基于二代測(cè)序靶向捕獲技術(shù)的遺傳性痙攣性截癱一家系致病基因的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-01-01 16:47
目的:遺傳性痙攣性截癱(Hereditary spastic paraplegias,HSPs)是一組具有臨床和遺傳異質(zhì)性的神經(jīng)退行性疾病,伴有進(jìn)行性下肢痙攣和無(wú)力。本研究旨在應(yīng)用靶向捕獲二代測(cè)序技術(shù)(Targeted-Capture Next Generation Sequencing,TCNGS)為一個(gè)中國(guó)HSP家系所患疾病做出準(zhǔn)確的基因診斷,并為家系成員遺傳咨詢等提供依據(jù)。方法:以該HSP家系3代共11人為研究對(duì)象,繪制家系圖譜。獲取知情同意后,采集II代4人,III代5人的外周血樣,抗凝并提取全血基因組DNA(g DNA)。同時(shí)對(duì)他們進(jìn)行詳細(xì)的病史采集及體格檢查,并著重對(duì)3名患者收集包括顱腦磁共振檢查(Magnetic Resonance Imaging,MRI)、肌電圖(Electromyogram,EMG)等在內(nèi)的其他臨床輔助檢查資料。首先,我們對(duì)先證者(II-1)的g DNA樣本進(jìn)行靶向捕獲二代測(cè)序,將得到的結(jié)果與Human參考基因組數(shù)據(jù)庫(kù)、千人基因組數(shù)據(jù)庫(kù)、db SNP142數(shù)據(jù)庫(kù)等有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行對(duì)比、過(guò)濾、篩選,再運(yùn)用SIFT、Poly Phen2、FATHMM等生物...
【文章來(lái)源】:華中科技大學(xué)湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:61 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
遺傳性痙攣性截癱家系圖譜,黑色箭頭代表先證者(II-1)
18 2 家系內(nèi) 3 名患者的顱腦磁共振圖像。 a、c、e 圖為矢狀面 T1 加權(quán)成像f 圖為橫斷面 T2 加權(quán)成像,II-1 (a,b)、II-3 (c,d)、II-4 (e,f) 三人均可輕度萎縮,而胼胝體均表現(xiàn)正常。基因檢測(cè)結(jié)果
22圖 3 正常者(上)和患者(下)的 SPG7 基因突變位點(diǎn)的電泳圖譜。突變位點(diǎn)用紅色箭頭顯示。a 圖示四個(gè)堿基插入雜合突變(c.1150_1150+1insCTAC)。b 圖示兩個(gè)相鄰位點(diǎn)的錯(cuò)義突變(c.2062C>T,p.Arg688Trp 和 c.2063G>A, p.Arg688Gln)共同導(dǎo)致了一個(gè)終止密碼子突變(p.Arg688Ter)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]常染色體顯性遺傳性痙攣性截癱遺傳學(xué)進(jìn)展[J]. 詹飛霞,曹立. 上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2017(11)
[2]臍帶間充質(zhì)干細(xì)胞在遺傳性痙攣性截癱中的應(yīng)用[J]. 劉靜,韓冬梅,王志東,鄭曉麗,丁麗,朱玲,薛梅,閻洪敏,郭子寬,王恒湘. 組織工程與重建外科雜志. 2013(04)
[3]遺傳性痙攣性截癱研究進(jìn)展[J]. 張雷,徐愛(ài)軍. 臨床薈萃. 2013(03)
[4]臍帶間充質(zhì)干細(xì)胞移植治療遺傳性痙攣性截癱一例[J]. 楊華強(qiáng),王云甫,杜玲,李東升,袁亞紅. 臨床誤診誤治. 2011(06)
[5]臍血干細(xì)胞移植成功治療遺傳性痙攣性截癱一例[J]. 楊華強(qiáng),張榮環(huán),杜玲,李東升,袁雅紅. 中國(guó)全科醫(yī)學(xué). 2011(03)
