難治性癲癇腦組織miRNA表達(dá)差異
發(fā)布時(shí)間:2021-06-13 17:44
目的:采用miRNA芯片技術(shù)檢測(cè)難治性癲癇患者腦組織中miRNA表達(dá)變化,篩選出表達(dá)差異有意義的miRNA,探討其在難治性癲癇發(fā)病中的作用及意義,為難治性癲癇治療提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。方法:1.標(biāo)本獲得實(shí)驗(yàn)組:從已建立的重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院難治性癲癇患者術(shù)后腦組織庫(kù)中隨機(jī)抽取6例樣本。對(duì)照組:重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院非癲癇患者術(shù)后腦組織庫(kù)中隨機(jī)抽取4例樣本。2.應(yīng)用Trizol試劑提取總RNA,甲醛瓊脂糖凝膠電泳測(cè)定RNA完整性及分光光度計(jì)分別于240nm、260nm和280nm測(cè)定吸光度值以判定總RNA純度及濃度。3.miRNA微陣列芯片研究難治性癲癇患者腦組織與非癲癇患者腦組織中miRNA表達(dá)差異,篩選出倍數(shù)變化(F/C)≥1.5且P<0.05的miRNA并對(duì)表達(dá)差異的miRNA進(jìn)行聚類(lèi)分析。結(jié)果:通過(guò)miRNA芯片篩選出表達(dá)差異顯著miRNA基因13個(gè),其中上調(diào)基因11個(gè),分別是miR-10a、miR-374c、miR-376a、miR-425、miR-9、miR-224、hsa-miR-26a、let-7c、let-7a、miR-23c及miR-378c,下調(diào)基因2個(gè),分別是miR...
【文章來(lái)源】:重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市
【文章頁(yè)數(shù)】:51 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
RNA凝膠電泳圖
圖 4.1 表達(dá)差異 miRNA 火山圖Figure 4.1 volcano plot of differential miRNA注:橫 標(biāo)為 log2(F/C), 標(biāo)為-log (P value),紅色圓點(diǎn)即為變化超過(guò) 1.5 倍且 PiRNA。類(lèi)分析由于各樣本間 miRNA 表達(dá)差異不同,將所得芯片數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類(lèi)分析促使越相似的 miRNA 聚在一起,得到樹(shù)狀圖并以熱圖方式顯示使結(jié)果更加直,以此分辨不同樣本間不同 miRNA 表達(dá)差異,見(jiàn)圖 8.1。
18圖 5.1 表達(dá)差異 miRNAs 聚類(lèi)分析圖igure 5.1 Hierarchical clustering images of differential miRNAs 個(gè) miRNA, 每 代表 個(gè)樣本。左側(cè)為 miRNA 聚 樹(shù),頂端為樣本聚 樹(shù)。紅色示色示相對(duì)較低表達(dá)。頂端為顏色標(biāo)尺,從左至右依次標(biāo)書(shū)差異表達(dá)由低到高。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]肝細(xì)胞癌組織中microRNA表達(dá)譜研究[J]. 王傳璽,宋偉,李增軍,宋寶,吳德華,孫愛(ài)民,陳龍華. 南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2010(05)
[2]MicroRNA在人結(jié)腸癌干細(xì)胞中的表達(dá)譜[J]. 鄒健,于曉峰,虞陽(yáng),張穎,史冬梅,董潔,李天奇,劉雪靜. 世界華人消化雜志. 2010(02)
[3]與心臟相關(guān)的miRNAs研究[J]. 劉博,秦永文. 國(guó)際心血管病雜志. 2009(01)
[4]32例原發(fā)性中樞神經(jīng)系統(tǒng)惡性淋巴瘤臨床分析及文獻(xiàn)復(fù)習(xí)[J]. 易基群,林桐榆,何友兼,黃慧強(qiáng),夏忠軍,夏云飛,徐瑞華,郭穎,管忠震. 癌癥. 2006(04)
本文編號(hào):3228009
【文章來(lái)源】:重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市
【文章頁(yè)數(shù)】:51 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
RNA凝膠電泳圖
圖 4.1 表達(dá)差異 miRNA 火山圖Figure 4.1 volcano plot of differential miRNA注:橫 標(biāo)為 log2(F/C), 標(biāo)為-log (P value),紅色圓點(diǎn)即為變化超過(guò) 1.5 倍且 PiRNA。類(lèi)分析由于各樣本間 miRNA 表達(dá)差異不同,將所得芯片數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類(lèi)分析促使越相似的 miRNA 聚在一起,得到樹(shù)狀圖并以熱圖方式顯示使結(jié)果更加直,以此分辨不同樣本間不同 miRNA 表達(dá)差異,見(jiàn)圖 8.1。
18圖 5.1 表達(dá)差異 miRNAs 聚類(lèi)分析圖igure 5.1 Hierarchical clustering images of differential miRNAs 個(gè) miRNA, 每 代表 個(gè)樣本。左側(cè)為 miRNA 聚 樹(shù),頂端為樣本聚 樹(shù)。紅色示色示相對(duì)較低表達(dá)。頂端為顏色標(biāo)尺,從左至右依次標(biāo)書(shū)差異表達(dá)由低到高。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]肝細(xì)胞癌組織中microRNA表達(dá)譜研究[J]. 王傳璽,宋偉,李增軍,宋寶,吳德華,孫愛(ài)民,陳龍華. 南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2010(05)
[2]MicroRNA在人結(jié)腸癌干細(xì)胞中的表達(dá)譜[J]. 鄒健,于曉峰,虞陽(yáng),張穎,史冬梅,董潔,李天奇,劉雪靜. 世界華人消化雜志. 2010(02)
[3]與心臟相關(guān)的miRNAs研究[J]. 劉博,秦永文. 國(guó)際心血管病雜志. 2009(01)
[4]32例原發(fā)性中樞神經(jīng)系統(tǒng)惡性淋巴瘤臨床分析及文獻(xiàn)復(fù)習(xí)[J]. 易基群,林桐榆,何友兼,黃慧強(qiáng),夏忠軍,夏云飛,徐瑞華,郭穎,管忠震. 癌癥. 2006(04)
本文編號(hào):3228009
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