常規(guī)MRI影像組學結合機器學習預測膠質瘤分級的臨床研究
發(fā)布時間:2021-01-07 22:53
目的:基于常規(guī)MRI影像組學建立機器學習模型,探討模型在預測腦膠質瘤術前分級中的臨床價值。方法:回顧性搜集經病理證實的211例腦膠質瘤患者的臨床及影像資料,包括世界衛(wèi)生組織Ⅱ級65例、Ⅲ級61例、Ⅳ級85例。所有患者術前均行MRI檢查,包括軸位T2加權圖像(T2WI)、三維對比增強T1加權圖像(3D-CET1WI)。對腫瘤感興趣區(qū)進行逐層手動勾畫并插值成感興趣容積后進行影像組學特征提取,包括一階統(tǒng)計特征、形狀特征、紋理特征及基于過濾器類。采用方差選擇法、單變量選擇法、最小絕對收縮選擇算子對特征篩選降維。納入樣本隨機分離,訓練集樣本和驗證集樣本的比值為9:1。建立支持向量機(SVM)、極限梯度增強樹(XGBoost)、K鄰近(KNN)機器學習模型,通過模型對膠質瘤Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ級進行預測,并計算模型曲線下面積(AUC)、敏感性、特異性。結果:基于T2WI建立的機器學習模型預測膠質瘤分級的AUC:KNN模型預測膠質瘤Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ級的AUC分別為0.619、0.750及0.868,SVM模型預測膠質瘤Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ級的AUC分別為0.648、0.781及0.863,XG Boost模型預測膠質瘤Ⅱ、Ⅲ...
【文章來源】:蘭州大學甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】:55 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
自2012年影像組學相關刊物統(tǒng)計
蘭州大學碩士學位論文常規(guī)MRI影像組學結合機器學習預測膠質瘤分級的臨床研究6第二章資料與方法2.1病人臨床資料2.1.1一般資料回顧性搜集本院2016年3月至2018年10月期間經病理證實為腦膠質瘤患者影像及臨床資料。根據納入和排除標準確定最終研究對象。納入標準:①穿刺活檢或手術切除后經病理組織證實為膠質瘤患者,腫瘤位于小腦幕上;②MRI掃描前,患者未經過任何激素、放化療、穿刺等治療或手術史;③術前接受本院SiemensVerio3.0TMRI掃描,并可獲得治療前的圖像(包括3D-CET1WI和軸位T2WI)。排除標準:①術前影像資料和/或病理組織學資料為外院者、病理組織學結果不明確者;②MRI掃描前有上述治療史的患者;③MRI圖像質量不佳(運動偽影、金屬偽影等)④缺少本院3D-CET1WI和/或軸位T2WI者。本研究初步納入397例,其中序列不全者124例,MRI圖像質量不佳者8例,MRI檢查前有放化療等手術史者5例,術前未做本院MRI檢查者22例,病理組織學結果有爭議者3例,掃描機型不符合者9例,腫瘤位于小腦位小幕下者12例,影像組學特征提取失敗者3例。研究最終納入211例患者,男性127例,女性84例,年齡在11~75歲之間。其中WHOII級65例,男性40例,女性25例,年齡11~64歲;WHOIII級61例,男性28例,女性23例,年齡14~65歲;WHOIV級85例,男性49例,女性36例,年齡13~75歲;颊叩木唧w納入過程如圖2-1所示。圖2-1本研究患者具體納入及排除過程
蘭州大學碩士學位論文常規(guī)MRI影像組學結合機器學習預測膠質瘤分級的臨床研究8隨機選取20例患者MRI圖像,由同一名診斷醫(yī)師間隔1個月前后重復2次進行ROI勾畫后提取特征,用組內相關性系數(Intraclasscorrelationcoefficient,ICC)分析觀察者前后兩次提取特征一致性,ICC>0.750一致性好。圖2-2腫瘤ROI的勾畫。A、B圖分別為軸位T2WI及腫瘤的ROI;C、圖為利用T2WI的ROI重建的VOI;D、E圖分別為3D-CET1WI及矢狀位腫瘤的ROI;F、圖利用3D-CET1WI的ROI重建的VOI圖2-3WHOⅡ級(彌漫型星形細胞瘤)患者。A、DWI圖像;B、T2WI軸位勾畫ROI;C、匯醫(yī)慧影組學平臺三維界面上,3D-CET1WI矢狀位勾畫ROI
本文編號:2963395
【文章來源】:蘭州大學甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】:55 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
自2012年影像組學相關刊物統(tǒng)計
蘭州大學碩士學位論文常規(guī)MRI影像組學結合機器學習預測膠質瘤分級的臨床研究6第二章資料與方法2.1病人臨床資料2.1.1一般資料回顧性搜集本院2016年3月至2018年10月期間經病理證實為腦膠質瘤患者影像及臨床資料。根據納入和排除標準確定最終研究對象。納入標準:①穿刺活檢或手術切除后經病理組織證實為膠質瘤患者,腫瘤位于小腦幕上;②MRI掃描前,患者未經過任何激素、放化療、穿刺等治療或手術史;③術前接受本院SiemensVerio3.0TMRI掃描,并可獲得治療前的圖像(包括3D-CET1WI和軸位T2WI)。排除標準:①術前影像資料和/或病理組織學資料為外院者、病理組織學結果不明確者;②MRI掃描前有上述治療史的患者;③MRI圖像質量不佳(運動偽影、金屬偽影等)④缺少本院3D-CET1WI和/或軸位T2WI者。本研究初步納入397例,其中序列不全者124例,MRI圖像質量不佳者8例,MRI檢查前有放化療等手術史者5例,術前未做本院MRI檢查者22例,病理組織學結果有爭議者3例,掃描機型不符合者9例,腫瘤位于小腦位小幕下者12例,影像組學特征提取失敗者3例。研究最終納入211例患者,男性127例,女性84例,年齡在11~75歲之間。其中WHOII級65例,男性40例,女性25例,年齡11~64歲;WHOIII級61例,男性28例,女性23例,年齡14~65歲;WHOIV級85例,男性49例,女性36例,年齡13~75歲;颊叩木唧w納入過程如圖2-1所示。圖2-1本研究患者具體納入及排除過程
蘭州大學碩士學位論文常規(guī)MRI影像組學結合機器學習預測膠質瘤分級的臨床研究8隨機選取20例患者MRI圖像,由同一名診斷醫(yī)師間隔1個月前后重復2次進行ROI勾畫后提取特征,用組內相關性系數(Intraclasscorrelationcoefficient,ICC)分析觀察者前后兩次提取特征一致性,ICC>0.750一致性好。圖2-2腫瘤ROI的勾畫。A、B圖分別為軸位T2WI及腫瘤的ROI;C、圖為利用T2WI的ROI重建的VOI;D、E圖分別為3D-CET1WI及矢狀位腫瘤的ROI;F、圖利用3D-CET1WI的ROI重建的VOI圖2-3WHOⅡ級(彌漫型星形細胞瘤)患者。A、DWI圖像;B、T2WI軸位勾畫ROI;C、匯醫(yī)慧影組學平臺三維界面上,3D-CET1WI矢狀位勾畫ROI
本文編號:2963395
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