中樞神經(jīng)系統(tǒng)血管外皮瘤的miRNA表達(dá)譜和預(yù)后相關(guān)性分析的初步研究
發(fā)布時間:2018-10-26 12:40
【摘要】:血管外皮細(xì)胞瘤(hemangiopericytoma, HPC)為一種少見的間葉來源腫瘤,可見于身體各部位軟組織及中樞神經(jīng)系統(tǒng)。目前WHO神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分類中,將該腫瘤歸類于中樞神經(jīng)系統(tǒng)間葉來源非腦膜上皮腫瘤,WHOⅡ-Ⅲ級。HPC約占原發(fā)中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤的0.5%,具有很高的復(fù)發(fā)率。目前,對HPC發(fā)生發(fā)展的機(jī)制尚未充分的闡明。為了探尋更好的HPC診斷和治療的有效方法,有必要進(jìn)一步研究其發(fā)病機(jī)制。微小RNA (microRNA, miRNA)是一類長度約為19-25個核苷酸的內(nèi)源性單鏈非編碼小RNA,通過轉(zhuǎn)錄后翻譯抑制或靶mRNA裂解,參與細(xì)胞增殖、分化、凋亡等生物學(xué)過程。目前為止,人類基因組中已鑒定出超過2000個miRNAs (http://www. mirbase.org/),均為組織特異性表達(dá)。每個miRNA可以有多個靶基因,其本身的表達(dá)又受到不同機(jī)制調(diào)控,其中包括:轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合、表觀改變和染色體異常等,已有大量研究證實(shí)人類miRNA是腫瘤發(fā)生、發(fā)展的重要因子,它們存在于腫瘤相關(guān)基因組區(qū)域,扮演者腫瘤抑癌基因或癌基因的角色。因此,研究HPC中miRNA表達(dá)情況,將為進(jìn)一步了解HPC病理生理過程提供新的途徑,并為進(jìn)一步的研究提供基礎(chǔ)。研究目的:通過高通量基因芯片技術(shù)對中樞神經(jīng)系統(tǒng)HPC-miRNA表達(dá)譜式進(jìn)行初步研究,探尋并驗(yàn)證與血管外皮瘤患者預(yù)后相關(guān)的miRNA。研究方法:對19例來自華山醫(yī)院的初發(fā)血管外皮瘤石蠟樣本和6例正常對照硬腦膜進(jìn)行miRNA表達(dá)譜分析,利用含2006個miRNA探針的微陣列芯片篩選出血管外皮瘤中差異表達(dá)的miRNAs。通過置換檢驗(yàn)和Cox比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型篩選出與無病生存期(PFS)和總生存期(OS)相關(guān)的miRNA,用Kaplan-Meier生存分析評價高表達(dá)與低表達(dá)組之間患者預(yù)后的差異。進(jìn)一步擴(kuò)大樣本,取我院2001-2008年手術(shù)治療的42例(包含前19例)血管外皮瘤石蠟樣本,應(yīng)用實(shí)時熒光定量PCR技術(shù)驗(yàn)證篩選出的預(yù)后相關(guān)性miRNA。采用Kaplan-Meier法和Cox比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型評估m(xù)iRNA標(biāo)記物與患者預(yù)后之間的相互關(guān)系。運(yùn)用生物信息學(xué)工具PicTar、TagetScan、miRanda、miRBase預(yù)測miRNAs的靶基因。研究結(jié)果:發(fā)現(xiàn)166個在血管外皮瘤和正常對照硬腦膜之間差異表達(dá)的miRNA,其中108個上調(diào),58個下調(diào)。通過置換檢驗(yàn)和Kaplan-Meier生存分析篩選出4個與患者預(yù)后相關(guān)的miRNA標(biāo)記(hsa-miR-1273e, hsa-miR-1972, hsa-miR-3934-3p, hsa-miR-4497)。42例樣本實(shí)時熒光定量PCR結(jié)果證實(shí)hsa-miR-1273e表達(dá)上調(diào)與患者預(yù)后顯著相關(guān)(PFS, p=0.034)。多因素Cox比例風(fēng)險(xiǎn)回歸分析表明,hsa-miR-1273e表達(dá)水平為HPC患者PFS的獨(dú)立影響因素(p=0.024)。生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)RBBP5、CTNND、MAPK1、RAP1A、NF2、RERG、RAB33B、BAG1等可能為hsa-miR-1273e作用的靶基因。研究結(jié)論:hsa-miR-1273e與血管外皮瘤患者預(yù)后顯著相關(guān),有助于患者的預(yù)后評估,為高風(fēng)險(xiǎn)患者制定治療策略提供參考。
[Abstract]:Angiopericytoma (hemangiopericytoma, HPC) is a rare mesenchymal tumor found in soft tissue and central nervous system. At present, in the classification of WHO tumors, the tumors are classified as non-meningeal epithelial tumors of central nervous system mesenchymal origin, WHO 鈪,
本文編號:2295751
[Abstract]:Angiopericytoma (hemangiopericytoma, HPC) is a rare mesenchymal tumor found in soft tissue and central nervous system. At present, in the classification of WHO tumors, the tumors are classified as non-meningeal epithelial tumors of central nervous system mesenchymal origin, WHO 鈪,
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