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基因SOD2、SOD3、HDAC9多態(tài)性與大理州漢族缺血性腦卒中患者相關(guān)性研究

發(fā)布時間:2020-06-18 13:53
【摘要】:研究背景及意義:腦卒中是一種多因素疾病,環(huán)境因素和遺傳因素的交互作用在腦卒中發(fā)病中具有重要的作用。全球每年約有1500萬腦卒中病人,其中20%是致死的,50%以上的病人失去了生活自理能力。缺血性腦卒中約占腦卒中的85%以上,在中國其所占比例逐年增加,并且出現(xiàn)年輕化的趨勢。單核苷酸多態(tài)性是最常見的遺傳變異類型,分子遺傳學(xué)的最新進展使人們意識到單核苷酸多態(tài)性與腦卒中存在密切的關(guān)聯(lián)。超氧化物歧化酶(Superoxide Dismutase,SOD)是唯一已知的直接清除自由基的酶,是保護細胞的必需的抗氧化酶。大量動物實驗表明SOD與腦卒中存在密切關(guān)聯(lián)。蛋白脫乙;9(Histone Deacetylase,HDAC9)基因通過染色質(zhì)結(jié)構(gòu)修飾對基因表達的調(diào)控,但不改變DNA序列,HDAC9被鑒定為迄今為止大血管卒中的最強風(fēng)險基因。然而研究基因SOD2(rs2842960)、SOD3(rs7655372)、HDAC9(rs723296)位點多態(tài)性與腦卒中之間的相關(guān)性尚不清楚。本實驗為了解大理州居民腦卒中的遺傳風(fēng)險因素破譯其基本機制、促進新治療靶點的識別和優(yōu)化預(yù)防策略提供科學(xué)依據(jù)。研究目的:研究基因SOD2(rs2842960)、SOD3(rs7655372)、HDAC9(rs723296)多態(tài)性與大理州腦卒中患者之間相關(guān)性。方法:實驗采用病例-對照方法,隨機選取符合研究目的的漢族腦卒中患者155名及漢族健康者128名。實時PCR方法對DNA進行擴增,改良型Taqman熒光定量技術(shù)對每個SNP位點進行基因分型。采用t檢驗、卡方檢驗、Logistics回歸統(tǒng)計學(xué)方法對腦卒中傳統(tǒng)危險因素進行分析;利用哈迪-溫伯格平衡定律對研究對象進行遺傳平衡檢測,Logistics回歸分析校正傳統(tǒng)危險因素分析各SNP位點多態(tài)性對腦卒中易感性影響;直線回歸分析rs723296多態(tài)性與血脂水平的關(guān)聯(lián)。多因子降維方法分析基因-基因交互作用對腦卒中的影響。結(jié)果:⑴傳統(tǒng)危險因素:空腹血糖(p=0.00 OR=2.885,95%CI 1.86-4.41),膽固醇(p=0.00 OR=2.378,95%CI 1.55-3.66),甘油三酯(p=0.013 OR=1.657,95%CI1.11-2.47),低密度脂蛋白(p=0.013 OR=1.641,95%CI 1.11-2.42),白細胞(p=0.00 OR=1.515,95%CI 1.27-1.81),收縮壓(p=0.03 OR=1.017,95%CI 1.00-1.03),紅細胞(p=0.007 OR=0.477,95%CI 0.28-0.82),p均小于0.05。⑵基因SOD2(rs2842960)顯性模型中基因型中CC/(CT+TT):p=0.383,OR=0.767,95%CI:0.423-1.392。⑶基因SOD3(rs7655372)加性模型中GG/GA:p=0.028,OR=3.188,95%CI:1.134-8.962。⑷基因HDAC9(rs723296)加性模型中TC/TT:p=0.021,OR=2.669,95%CI:1.046-4.923。⑸基因HDAC9(rs723296)與血脂在實驗組中:低密度脂蛋白(β=0.171,p=0.456),膽固醇(β=-0.141,p=0.502),甘油三酯(β=0.035,p=0.865);在對照組中:低密度脂蛋白(β=0.364,p=0.301),膽固醇(β=-0.573,p=0.083),甘油三酯(β=0.340,p=0.337),p均大于0.05,無統(tǒng)計學(xué)意義。⑹基因SOD2(rs2842960)、SOD3(rs7655372)、HDAC9(rs723296)之間有較強的交互作用(交叉一致性為10),但對腦卒中發(fā)病并無顯著影響(p㧐0.05)。結(jié)論:基因SOD3(rs7655372)、HDAC9(rs723296)多態(tài)性增加了大理州居民腦卒中患病風(fēng)險,基因SOD2(rs2842960)多態(tài)性與腦卒中易感性無關(guān)。基因HDAC9(rs723296)位點多態(tài)性與血脂水平并無關(guān)聯(lián);騍OD2(rs2842960)、SOD3(rs7655372)、HDAC9(rs723296)基因-基因交互作用對腦卒中發(fā)病并無顯著影響。
【學(xué)位授予單位】:大理大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:R743.3
【圖文】:

純合子,樣本,等位基因,熒光探針技術(shù)


大理大學(xué)碩士學(xué)位論文第十一節(jié) 改良型 TaqMan 熒光定量技術(shù)識別/檢測單核苷酸多態(tài)性或突變的方法應(yīng)具有高度的特異性和方面,聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction ,PCR)為許多分子要的分析性能。本實驗對 SNP 檢測采用 TaqMan 熒光探針技術(shù),在術(shù)基礎(chǔ)上加入熒光標(biāo)記探針,對 SNP 位點進行快速準(zhǔn)確的分析。改熒光探針技術(shù)相比于傳統(tǒng)酶切電泳法有一下幾個優(yōu)點:1、相比TaqMan 熒光定量技術(shù)檢測環(huán)境封閉,避免了擴增產(chǎn)物人為因素污染性的產(chǎn)生;2、光譜技術(shù)提高了檢測的靈敏性;3、熒光探針雜交,特異性;4、此過程均為一體化,這使得 SNP 檢測更為簡單和快捷。

完整性,電泳圖,樣本,完整性檢測


圖4 DNA樣本純度檢測(濃度為268.7ng/l,OD260/OD280為1.76)第三節(jié) DNA 完整性檢測凝膠成像系統(tǒng)檢測結(jié)果如圖 5 所示。9 號泳道加入 DNA marker,其余 1-17 號泳道加入為 DNA 樣本,其中 10、15號泳道出現(xiàn)拖帶現(xiàn)象,說明次樣本 DNA完整性較差,舍棄重新提取。DNA marker 跑出條帶分子量大小由上到下依次為5000bp、3000bp、2000bp、1500bp、1000bp、750bp、500bp、250bp、100bp。1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 1750

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6 謝立移;樊e

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