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染色體9p21區(qū)單核苷酸多態(tài)性與缺血性腦卒中易感性的Meta分析

發(fā)布時間:2018-07-29 21:21
【摘要】:目的:流行病學(xué)研究發(fā)現(xiàn),缺血性腦卒中(ischemic stroke,IS)是一種與遺傳因素密切相關(guān)的復(fù)雜多基因疾病,但確切的遺傳學(xué)原因仍然未知。以單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)為遺傳標(biāo)記系統(tǒng)的全基因組關(guān)聯(lián)研究(genome wide association studies,GWAS)發(fā)現(xiàn)染色體9p21區(qū)SNPs位點(diǎn)與冠狀動脈疾病(coronary artery disease,CAD)顯著相關(guān),鑒于IS與CAD共同的病理生理機(jī)制,國內(nèi)外多個研究探討了染色體9p21區(qū)SNPs位點(diǎn)與IS的易感性。然而,這些研究得到的結(jié)果卻并不一致。因單一研究往往樣本量小且統(tǒng)計(jì)學(xué)和臨床異質(zhì)性大,缺乏有效的統(tǒng)計(jì)效能,所以,本課題運(yùn)用Meta分析的方法,全面而系統(tǒng)地收集國內(nèi)外已發(fā)表的所有相關(guān)文獻(xiàn),用定量合成的方法進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,以明確染色體9p21區(qū)與IS易感性有關(guān)聯(lián)的SNPs位點(diǎn)種類,并對其關(guān)聯(lián)強(qiáng)度進(jìn)行全面評估。方法:檢索中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(CBMdisk)、中國學(xué)術(shù)期刊全文數(shù)據(jù)庫(CNKI)、萬方數(shù)據(jù)庫、維普數(shù)據(jù)庫、PubMed,Cochrane Library,EMBASE,OvidSP,Wiley Online Library,EBSCO,BIOSIS Preview等中英文數(shù)據(jù)庫,全面收集2016年1月以前發(fā)表的有關(guān)染色體9p21區(qū)SNPs位點(diǎn)與IS易感性的國內(nèi)外文獻(xiàn)。依據(jù)嚴(yán)格的納入/排除標(biāo)準(zhǔn),分別由兩名研究者獨(dú)立提取數(shù)據(jù),采用紐卡斯?fàn)?渥太華量表(Newcastle-Ottawa Scale,NOS)進(jìn)行質(zhì)量評估。采用美國statacorplp公司的stata12.0軟件對提取的數(shù)據(jù)進(jìn)行meta分析。計(jì)算三種不同遺傳模型(等位基因頻率比較、顯性模型和隱性模型)下的比值比(oddsratio,or)及其95%可信區(qū)間(confidenceinterval,ci)評估9p21區(qū)snps位點(diǎn)與is易感性的關(guān)聯(lián)程度。使用q檢驗(yàn)和i2統(tǒng)計(jì)量進(jìn)行異質(zhì)性檢驗(yàn),根據(jù)異質(zhì)性大小選擇隨機(jī)效應(yīng)模型(randomeffectmodel,rem)或固定效應(yīng)模型(fixedeffectmodel,fem)進(jìn)行數(shù)據(jù)合并。根據(jù)人種和is亞型進(jìn)行亞組分析以及以年齡、性別、研究質(zhì)量評分、樣本量大小、基因分型方法等協(xié)變量進(jìn)行meta回歸分析探討可能的異質(zhì)性來源。用敏感性分析來評估結(jié)果的穩(wěn)健性。通過begg檢驗(yàn)聯(lián)合egger檢驗(yàn)綜合評估發(fā)表偏倚。結(jié)果:排除不符合納入標(biāo)準(zhǔn)的文獻(xiàn)后,最終納入23篇文獻(xiàn),所有文獻(xiàn)nos評分均大于5分。包括40906例is患者和124629例對照。進(jìn)入meta分析的涉及9p21區(qū)13種snps位點(diǎn):rs10757274,rs10757278,rs2383206,rs2383207,rs1333040,rs1333042,rs1333049,rs1004638,rs1537378,rs3731245,rs4977574,rs7044859,rs7865618。1.rs10757274位點(diǎn):共納入9篇文獻(xiàn)10個研究,包括病例組6746例和對照組12577例。