【摘要】：目的:本研究通過收集a SHA(原發(fā)性蛛網(wǎng)膜下腔出血)患者發(fā)病后D1,D3,D5,D7腦脊液標本,通過提取m RNA并基因組測序,篩選出差異基因并分析差異表達基因通過生物信息學(xué)技術(shù)了解差異表達基因的生物學(xué)功能,推測SAH后Ar細胞的極化狀態(tài)。方法:通過收集a SAH患者發(fā)病后D1,D3,D5,D7腦脊液標本,提取m RNA并基因測序,通過測序基因數(shù)據(jù)質(zhì)量統(tǒng)計、參考基因組比對分析、轉(zhuǎn)錄本組裝和新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測、已知基因的差異表達、差異基因功能分析,篩選出差異基因并分析差異表達基因所富集的生物學(xué)功能,檢測SAH發(fā)生后不同時間差異基因表達水平,推測出Ar細胞極化狀態(tài)。結(jié)果:通過對m RNA基因組測序我們發(fā)現(xiàn),同一患者D1,D3兩個樣本的reads數(shù)目,經(jīng)過篩選得到差異基因987個,其中上調(diào)基因752個,占77%,下調(diào)基因235個,占23%;D3,D5兩個樣本的reads數(shù)目,經(jīng)過篩選得到差異基因1210個,其中上調(diào)表達基因859個,占71%,下調(diào)表達基因351個,占29%;D5,D7兩個樣本的reads數(shù)目,經(jīng)過篩查得到了差異表達基因2016個,其中上調(diào)表達基因1226個,占61%,下調(diào)表達基因790個,占39%。通過對以上3對差異表達基因進一步篩選,我們挑選出與a SAH后Ar細胞極化狀態(tài)相關(guān)的差異表達基因,并通過生物學(xué)蛋白質(zhì)技術(shù)推測差異表達基因的功能信息發(fā)現(xiàn),IL-12(白細胞介素-12)、IL-18、IL-27、TGF-β等與M1極化相關(guān)的細胞因子伴隨著疾病發(fā)展時間的推移而表達量出現(xiàn)增長的變化,而IL-10則表現(xiàn)為低表達水平。結(jié)論:1.Ar細胞作為蛛網(wǎng)膜下腔固有單核巨噬細胞,在a SAH后Ar細胞會功能性的出現(xiàn)不同的極化狀態(tài),參與后期的炎癥反應(yīng)。2.在a SAH后Ar細胞趨向于MI極化狀態(tài)。
【學(xué)位授予單位】：蚌埠醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類號】：R743.35
【圖文】：

D1序列每個堿基位置的質(zhì)量分數(shù)分布圖

D3序列每個堿基位置的質(zhì)量分數(shù)分布圖

【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前2條

1 張建民;;動脈瘤性蛛網(wǎng)膜下腔出血診治熱點問題及展望[J];浙江大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版);2015年04期

2 尚茹茹;張錦;袁鋒;溫婷;劉曉紅;;M1和M2型巨噬細胞經(jīng)ox-LDL刺激后細胞內(nèi)脂質(zhì)含量及分泌TNF-α、IL-10的濃度差別與意義[J];中西醫(yī)結(jié)合心腦血管病雜志;2014年12期

本文編號：2716988