發(fā)布時間：2020-06-05 02:03

【摘要】：目的:腦梗死是全球公共衛(wèi)生問題。遺傳因素在腦梗死發(fā)展中起著至關(guān)重要的作用。然而,表觀遺傳修飾是否影響缺血性卒的發(fā)病機制及其預(yù)后,尚未得到系統(tǒng)研究。(1)本研究通過全基因甲基化芯片(Illumina Infinium Human Methylation 450K)分析急性腦梗死患者與健康對照全基因組DNA甲基化水平差異,進而篩選出急性腦梗死患者DNA甲基化水平顯著變化的基因,并利用功能富集分析,闡明DNA甲基化在急性腦梗死發(fā)生、發(fā)展過程中的作用。(2)通過獨立樣本驗證,分析PTPRN2基因甲基化水平在急性腦梗死患者與健康對照中的差異,為急性腦梗死的早期診斷及治療提供新的靶標和理論依據(jù)。方法:(1)本研究收集急性腦梗死患者和健康對照全血樣本各12例,通過Human Methylation 450芯片分析進行雜交,并進行數(shù)據(jù)處理,獲得差異基因。對差異基因進行GO分析和KEGG分析。(2)在171例獨立樣本中(94例急性腦梗死患者和77例健康對照),采用Mass ARRAY Epi TYPER DNA甲基化分析技術(shù),分析PTPRN2基因中注釋的8個Cp G位點,在獨立樣本中比較急性腦梗死患者與健康對照人群的甲基化水平差異。結(jié)果:(1)通過急性腦梗死實驗組與健康對照組全基因組甲基化水平比較,共篩選出1014個甲基化位點存在甲基化水平差異(p小于0.01,均值差異大于0.05),其中包含甲基化水平上調(diào)位點574個,涵蓋252個基因,甲基化水平下調(diào)位點440個,涵蓋373個基因。GO分析和KEGG通路分析發(fā)現(xiàn),差異基因的生物功能主要集中在鈣離子轉(zhuǎn)運、膠原纖維、離子轉(zhuǎn)運、神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育,這些差異基因的DNA甲基化水平變化可能是導(dǎo)致急性腦梗死的原因之一。(2)在獨立樣本驗證階段,通過實驗組與對照組的比較,分析基因芯片篩選出的PTPRN2基因的8個Cp G位點,通過Mass ARRAY分析技術(shù),共獲得到7個Cp G位點數(shù)據(jù)(Cp G2,Cp G3,Cp G4,Cp G5,Cp G6,Cp G7和Cp G8)。實驗結(jié)果顯示7個Cp G位點均處于高甲基化水平改變。應(yīng)用統(tǒng)計學(xué)分析,我們找到Cp G4,Cp G5,Cp G6,Cp G84個位點甲基化水平實驗組與對照組均數(shù)差異有統(tǒng)計學(xué)意義(p值分別為p=0.019;p=0.032;p=0.029;p=0.019)。結(jié)論:(1)急性腦梗死患者全基因組甲基化水平與健康對照組有顯著不同,這可能是導(dǎo)致急性腦梗死發(fā)生、發(fā)展的重要表觀遺傳學(xué)原因之一。(2)急性腦梗死患者PTPRN2基因甲基化水平明顯升高,PTPRN2可能作為腦梗死的潛在表觀遺傳學(xué)分子標記。
【圖文】：

江蘇大學(xué)碩士學(xué)位論文究至關(guān)重要的。許多目標區(qū)域可以通過新興的全基因組胞嘧啶甲基化技術(shù)進行鑒定，然而這些全基因組通常僅掃描一個區(qū)域內(nèi)的一些CpG位點。MassARRAYEpiTYPER DNA甲基化檢測技術(shù)是用于檢測和定量分析 DNA 甲基化區(qū)域特異性的方法，其可以對選定區(qū)域進行高分辨率掃描。因此，Mass ARRAY EpiTYPER DNA 甲基化技術(shù)可以對單個CpG 和周圍區(qū)域進行更詳細的分析。該技術(shù)不僅能對候選基因甲基化進行分析，還可用于驗證通過全基因組技術(shù)檢測到的 CpG 位點。MassARRAY EpiTYPER DNA 甲基化技術(shù)基于堿基特異性裂解亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)換的基因組 DNA 和基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時間質(zhì)譜（MALDI-TOF MS）可以用高通量的方式快速和可重復(fù)的定量分析 CpGs。分析目標區(qū)域內(nèi)高達 85％的 CpGs，并且檢測精度允許將甲基化差異定量低至 5-7％。本研究運用該技術(shù)對全基因組甲基化芯片篩選出的差異基因，進行甲基化水平的獨立樣本驗證。

江蘇大學(xué)碩士學(xué)位論文3.2 Infinium HumanMethylation450 BeadChip 芯片結(jié)果我們使用 Infinium HumanMethylation450 BeadChip 芯片對> 485,000 胞嘧啶 - 磷酸鳥嘌呤（CpG）位點的甲基化水平進行定量。在質(zhì)量控制和標準化之后，獲得 12 例急性腦梗死患者和 12 例健康對照的 431386 個 CpG 位點進一步分析。結(jié)果顯示獲得甲基化位點數(shù)據(jù)符合正態(tài)分布，見圖 3.2.1。
【學(xué)位授予單位】：江蘇大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號】：R743.33

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本文編號：2697323