合并分析顯示,總?cè)巳篿s組rs10757274位點(diǎn)突變等位基因g及突變基因型gg+ag頻率高于對照組,且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[gvs.a:or=1.11,95%ci(1.06,1.16),p0.001;gg+agvs.aa:or=1.11,95%ci(1.02,1.22),p=0.020],提示突變等位基因g或突變基因型gg和ag是is易感因素。根據(jù)人種亞組分析結(jié)果提示,高加索人群突變等位基因g、亞洲人群突變等位基因g或突變基因型gg是is易感因素[高加索人群gvs.a:or=1.13,95%ci(1.06,1.20),p0.001;亞洲人群gvs.a:or=1.09,95%ci(1.01,1.17),p=0.021;ggvs.aa+ag:or=1.14,95%ci(1.00,1.29),p=0.047]。is亞型的亞組分析結(jié)果提示,突變等位基因g或突變基因型gg是is的大動脈粥樣硬化型(large-arteryatherosclerosis,laa)的易感因素[gvs.a:or=1.18,95%ci(1.06,1.31),p=0.002;ggvs.aa+ag:or=1.33,95%ci(1.12,1.57),p=0.001]。2.rs10757278位點(diǎn):共納入9篇文獻(xiàn)9個研究,包括病例組9061例和對照組23900例。合并分析顯示,總?cè)巳篿s組rs10757278位點(diǎn)突變等位基因g及突變基因型gg頻率高于對照組,且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[gvs.a:or=1.09,95%ci(1.02,1.17),p=0.011;ggvs.aa+ag:or=1.16,95%ci(1.04,1.30),p=0.009],提示突變等位基因g或突變基因型gg是is易感因素。根據(jù)人種的亞組分析,在亞洲人群和高加索人群中也得到類似結(jié)果。根據(jù)is亞型進(jìn)行的亞組分析提示,總?cè)巳和蛔兊任换騡或突變基因型gg也是laa易感因素[gvs.a:or=1.17,95%ci(1.03,1.32),p=0.016;ggvs.aa+ag:or=1.30,95%ci(1.16,1.46),p0.001]。3.rs2383206位點(diǎn):共納入8篇文獻(xiàn)8個研究,包括病例組4118例,對照組6049例。合并分析顯示,總?cè)巳篿s組rs2383206位點(diǎn)突變等位基因g及突變基因型gg頻率高于對照組,且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[gvs.a:or=1.07,95%ci(1.01,1.14)p=0.021;ggvs.aa+ag:or=1.13,95%ci(1.02,1.25),p=0.017],提示突變等位基因g或突變基因型gg是is易感因素。根據(jù)人種的亞組分析,在亞洲人群中也得到類似結(jié)果。is亞型分析提示,總?cè)巳和蛔兊任换騡或突變基因型gg也是laa易感因素[gvs.a:or=1.18,95%ci(1.06,1.31),p=0.002;ggvs.aa+ag:or=1.30,95%ci(1.08,1.58),p=0.006]。4.rs2383207位點(diǎn):共納入11篇文獻(xiàn)12個研究,包括病例組25050例和對照組85607例。合并分析顯示,總?cè)巳篿s組rs2383207位點(diǎn)突變等位基因a及突變基因型aa+ga頻率低于對照組,且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[avs.g:or=0.91,95%ci(0.86,0.95),p0.001;aa+gavs.gg:or=0.91,95%ci(0.85,0.97),p=0.002],提示突變等位基因a或突變基因型aa和ga是is保護(hù)因素。根據(jù)人種的亞組分析,在亞洲人群中得到類似結(jié)果;高加索人群突變等位基因a是is保護(hù)因素。is亞型分析提示,總?cè)巳和蛔兊任换騛或突變基因型aa是laa保護(hù)因素[avs.g:or=0.87,95%ci(0.84,0.91),p0.001;aavs.gg+ag:or=0.84,95%ci(0.74,0.96),p=0.010],而小動脈閉塞型(small-vesselocclusion,svo)組與對照組相比差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,提示rs2383207位點(diǎn)多態(tài)性與svo易感性無關(guān)聯(lián)。5.rs1333040位點(diǎn):共納入7篇文獻(xiàn)8個研究,包括病例組6059例和對照組5670例。