目的:煙霧�。╩oyamoya disease,MMD）,又稱腦基底異常網(wǎng)狀血管病,是一種病因不明的慢性腦血管閉塞性疾病。為了解煙霧病環(huán)狀RNA（circular RNA,circRNA）表達(dá)譜特征,我們應(yīng)用lllumina-Seq技術(shù)對煙霧病患者的全血進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組深度測序。通過對煙霧病患者及健康對照之間差異表達(dá)的circRNA篩選、驗證及對高通量結(jié)果生物信息學(xué)分析,并進(jìn)一步對聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)結(jié)果進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,構(gòu)建差異表達(dá)circRNA可能的ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。為深入認(rèn)識circRNA在煙霧病中的分子生物學(xué)機(jī)制奠定基礎(chǔ)。方法:1、對5例煙霧病患者及5例健康對照者的全血樣本應(yīng)用lllumina-Seq技術(shù)進(jìn)行sRNA及轉(zhuǎn)錄組深度測序,分析并篩選circRNA差異表達(dá)譜;2、選擇circRNA進(jìn)行進(jìn)一步擴(kuò)大樣本量的驗證。在8例煙霧病患者及7例正常對照中,應(yīng)用實時熒光定量PCR的方法檢測篩選出的六條circRNA在擴(kuò)大樣本中的表達(dá)水平;3、使用軟件對高通量的結(jié)果進(jìn)行生物信息學(xué)分析,對差異表達(dá)的circRNA來源基因進(jìn)行GO富集和KEGG功能富集分析;4、聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù),對差異表達(dá)的cir... 

【文章來源】：中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省

【文章頁數(shù)】：66 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

各樣品所有circRNA的概率密度分布圖

中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文16圖1各樣品所有circRNA的概率密度分布圖注：橫坐標(biāo)為log10(count)，log10（count）越高，表示RNA表達(dá)量越高；縱坐標(biāo)為circRNA的密度，即為橫軸表達(dá)量所對應(yīng)的circRNA的數(shù)目占全部circRNA總量的比值；圖中每種顏色表示一個樣本，所有概率的總和為1，即每個區(qū)域的面積均為1；密度曲線的峰值表示整個樣本circRNA表達(dá)量最集中的區(qū)域3.3.2.3差異circRNA表達(dá)火山圖圖2差異circRNA表達(dá)火山圖注：①藍(lán)色的點代表表達(dá)無差異基因，紅色的點代表上調(diào)的基因，綠色的點代表下調(diào)的基因。

中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文 ②縱坐標(biāo)為校正后的 p 值的-log10，縱坐標(biāo)越靠上 p 值的-log10（padj）越大，p 值本身越小，表示差異越顯著。因此，左上角的點表示表達(dá)水平差異非常顯著的下調(diào)基因，右上角的點表示表達(dá)水平差異非常顯著的上調(diào)基因。 3.3.2.4 差異 circRNA 表達(dá)熱圖 我們對篩選出的具有差異表達(dá) circRNA 的來源基因進(jìn)行了層次聚類分析，就是指將具有相同或相似表達(dá)行為的 circRNA 進(jìn)行聚類，結(jié)果如下圖。


本文編號：3099066