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COX-2基因rs20417、rs689466位點(diǎn)多態(tài)性與帕金森病發(fā)病相關(guān)性分析

發(fā)布時(shí)間:2021-11-08 09:19
  目的:本研究旨在探討環(huán)氧化酶-2(Cyclooxygenase-2,COX-2)基因的rs20417、rs689466位點(diǎn)多態(tài)性與帕金森。≒arkinson’s disease,PD)的相關(guān)性。方法:使用病例對(duì)照的研究方法,收集225例PD患者及231例年齡、性別相匹配的健康對(duì)照組的外周血并提取DNA,利用聚合酶鏈反應(yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)、瓊脂糖凝膠電泳、直接測(cè)序法測(cè)定COX-2基因rs20417、rs689466位點(diǎn)序列,從而進(jìn)行多態(tài)性分析。結(jié)果:PD組COX-2基因rs20417位點(diǎn)測(cè)序后發(fā)現(xiàn)GG型196例、CG型29例,未發(fā)現(xiàn)CC型,G等位基因頻率為93.6%,C等位基因頻率為6.4%,對(duì)照組COX-2基因rs20417位點(diǎn)測(cè)序后發(fā)現(xiàn)GG型207例、CG型24例,未發(fā)現(xiàn)CC型,G等位基因頻率為94.8%,C等位基因頻率為5.2%,PD組及對(duì)照組基因型分布及等位基因頻率比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。進(jìn)一步分層分析,PD組與對(duì)照組在年齡、性別、病情嚴(yán)重程度亞組間rs20417位點(diǎn)基因型分布以及等位基因頻率比較,差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)... 

【文章來源】:新疆醫(yī)科大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)

【文章頁數(shù)】:47 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

COX-2基因rs20417、rs689466位點(diǎn)多態(tài)性與帕金森病發(fā)病相關(guān)性分析


PCR產(chǎn)A:rs20417(604bp)位點(diǎn)A

位點(diǎn),測(cè)序,基因型,等位基因頻率


新疆醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文15圖2rs20417位點(diǎn)測(cè)序圖A:rs20417CG型B:rs20417GG型Fig.2Sequencediagramofrs20417siteA:CGtypeofrs20417B:GGtypeofrs204174PD組和對(duì)照組COX-2基因rs20417位點(diǎn)基因型分布和等位基因頻率4.1PD組與對(duì)照組rs20417位點(diǎn)基因型分布與等位基因頻率比較PD組和對(duì)照組rs20417位點(diǎn)中基因型GG與CC的頻率分別為87.1%、12.9%和89.6%、10.4%,等位基因G、C的頻率分別為93.6%、6.4%和94.8%、5.2%,基因型分布差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(2=0.693,P=0.405),等位基因頻率比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(2=0.650,P=0.420),見表4。表4PD組與對(duì)照組rs20417位點(diǎn)基因型分布與等位基因頻率比較Table4Comparisonofrs20417genotypeandalleledistributionbetweenPDandcontrolgroup組別基因型(%)P等位基因(%)PGGCGGCPD組196(87.1)29(12.9)0.405421(93.6)29(6.4)0.420對(duì)照組207(89.6)24(10.4)438(94.8)24(5.2)4.2不同年齡分層(≤50歲/>50歲)PD組和對(duì)照組rs20417位點(diǎn)基因型分布及等位基因頻率比較PD組和對(duì)照組rs20417位點(diǎn)EOPD組與≤50歲對(duì)照組基因型分布比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(2=0.835,P=0.361),等位基因頻率比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(2=0.756,P=0.385);LOPD組與>50歲對(duì)照組基因型分布比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(2=0.451,P=0.502),等位基因頻率比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(2=0.425,P=0.514);EOPD組與LOPD組基因型分布比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(2=2.355,

位點(diǎn),測(cè)序,基因型,等位基因頻率


新疆醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文17表7不同病情嚴(yán)重程度rs20417位點(diǎn)基因型分布和等位基因頻率分布的比較Table7Thecomparisonofrs20417genotypeandallelefrequenciesindifferentseverityofdisease組別基因型(%)P等位基因(%)PGGCGGCH-Y<3126(85.1)22(14.9)0.349266(92.6)22(7.4)0.347H-Y≥369(89.5)8(10.5)144(94.7)8(5.3)5COX-2基因rs689466位點(diǎn)測(cè)序結(jié)果病例組共送檢225例,rs689466位點(diǎn)TT型107例,CT型87例,CC型31例。對(duì)照組共送檢231例,rs689466位點(diǎn)TT型84例,CT型102例,CC型45例,直接測(cè)序結(jié)果見圖3,可見圖中純合為單峰圖,雜合則為雙峰圖。圖3rs689466位點(diǎn)測(cè)序圖A:rs689466CC型B:rs689466CT型C:rs689466TT型Fig.3Sequencediagramofrs689466siteA:CCtypeofrs689466B:CTtypeofrs689466C:TTtypeofrs6894666PD組和對(duì)照組COX-2基因rs689466位點(diǎn)基因型分布和等位基因頻率6.1PD組與對(duì)照組rs689466位點(diǎn)基因型分布與等位基因頻率比較PD組和對(duì)照組rs689466位點(diǎn)中基因型TT、TC、TT的頻率分別為47.6%、38.7%、

【參考文獻(xiàn)】:
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本文編號(hào):3483450

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