合并分析顯示,以三種遺傳模型分析,總?cè)巳篿s組和對照組差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,基于人種和is亞型的亞組分析也得到類似結(jié)果,提示rs1333040位點(diǎn)多態(tài)性與is易感性無關(guān)聯(lián)。6.rs1333042位點(diǎn):共納入3篇文獻(xiàn)4個研究,包括病例組1697例和對照組1633例。合并分析顯示,以三種遺傳模型分析,總?cè)巳篿s組和對照組差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,提示rs1333042位點(diǎn)多態(tài)性與is易感性無關(guān)聯(lián)。7.rs1333049位點(diǎn):共納入5篇文獻(xiàn)5個研究,包括病例組4488例和對照組4345例。合并分析顯示,總?cè)巳篿s組rs1333049位點(diǎn)突變等位基因g頻率低于對照組,且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[gvs.c:or=0.91,95%ci(0.85,0.97),p=0.002],提示突變等位基因g是is保護(hù)因素。按人種的亞組分析提示,亞洲人群is組和對照組差異以三種遺傳模型分析均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,提示rs1333049位點(diǎn)多態(tài)性與亞洲人群is易感性無關(guān)聯(lián)。8.rs1004638位點(diǎn):共納入3篇文獻(xiàn)3個研究,研究對象均為亞洲人群,包括病例組1959例和對照組1941例。合并分析顯示,亞洲人群is組rs1004638位點(diǎn)突變等位基因t及突變基因型tt頻率低于對照組,且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[tvs.a:or=0.80,95%ci(0.68,0.95),p=0.010;ttvs.aa+at:or=0.85,95%ci(0.73,0.98),p=0.022],提示突變等位基因t或突變基因型tt是is保護(hù)因素。9.rs1537378位點(diǎn):共納入6篇文獻(xiàn)6個研究,包括病例組6119例和對照組5759例。合并分析顯示,總?cè)巳篿s組rs1537378位點(diǎn)突變等位基因t或突變基因型tt頻率低于對照組,且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[tvs.c:or=0.80,95%ci(0.70,0.91),p=0.001;ttvs.cc+ct:or=0.83,95%ci(0.74,0.93),p=0.001],提示突變等位基因t或突變基因型tt是is保護(hù)因素。根據(jù)人種的亞組分析,提示亞洲人群突變等位基因t或突變基因型tt和ct是is保護(hù)因素[tvs.c:or=0.70,95%ci(0.60,0.82),p0.001;tt+ctvs.cc:or=0.70,95%ci(0.58,0.83),p0.001]。is亞型的亞組分析提示,總?cè)巳和蛔兊任换騮或突變基因型tt和ct是laa保護(hù)因素[tvs.c:or=0.78,95%ci(0.71,0.85),p0.001;tt+ctvs.cc:or=0.73,95%ci(0.65,0.82),p0.001]。10.rs3731245位點(diǎn):共納入2篇文獻(xiàn)2個研究,研究對象均為亞洲人群,包括病例組1120例和對照組1106例。合并分析顯示,亞洲人群is組rs3731245位點(diǎn)突變等位基因a頻率高于對照組,且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[avs.g:or=1.18,95%ci(1.01,1.38),p=0.032],提示突變等位基因a是is易感因素。11.rs4977574位點(diǎn):共納入5篇文獻(xiàn)6個研究,包括病例組12381例和對照組15436例。合并分析顯示,總?cè)巳褐衖s組rs4977574位點(diǎn)突變等位基因g及突變基因型gg+ag頻率高于對照組,且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[gvs.a:or=1.10,95%ci(1.01,1.20),p=0.038;gg+agvs.aa:or=1.16,95%ci(1.06,1.28),p=0.001],提示突變等位基因g或突變基因型gg和ag是is易感因素。根據(jù)人種的亞組分析,在亞洲人群中得到類似結(jié)果;高加索人群突變基因型gg和ag是is易感因素。