人血清microRNAs作為腦卒中后認(rèn)知功能障礙生物標(biāo)志物的研究
發(fā)布時(shí)間:2020-04-23 22:09
【摘要】:目的:該項(xiàng)研究主要應(yīng)用高通量的Solexa測序方法篩選出人腦卒中后認(rèn)知功能障礙組(Post-stroke Cognitive Impairment,PSCI)、腦卒中后認(rèn)知功能正常組(Post-stroke Cognitive Normality,PSCN)、年齡匹配對照組(Age-matched Controls,AMC)3組間顯著差異表達(dá)的血清microRNAs(miRNAs),并通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR進(jìn)行驗(yàn)證。同時(shí)通過蒙特利爾認(rèn)知評估量表(Montreal Cognitive Assessment,MoCA)對以上人群進(jìn)行認(rèn)知功能評定,以探討這顯著差異表達(dá)的miRNAs與腦卒中后認(rèn)知功能障礙的相關(guān)性,從而判斷其是否可為卒中后認(rèn)知障礙早期診斷、早期干預(yù)的客觀依據(jù)。方法:本研究招募了 PSCI組、PSCN組以及AMC組各40例,三組間年齡、性別、受教育年限、基礎(chǔ)疾病相匹配,另外PSCI組、PSCN組間卒中類型、病灶、病程、腦卒中損傷程度相匹配。第一階段:分別從PSCI組、PSCN組以及AMC組血清標(biāo)本中,各選取5例血清標(biāo)本,三組間年齡、性別、受教育年限、基礎(chǔ)疾病相匹配,另外PSCI組、PSCN組間卒中類型、病灶、病程、腦卒中損傷程度相匹配。進(jìn)行高通量的Solexa測序,初步篩選出PSCI組、PSCN組、AMC組間顯著差異表達(dá)miRNAs。第二階段:根據(jù)高通量的Solexa測序結(jié)果進(jìn)行大規(guī)模、二階段精確的定量驗(yàn)證,采用qRT-PCR檢測三組血清中初篩選出的顯著差異表達(dá)的miRNAs,并使用2-△Ct法計(jì)算其相對表達(dá)水平。為了探討篩選的顯著差異表達(dá)的miRNAs與腦卒中后認(rèn)知功能障礙的相關(guān)性,本研究采用了 Spearman相關(guān)分析對血清中顯著差異表達(dá)的miRNAs相對表達(dá)水平與MoCA評分進(jìn)行了相關(guān)性分析。為了檢驗(yàn)差異表達(dá)的miRNAs對腦卒中后認(rèn)知功能障礙的預(yù)測價(jià)值,本研究進(jìn)一步采用了 ROC(receiver operating characteristic,ROC)曲線及曲線下面積(areaundercurve,AUC)進(jìn)行分析。結(jié)果:通過高通量的Solexa測序技術(shù)篩選及qRT-PCR驗(yàn)證過程,我們得到6個(gè)PSCI組與 PSCN 組、AMC 組間顯著差異表達(dá)的血清 miRNAs:hsa-miR-191-5p、hsa-miR-20a-5p、hsa-miR-20b-5p、hsa-miR-193b-5p、hsa-miR-93-5p、miR-5991-y。其中 hsa-miR-191-5p、hsa-miR-20a-5p、hsa-miR-20b-5p、hsa-miR-93-5p、miR-5991-y 在 PSCI 患者血清中呈顯著上調(diào)狀態(tài)(P0.05),hsa-miR-193b-5p在PSCI患者血清中呈顯著下調(diào)狀態(tài)(P0.05)。本研究運(yùn)用Spearman相關(guān)分析發(fā)現(xiàn)MoCA評分與血清hsa-miR-191-5p、hsa-miR-20a-5p、hsa-miR-20b-5p、miR-5991-y、hsa-miR-93-5p 的相對表達(dá)量間存在較強(qiáng)正相關(guān)(P0.05),與血清hsa-miR-193b-5p的相對表達(dá)量間存在較強(qiáng)負(fù)相關(guān)(P0.05)。進(jìn)一步構(gòu)建ROC曲線并得到 AUC(95%CI),結(jié)果如下:hsa-miR-193b-5p、miR-5991-y、hsa-miR-20a-5p、hsa-miR-93-5p、hsa-miR-20b-5p、hsa-miR-191-5p 的 AUC 分別為 0.905、0.817、0.751、0.741、0.650、0.642(P0.01)。靈敏度、特異度分別為 hsa-miR-193b-5p(100%、85.7%)、miR-5991-y(77.5%、80.0%)、hsa-miR-20a-5p(63.2%、66.7%)、hsa-miR-93-5p(64.1%、62.2%)、hsa-miR-20b-5p(65.0%、57.0%)、hsa-miR-191-5p(58.5%、60.5%)。