人血清microRNAs作為腦卒中后認知功能障礙生物標志物的研究
發(fā)布時間:2020-04-23 22:09
【摘要】:目的:該項研究主要應用高通量的Solexa測序方法篩選出人腦卒中后認知功能障礙組(Post-stroke Cognitive Impairment,PSCI)、腦卒中后認知功能正常組(Post-stroke Cognitive Normality,PSCN)、年齡匹配對照組(Age-matched Controls,AMC)3組間顯著差異表達的血清microRNAs(miRNAs),并通過實時熒光定量PCR進行驗證。同時通過蒙特利爾認知評估量表(Montreal Cognitive Assessment,MoCA)對以上人群進行認知功能評定,以探討這顯著差異表達的miRNAs與腦卒中后認知功能障礙的相關性,從而判斷其是否可為卒中后認知障礙早期診斷、早期干預的客觀依據(jù)。方法:本研究招募了 PSCI組、PSCN組以及AMC組各40例,三組間年齡、性別、受教育年限、基礎疾病相匹配,另外PSCI組、PSCN組間卒中類型、病灶、病程、腦卒中損傷程度相匹配。第一階段:分別從PSCI組、PSCN組以及AMC組血清標本中,各選取5例血清標本,三組間年齡、性別、受教育年限、基礎疾病相匹配,另外PSCI組、PSCN組間卒中類型、病灶、病程、腦卒中損傷程度相匹配。進行高通量的Solexa測序,初步篩選出PSCI組、PSCN組、AMC組間顯著差異表達miRNAs。第二階段:根據(jù)高通量的Solexa測序結果進行大規(guī)模、二階段精確的定量驗證,采用qRT-PCR檢測三組血清中初篩選出的顯著差異表達的miRNAs,并使用2-△Ct法計算其相對表達水平。為了探討篩選的顯著差異表達的miRNAs與腦卒中后認知功能障礙的相關性,本研究采用了 Spearman相關分析對血清中顯著差異表達的miRNAs相對表達水平與MoCA評分進行了相關性分析。為了檢驗差異表達的miRNAs對腦卒中后認知功能障礙的預測價值,本研究進一步采用了 ROC(receiver operating characteristic,ROC)曲線及曲線下面積(areaundercurve,AUC)進行分析。結果:通過高通量的Solexa測序技術篩選及qRT-PCR驗證過程,我們得到6個PSCI組與 PSCN 組、AMC 組間顯著差異表達的血清 miRNAs:hsa-miR-191-5p、hsa-miR-20a-5p、hsa-miR-20b-5p、hsa-miR-193b-5p、hsa-miR-93-5p、miR-5991-y。其中 hsa-miR-191-5p、hsa-miR-20a-5p、hsa-miR-20b-5p、hsa-miR-93-5p、miR-5991-y 在 PSCI 患者血清中呈顯著上調狀態(tài)(P0.05),hsa-miR-193b-5p在PSCI患者血清中呈顯著下調狀態(tài)(P0.05)。本研究運用Spearman相關分析發(fā)現(xiàn)MoCA評分與血清hsa-miR-191-5p、hsa-miR-20a-5p、hsa-miR-20b-5p、miR-5991-y、hsa-miR-93-5p 的相對表達量間存在較強正相關(P0.05),與血清hsa-miR-193b-5p的相對表達量間存在較強負相關(P0.05)。進一步構建ROC曲線并得到 AUC(95%CI),結果如下:hsa-miR-193b-5p、miR-5991-y、hsa-miR-20a-5p、hsa-miR-93-5p、hsa-miR-20b-5p、hsa-miR-191-5p 的 AUC 分別為 0.905、0.817、0.751、0.741、0.650、0.642(P0.01)。