帕金森病患者血漿外泌體的分離鑒定及miRNA表達譜分析
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【摘要】:背景:microRNA(miRNA)是一種小的非編碼RNA,通過促進靶mRNA降解或抑制其翻譯起到轉錄后調節(jié)作用,近年來有研究報道m(xù)iRNA參與帕金森病(Parkinson's disease,PD)的發(fā)生發(fā)展,且某些差異表達的miRNA有助于PD的診斷。目的:對比分析PD患者與對照者血漿外泌體中的miRNA,并進行靶基因預測及KEGG通路分析,以尋找出有意義的miRNA。方法:1、分別收集13例散發(fā)性PD患者及與其年齡性別相匹配的健康對照者的血漿樣本。2、用Invitrogen試劑盒從血漿中分離外泌體,通過q Nano測定濃度及大小分布,Western blot檢測外泌體標記蛋白CD63、Alix的表達以對其進行鑒定。3、使用高通道測序檢測兩組血漿外泌體miRNA的表達差異。4、使用miRNA靶基因預測軟件對mi R-10a-5p、mi R-485-5p、mi R-15b和mi R-195進行靶基因預測,并對預測的靶基因進行KEGG通路分析。結果:1、從血漿中分離出mode直徑100nm、表達外泌體標記蛋白CD63和Alix的粒子,鑒定為外泌體。2、在表達明顯差異(Ratio2.0,P0.05)的miRNA中,與對照組相比,PD組以上調為主(65.3%)。3、mi R-10a-5p、mi R-485-5p、mi R-15b和mi R-195預測的靶基因均參與神經營養(yǎng)因子信號通路。結論:1、本研究成功分離并鑒定了血漿外泌體。2、血漿外泌體mi R-10a-5p、mi R-485-5p、mi R-15b和mi R-195有望作為PD的生物標志物。
【關鍵詞】:帕金森病 外泌體 血漿 微小RNA
【學位授予單位】:南昌大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:R742.5
【目錄】:
- 摘要3-5
- ABSTRACT5-10
- 第1章 前言10-12
- 第2章 材料與方法12-23
- 2.1 實驗材料12-14
- 2.1.1 主要試劑與材料12-13
- 2.1.2 主要儀器13-14
- 2.1.3 主要試劑的配制14
- 2.2 實驗方法14-23
- 2.2.1 研究對象14-15
- 2.2.2 血漿樣品收集15
- 2.2.3 血漿外泌體分離15-16
- 2.2.4 qNano分析血漿外泌體的濃度和大小分布16
- 2.2.5 Western blot鑒定血漿外泌體的標志蛋白16-18
- 2.2.6 血漿外泌體的RNA提取及濃度測定18-19
- 2.2.7 文庫構建及測序19-22
- 2.2.8 統(tǒng)計學方法22-23
- 第3章 結果23-28
- 3.1 外泌體的鑒定23-24
- 3.2 外泌體RNA濃度測定24
- 3.3 外泌體miRNA測序結果分析24-28
- 3.3.1 樣本測序結果的基本情況24
- 3.3.2 兩組共表達及特異表達的外泌體miRNA24-25
- 3.3.3 兩組外泌體miRNA的表達差異分析25-26
- 3.3.4 靶基因預測26
- 3.3.5 KEGG通路分析26-28
- 第4章 討論28-30
- 第5章 結論與展望30-31
- 致謝31-32
- 參考文獻32-35
- 攻讀學位期間的研究成果35-36
- 綜述36-42
- 參考文獻40-42
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