結(jié)論:1、通過高通量的Solexa測序技術(shù)的篩選及qRT-PCR驗(yàn)證過程,得到6個(gè)顯著差異表達(dá)的血清miRNAs,其中hsa-miR-191-5p、hsa-miR-20a-5p、hsa-miR-20b-5p、hsa-miR-93-5p、miR-5991-y在PSCI患者血清中呈顯著上調(diào)狀態(tài),has-miR-193b-5p在PSCI患者血清中呈顯著下調(diào)狀態(tài)。2、血清 hsa-miR-191-5p、hsa-miR-20a-5p、hsa-miR-20b-5p、miR-5991-y、hsa-miR-93-5p表達(dá)水平越高,hsa-miR-193b-5p表達(dá)水平越低,提示腦卒中后發(fā)生認(rèn)知功能障礙的可能性越大。3、血清miRNAs檢測操作簡單方便,而且無創(chuàng),作為卒中后認(rèn)知功能障礙早期診斷與預(yù)后的生物標(biāo)志物具有潛在的應(yīng)用價(jià)值。
【圖文】:
A熒光定量PCR檢測試劑盒(型號:MR101-02)邐南京諾唯贊生物科技有限公司逡逑、無水乙醇邐國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司逡逑引物邐上海鉑尚生物技術(shù)有限公司逡逑se-Free邋water邐南京諾唯贊生物科技有限公司逡逑0邋1^1、1-200邋pi、100-1000邋吸嘴(RNase-Free)邐美國邋Kirgen邋公司逡逑l微量離心管(RNase-Free)邐美國Kirgen公司逡逑]邋PCR邋管(RNase-Free)邐美國邋Kirgen邋公司逡逑l八聯(lián)排管(RNase-Free)邐美國Kirgen公司逡逑實(shí)驗(yàn)方法逡逑邋Solexa高通量測序逡逑別從PSCI組、PSCN組以及AMC組血清標(biāo)本中,各選。祩(gè)血清標(biāo)本,三組逡逑、性別、受教育年限、基礎(chǔ)疾病相匹配,另外PSCI組、PSCN組間腦卒中類型、逡逑位、病程、腦卒中損傷程度相匹配。將標(biāo)本埋于干冰送往廣州市基迪奧生物有限逡逑行高通量的Solexa測序,,具體步驟見圖1-1、圖1-2。逡逑
間年齡、性別、受教育年限、基礎(chǔ)疾病相匹配,另外PSCI組、PSCN組間腦卒中類型、逡逑發(fā)病部位、病程、腦卒中損傷程度相匹配。將標(biāo)本埋于干冰送往廣州市基迪奧生物有限逡逑公司進(jìn)行高通量的Solexa測序,具體步驟見圖1-1、圖1-2。逡逑Small邋RNA邐Length逡逑5,邋Pf-r邋?攀■iT-r邋_邋I邋I邋■-rrrT邋Ti-roH邐10-30邋nt逡逑3'邋adaptor邋libation逡逑5.邋P邋_邋_邋邐邐^邋3'aaap,c"邋36-50邋nt逡逑5'-adaptor邋ligation邋I邐14-kmai-j?此逡逑flTfn邋I邋I邋M邋l邋l邋l邋l邋I邋邐邐邐邐P'邐62-75邋nt逡逑T4-RNA邐j逡逑^> ̄邐^邐3邐3.l挘洌洌穡簦錚蟈義希蟈澹翦危忮邋五五五澹殄澹殄澹翦澹礤澹潁蟈五義希懾危遙藻澹穡潁椋恚澹蟈義希懾澹遙澹觶澹潁螅邋澹簦潁幔睿螅悖潁椋穡簦椋錚鑠義希悖模危鈴澹翦義希停灣澹懾澹懾澹懾濉鰣澹灣澹懾濉鰣澹懾濉鰣澹懾濉鰣澹懾澹懾澹懾濉鰣澹懾澹懾澹懾澹殄義希擔(dān)擼媯洌幔穡
本文編號:2638202
【圖文】:
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間年齡、性別、受教育年限、基礎(chǔ)疾病相匹配,另外PSCI組、PSCN組間腦卒中類型、逡逑發(fā)病部位、病程、腦卒中損傷程度相匹配。將標(biāo)本埋于干冰送往廣州市基迪奧生物有限逡逑公司進(jìn)行高通量的Solexa測序,具體步驟見圖1-1、圖1-2。逡逑Small邋RNA邐Length逡逑5,邋Pf-r邋?攀■iT-r邋_邋I邋I邋■-rrrT邋Ti-roH邐10-30邋nt逡逑3'邋adaptor邋libation逡逑5.邋P邋_邋_邋邐邐^邋3'aaap,c"邋36-50邋nt逡逑5'-adaptor邋ligation邋I邐14-kmai-j?此逡逑flTfn邋I邋I邋M邋l邋l邋l邋l邋I邋邐邐邐邐P'邐62-75邋nt逡逑T4-RNA邐j逡逑^> ̄邐^邐3邐3.l挘洌洌穡簦錚蟈義希蟈澹翦危忮邋五五五澹殄澹殄澹翦澹礤澹潁蟈五義希懾危遙藻澹穡潁椋恚澹蟈義希懾澹遙澹觶澹潁螅邋澹簦潁幔睿螅悖潁椋穡簦椋錚鑠義希悖模危鈴澹翦義希停灣澹懾澹懾澹懾濉鰣澹灣澹懾濉鰣澹懾濉鰣澹懾濉鰣澹懾澹懾澹懾濉鰣澹懾澹懾澹懾澹殄義希擔(dān)擼媯洌幔穡
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