[6]遺傳性痙攣性截癱治驗(yàn)1則[J]. 呂慧青,齊瑛,宋艾云. 北京中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2001(05)
[7]遺傳性痙攣性截癱4個(gè)家系22例報(bào)告[J]. 莊茂友,孔凡斌. 新醫(yī)學(xué). 1999(04)
[8]遺傳性痙攣性截癱[J]. 栗靈,王承武,范源. 中華骨科雜志. 1997(12)
碩士論文
[1]應(yīng)用全外顯子測(cè)序?qū)σ粋(gè)遺傳性痙攣性截癱家系致病基因的研究[D]. 井忠翠.青島大學(xué) 2017
[2]靶向捕獲二代測(cè)序檢測(cè)不明原因兒童失神癲癇的致病基因分析[D]. 蘇文婷.山西醫(yī)科大學(xué) 2017
本文編號(hào):2951645
【文章來(lái)源】:華中科技大學(xué)湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:61 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
遺傳性痙攣性截癱家系圖譜,黑色箭頭代表先證者(II-1)
18 2 家系內(nèi) 3 名患者的顱腦磁共振圖像。 a、c、e 圖為矢狀面 T1 加權(quán)成像f 圖為橫斷面 T2 加權(quán)成像,II-1 (a,b)、II-3 (c,d)、II-4 (e,f) 三人均可輕度萎縮,而胼胝體均表現(xiàn)正常。基因檢測(cè)結(jié)果
22圖 3 正常者(上)和患者(下)的 SPG7 基因突變位點(diǎn)的電泳圖譜。突變位點(diǎn)用紅色箭頭顯示。a 圖示四個(gè)堿基插入雜合突變(c.1150_1150+1insCTAC)。b 圖示兩個(gè)相鄰位點(diǎn)的錯(cuò)義突變(c.2062C>T,p.Arg688Trp 和 c.2063G>A, p.Arg688Gln)共同導(dǎo)致了一個(gè)終止密碼子突變(p.Arg688Ter)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]常染色體顯性遺傳性痙攣性截癱遺傳學(xué)進(jìn)展[J]. 詹飛霞,曹立. 上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2017(11)
[2]臍帶間充質(zhì)干細(xì)胞在遺傳性痙攣性截癱中的應(yīng)用[J]. 劉靜,韓冬梅,王志東,鄭曉麗,丁麗,朱玲,薛梅,閻洪敏,郭子寬,王恒湘. 組織工程與重建外科雜志. 2013(04)
[3]遺傳性痙攣性截癱研究進(jìn)展[J]. 張雷,徐愛(ài)軍. 臨床薈萃. 2013(03)
[4]臍帶間充質(zhì)干細(xì)胞移植治療遺傳性痙攣性截癱一例[J]. 楊華強(qiáng),王云甫,杜玲,李東升,袁亞紅. 臨床誤診誤治. 2011(06)
[5]臍血干細(xì)胞移植成功治療遺傳性痙攣性截癱一例[J]. 楊華強(qiáng),張榮環(huán),杜玲,李東升,袁雅紅. 中國(guó)全科醫(yī)學(xué). 2011(03)
[6]遺傳性痙攣性截癱治驗(yàn)1則[J]. 呂慧青,齊瑛,宋艾云. 北京中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2001(05)
[7]遺傳性痙攣性截癱4個(gè)家系22例報(bào)告[J]. 莊茂友,孔凡斌. 新醫(yī)學(xué). 1999(04)
[8]遺傳性痙攣性截癱[J]. 栗靈,王承武,范源. 中華骨科雜志. 1997(12)
碩士論文
[1]應(yīng)用全外顯子測(cè)序?qū)σ粋(gè)遺傳性痙攣性截癱家系致病基因的研究[D]. 井忠翠.青島大學(xué) 2017
[2]靶向捕獲二代測(cè)序檢測(cè)不明原因兒童失神癲癇的致病基因分析[D]. 蘇文婷.山西醫(yī)科大學(xué) 2017
本文編號(hào):2951645
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