發(fā)布時間：2021-01-27 09:43

　　蛛網(wǎng)膜下腔出血（Subarachnoid Hemorrhage,SAH）是指血液流入蛛網(wǎng)膜下腔（即蛛網(wǎng)膜與大腦周圍軟腦膜之間的區(qū)域）。SAH是一種臨床綜合癥,具有發(fā)病范圍廣、死亡率高、致殘率高、臨床預后不良等特點,一直以來是基礎和臨床醫(yī)學的研究重點和難點。為了降低SAH的發(fā)病率和死亡率,人們對SAH的發(fā)病機制展開了大量研究。近年來有研究發(fā)現(xiàn)早期腦損傷（EBI）可能是導致SAH患者預后不良的主要原因,尋找能夠減輕SAH后EBI及相關并發(fā)癥的治療藥物、有效靶點,預測和預防SAH是目前研究的重點方向。由于當前針對SAH藥物的研究主要是從臨床實驗的層面選擇藥物,并未考慮從細胞信號通路層面討論相關藥物的作用,因此本研究的第一個科學問題在于,LCN2在細胞信號通路層面是否可以有效地干預或治療SAH。由于以往研究主要通過臨床醫(yī)學實驗在小范圍的分子層面尋找能夠預測或治療SAH的有效靶點,為此本研究的第二個科學問題在于,是否可以通過考慮SAH疾病和LCN2藥效因素,在全基因組層面分析和篩選有效的基因靶點。由于以往在SAH的早期預測主要依靠診斷影像或臨床自動化數(shù)據(jù),不僅準確率不高而且很少采用基因數(shù)據(jù),因此... 

【文章來源】：西南大學重慶市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：67 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

信號通路研究及干預實驗

西南大學碩士學位論文持續(xù)很長一段時間[60]，SAH 后腦白質(zhì)損傷的研究可能是未來 S方向[61]。因此，本研究采用的實驗樣本為小鼠白質(zhì)區(qū)腦細胞。原軍陸軍軍醫(yī)大學西南醫(yī)院神經(jīng)外科提供，樣本基因芯片共 10 張組（共 5 張）和空白對照組 normal-1（共 5 張）；采用的芯x-GeneChip Mouse Gene 1.0 STArray。證實驗結(jié)果的準確度，在對原始芯片進行預處理前，質(zhì)量分析是對基因芯片樣本的質(zhì)量控制及評估，來篩除不合格的樣本。利ctor 包對原始芯片（SAH 患病組和對照組 normal-1）進行質(zhì)量控芯片樣本的灰度圖并進行觀察。根據(jù) 2.1.1 節(jié)介紹的資料，各芯稱和四個角花紋均很清晰，明暗適中，未發(fā)現(xiàn)其他問題。然后我本的 RLE 箱線圖，如下圖所示：

第 3 章 信號通路研究及干預實驗因表達的實驗主要是為了比較某物種的基因在不同條件下的表達是及差異是什么，這是研究基因調(diào)控網(wǎng)絡的基礎。該差異可以是統(tǒng)計可以是生物學上的差異，所以一般選擇至少兩個閾值（如基因表達著性量度）來計算差異表達基因，這是一種符合生物學意義的方法基因的方法一般是先計算基因表達量，然后利用統(tǒng)計學分析來尋找著性差異的基因。這里我們采用 e-Bayes 方法，它是目前在差異表的方法之一[49]，參數(shù)設置為Fold change 1.5，且p-value 0.05。其[62]表示實驗組比上對照組的差異表達倍數(shù)，根據(jù)不同實驗情況，常 倍[63]、1.5 倍[64,65]或 2.5 倍[66]等。通過計算得到差異表達基因共有結(jié)果見附件 1），占總基因數(shù)目（28944 個）的 10.16%，其中表達的基因有 1016 個，表現(xiàn)為下調(diào)的基因有 1926 個。根據(jù)差異篩選 change與p-value兩個參數(shù)來繪制火山圖，結(jié)果見圖 3.3。

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3002841