第3章 結(jié)果
3.1 蛋白濃度的測(cè)定
3.2 蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果統(tǒng)計(jì)
3.3 蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果比較
3.4 生物信息學(xué)分析
3.4.1 差異蛋白質(zhì)Gene ontology(GO)富集分析
3.4.2 差異性蛋白質(zhì)KEGG通路富集分析
3.4.3 差異性蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析
3.5 候選標(biāo)記蛋白的確定
3.6 候選標(biāo)記蛋白的驗(yàn)證(PRM驗(yàn)證)
3.6.1 質(zhì)譜Basepeak圖
3.6.2 目標(biāo)肽段結(jié)果
3.6.3 目標(biāo)蛋白質(zhì)定量結(jié)果
第4章 討論
第5章 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄
綜述
參考文獻(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]枸櫞酸抗凝行連續(xù)腎臟替代治療成功救治尿毒癥并發(fā)腦出血1例[J]. 丁道銀,胡泉,李雪,胡望平. 中國(guó)急救復(fù)蘇與災(zāi)害醫(yī)學(xué)雜志. 2019 (09)
[2]大鼠腦出血后72h腦組織的定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析[J]. 李曉芳,楊國(guó)鋒,劉麗,王魯寧. 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)雜志. 2017(02)
[3]腦出血中豆紋動(dòng)脈出血易發(fā)點(diǎn)的流固耦合分析[J]. 許長(zhǎng)興,張華,胡文超. 重慶理工大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)). 2016(04)
[4]α-內(nèi)收蛋白基因多態(tài)性與小動(dòng)脈彈性的關(guān)系研究[J]. 蔣素華,李新立,張海鋒,王震震,德偉,袁櫟,黃峻. 中華心血管病雜志. 2004(04)
本文編號(hào):3638480
【文章來(lái)源】:南昌大學(xué)江西省211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:54 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第1章 引言
第2章 材料與方法
2.1 材料
2.2 儀器和試劑
2.3 蛋白質(zhì)提取及酶解
2.4 LC-MS/MS分析
2.5 數(shù)據(jù)庫(kù)檢索
2.6 生物信息學(xué)分析
2.7 靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)
2.7.1 樣品制備
2.7.2 LC-PRM/MS分析
2.7.3 質(zhì)譜數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
第3章 結(jié)果
3.1 蛋白濃度的測(cè)定
3.2 蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果統(tǒng)計(jì)
3.3 蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果比較
3.4 生物信息學(xué)分析
3.4.1 差異蛋白質(zhì)Gene ontology(GO)富集分析
3.4.2 差異性蛋白質(zhì)KEGG通路富集分析
3.4.3 差異性蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析
3.5 候選標(biāo)記蛋白的確定
3.6 候選標(biāo)記蛋白的驗(yàn)證(PRM驗(yàn)證)
3.6.1 質(zhì)譜Basepeak圖
3.6.2 目標(biāo)肽段結(jié)果
3.6.3 目標(biāo)蛋白質(zhì)定量結(jié)果
第4章 討論
第5章 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄
綜述
參考文獻(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]枸櫞酸抗凝行連續(xù)腎臟替代治療成功救治尿毒癥并發(fā)腦出血1例[J]. 丁道銀,胡泉,李雪,胡望平. 中國(guó)急救復(fù)蘇與災(zāi)害醫(yī)學(xué)雜志. 2019 (09)
[2]大鼠腦出血后72h腦組織的定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析[J]. 李曉芳,楊國(guó)鋒,劉麗,王魯寧. 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)雜志. 2017(02)
[3]腦出血中豆紋動(dòng)脈出血易發(fā)點(diǎn)的流固耦合分析[J]. 許長(zhǎng)興,張華,胡文超. 重慶理工大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)). 2016(04)
[4]α-內(nèi)收蛋白基因多態(tài)性與小動(dòng)脈彈性的關(guān)系研究[J]. 蔣素華,李新立,張海鋒,王震震,德偉,袁櫟,黃峻. 中華心血管病雜志. 2004(04)
本文編號(hào):3638480
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