靈敏度、特異度分別為 hsa-miR-193b-5p(100%、85.7%)、miR-5991-y(77.5%、80.0%)、hsa-miR-20a-5p(63.2%、66.7%)、hsa-miR-93-5p(64.1%、62.2%)、hsa-miR-20b-5p(65.0%、57.0%)、hsa-miR-191-5p(58.5%、60.5%)。結論:1、通過高通量的Solexa測序技術的篩選及qRT-PCR驗證過程,得到6個顯著差異表達的血清miRNAs,其中hsa-miR-191-5p、hsa-miR-20a-5p、hsa-miR-20b-5p、hsa-miR-93-5p、miR-5991-y在PSCI患者血清中呈顯著上調狀態(tài),has-miR-193b-5p在PSCI患者血清中呈顯著下調狀態(tài)。2、血清 hsa-miR-191-5p、hsa-miR-20a-5p、hsa-miR-20b-5p、miR-5991-y、hsa-miR-93-5p表達水平越高,hsa-miR-193b-5p表達水平越低,提示腦卒中后發(fā)生認知功能障礙的可能性越大。3、血清miRNAs檢測操作簡單方便,而且無創(chuàng),作為卒中后認知功能障礙早期診斷與預后的生物標志物具有潛在的應用價值。
【圖文】:
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間年齡、性別、受教育年限、基礎疾病相匹配,另外PSCI組、PSCN組間腦卒中類型、逡逑發(fā)病部位、病程、腦卒中損傷程度相匹配。將標本埋于干冰送往廣州市基迪奧生物有限逡逑公司進行高通量的Solexa測序,具體步驟見圖1-1、圖1-2。逡逑Small邋RNA邐Length逡逑5,邋Pf-r邋?攀■iT-r邋_邋I邋I邋■-rrrT邋Ti-roH邐10-30邋nt逡逑3'邋adaptor邋libation逡逑5.邋P邋_邋_邋邐邐^邋3'aaap,c"邋36-50邋nt逡逑5'-adaptor邋ligation邋I邐14-kmai-j?此逡逑flTfn邋I邋I邋M邋l邋l邋l邋l邋I邋邐邐邐邐P'邐62-75邋nt逡逑T4-RNA邐j逡逑^> ̄邐^邐3邐3.l挘洌洌穡簦錚蟈義希蟈澹翦危忮邋五五五澹殄澹殄澹翦澹礤澹潁蟈五義希懾危遙藻澹穡潁椋恚澹蟈義希懾澹遙澹觶澹潁螅邋澹簦潁幔睿螅悖潁椋穡簦椋錚鑠義希悖模危鈴澹翦義希停灣澹懾澹懾澹懾濉鰣澹灣澹懾濉鰣澹懾濉鰣澹懾濉鰣澹懾澹懾澹懾濉鰣澹懾澹懾澹懾澹殄義希擔擼媯洌幔穡
本文編號:2638202
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間年齡、性別、受教育年限、基礎疾病相匹配,另外PSCI組、PSCN組間腦卒中類型、逡逑發(fā)病部位、病程、腦卒中損傷程度相匹配。將標本埋于干冰送往廣州市基迪奧生物有限逡逑公司進行高通量的Solexa測序,具體步驟見圖1-1、圖1-2。逡逑Small邋RNA邐Length逡逑5,邋Pf-r邋?攀■iT-r邋_邋I邋I邋■-rrrT邋Ti-roH邐10-30邋nt逡逑3'邋adaptor邋libation逡逑5.邋P邋_邋_邋邐邐^邋3'aaap,c"邋36-50邋nt逡逑5'-adaptor邋ligation邋I邐14-kmai-j?此逡逑flTfn邋I邋I邋M邋l邋l邋l邋l邋I邋邐邐邐邐P'邐62-75邋nt逡逑T4-RNA邐j逡逑^> ̄邐^邐3邐3.l挘洌洌穡簦錚蟈義希蟈澹翦危忮邋五五五澹殄澹殄澹翦澹礤澹潁蟈五義希懾危遙藻澹穡潁椋恚澹蟈義希懾澹遙澹觶澹潁螅邋澹簦潁幔睿螅悖潁椋穡簦椋錚鑠義希悖模危鈴澹翦義希停灣澹懾澹懾澹懾濉鰣澹灣澹懾濉鰣澹懾濉鰣澹懾濉鰣澹懾澹懾澹懾濉鰣澹懾澹懾澹懾澹殄義希擔擼媯洌幔穡
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