目的:通過對PD組與對照組之間的腸道菌群進(jìn)行差異性研究,并進(jìn)一步分析PD組免疫炎癥（Tfh細(xì)胞、Tfr細(xì)胞和CD19+B細(xì)胞,以及IL-4、IL-10、IL-21和TGF-β）及維生素（維生素B2、3、5、6、12和25-羥維生素D）與差異性顯著的腸道菌群的相關(guān)性,探討免疫炎癥和維生素在“微生物-腸-腦軸”對帕金森病發(fā)病機(jī)制中的可能作用。方法:選取就診于白求恩第一醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科的PD患者16例,以及相匹配的健康對照者16例,首先通過16S-rRNA基因測序確定糞便樣品中的微生物種類,分析了PD組與對照組之間腸道菌群的豐富度、多樣性,以及每個分類單元下腸道菌群的差異;然后通過流式細(xì)胞術(shù)檢測PD組外周血Tfh細(xì)胞及Tfr細(xì)胞的水平,以及通過流式液相多重蛋白定量技術(shù)檢測PD組外周血中中IL-4、IL-10、IL-21及TGF-β的水平,分析上述免疫細(xì)胞及炎癥因子水平與腸道菌群的相關(guān)性;最后從PD組隨機(jī)抽取了8例患者,通過串聯(lián)質(zhì)譜檢測外周血維生素B族（B2、3、5、6、12）和25-羥維生素D的水平,分析上述維生素水平與腸道菌群的相關(guān)性結(jié)果:（1）PD組和對照組之間腸道菌群分布的差異:通過等級豐... 

【文章來源】：吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：57 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

PD患者腸道菌群豐富度和多樣性指數(shù)的變化

第4章結(jié)果21我們首先使用LEfSe(LDAEffectSize)分析來識別組間差異顯著的物種，該分析將統(tǒng)計(jì)意義與生物學(xué)一致性和效果相關(guān)性相結(jié)合。在LDA閾值設(shè)置為4的情況下，我們發(fā)現(xiàn)1個綱，1個目，1個屬和1個種的相對豐度在PD組與對照組之間存在顯著差異（圖4.2）。為了進(jìn)一步研究各分類層級下組間的差異物種，我們對PD組和對照組之間的腸道菌群相對豐度進(jìn)行了t檢驗(yàn)，找出各分類水平下兩組間差異顯著的物種以便進(jìn)一步研究。通過t檢驗(yàn)我們發(fā)現(xiàn)1個綱，1個目，3個科，9個屬、4個種的相對豐度在PD組和對照組之間存在顯著差異（圖4.3）。AB圖4.2通過LEfSe分析檢測PD患者與對照組之間的腸道菌群差異。（A）LDA值分布柱狀圖：顯示LDA分?jǐn)?shù)大于設(shè)置值4的分類單元，即組之間差異顯著的物種。（B）進(jìn)化分枝圖：用于顯示已識別分類單元的分類結(jié)構(gòu)和相對豐度的條形圖。不同分類級別上的小圓圈代表該水平下的分類，圓圈直徑大小與相對豐度大小呈正比。

第4章結(jié)果23圖4.3通過t檢驗(yàn)可檢測出PD患者與對照組之間的腸道菌群差異。比較PD組與對照組在綱、目、科、屬、種水平上的腸道菌群差異。僅繪制具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的分類單元。圖的左側(cè)部分為組間差異物種豐度展示，圖中每個條形表示在分組間豐度差異顯著的物種在每個組中的均值。圖的右邊部分為組間差異置信度展示，圖中每個圓圈最左端點(diǎn)表示均值差95%置信區(qū)間下限，圓圈的最右端點(diǎn)表示均值差95%置信區(qū)間上限。圓圈的圓心代表的是均值的差。圓圈顏色所代表的組為均值高的組。展示結(jié)果的最右端是對應(yīng)差異物種的組間顯著性檢驗(yàn)p值。4.2臨床癥狀與腸道菌群的相關(guān)性分析接下來我們對PD患者臨床因素（年齡、病程、H-Y分期、UPDRS-III及NMSS得分）與腸道菌群進(jìn)行了Spearman相關(guān)分析，以研究臨床因素與腸道菌群豐富度之間的關(guān)系（如圖4.4）。我們發(fā)現(xiàn)PD相關(guān)的臨床評分（UPDRS-III及NMSS得分）是在各分類水平上與腸道菌群豐度呈正相關(guān)或負(fù)相關(guān)的最有影響力的因素。最后我們重點(diǎn)關(guān)注了PD組中有差異的菌群與臨床因素的相關(guān)性，發(fā)現(xiàn)除了Acidaminococcaceae與NMSS呈負(fù)相關(guān)，Bacilli及Lactobacillales與BMI呈負(fù)相關(guān)，其余菌群與臨床癥狀無明顯相關(guān)性。


本文編號：3240285