is亞型的亞組分析提示,總?cè)巳和蛔兊任换騡或突變基因型gg和ag也是laa易感因素[gvs.a:or=1.19,95%ci(1.07,1.32),p=0.001;gg+agvs.aa:or=1.37,95%ci(1.15,1.64),p0.001],而svo組與對照組相比差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,提示rs2383207位點(diǎn)多態(tài)性與svo易感性無關(guān)聯(lián)。12.rs7044859位點(diǎn):共納入2篇文獻(xiàn),包括病例組4322例和對照組4451例。合并分析顯示,以所有遺傳模型分析,總?cè)巳篿s組和對照組差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,提示rs7044859位點(diǎn)多態(tài)性與is易感性無關(guān)聯(lián)。亞型分析,發(fā)現(xiàn)laa組rs7044859位點(diǎn)突變等位基因a及突變基因型aa頻率高于對照組,且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[avs.t:or=1.13,95%ci(01.02,1.24),p=0.015;aavs.tt+ta:or=1.20,95%ci(1.03,1.39),p=0.019],提示突變等位基因a或突變基因型aa是laa易感因素。13.rs7865618位點(diǎn):共納入2篇文獻(xiàn),包括病例組4303例和對照組4477例。合并分析顯示,以所有遺傳模型分析,總?cè)巳篿s組和對照組差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,提示rs7865618位點(diǎn)多態(tài)性與is易感性無關(guān)聯(lián)。亞型分析顯示,總?cè)巳簂aa組rs7865618位點(diǎn)突變基因型gg+ag頻率低于對照組,且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[gg+agvs.aa:or=0.62,95%ci(0.39,0.98),p=0.040],提示突變基因型gg和ag是laa保護(hù)因素。結(jié)論:本課題分析了9p21區(qū)13個snps位點(diǎn),發(fā)現(xiàn)9個snps位點(diǎn)與is易感性有關(guān)聯(lián),其中5個snps位點(diǎn)是is的易感因素(rs10757274,rs10757278,rs2383206,rs3731245,rs4977574),4個snps位點(diǎn)是is的保護(hù)因素(rs2383207,s1333049,rs1004638,rs1537378);2個snps位點(diǎn)僅與laa亞型易感性有關(guān)聯(lián),其中1個位點(diǎn)是laa的易感因素(rs7044859),1個snp位點(diǎn)是is的保護(hù)因素(rs7865618);有2個snps位點(diǎn)與is易感性無關(guān)聯(lián)(rs1333040,rs1333042)。人種亞組分析表明,不同人種對is易感性存在差異,is亞型分析表明,snps位點(diǎn)與is易感性有關(guān)聯(lián)者,均與laa有關(guān)聯(lián),但目前尚未發(fā)現(xiàn)與svo易感性有關(guān)聯(lián)的snps位點(diǎn)。1.rs10757274位點(diǎn)多態(tài)性與is易感性有關(guān)聯(lián),突變等位基因g或突變基因型gg和ag是is易感因素。2.rs10757278位點(diǎn)多態(tài)性與is易感性有關(guān)聯(lián),突變等位基因g或突變基因型gg是is易感因素。3.rs2383206位點(diǎn)多態(tài)性與is易感性有關(guān)聯(lián),突變等位基因g或突變基因型gg是is易感因素。4.rs2383207位點(diǎn)多態(tài)性與is易感性有關(guān)聯(lián),突變等位基因a或突變基因型aa是is保護(hù)因素。5.rs1333042位點(diǎn)多態(tài)性與is易感性無關(guān)聯(lián)。6.rs1333042位點(diǎn)多態(tài)性與is易感性無關(guān)聯(lián)。7.rs1333049位點(diǎn)多態(tài)性與is易感性有關(guān)聯(lián),突變等位基因g是is保護(hù)因素。8.rs1004638位點(diǎn)多態(tài)性與IS易感性有關(guān)聯(lián),突變等位基因T或突變基因型TT是IS保護(hù)因素。9.rs1537378位點(diǎn)多態(tài)性與IS易感性有關(guān)聯(lián),突變等位基因T或突變基因型TT是IS保護(hù)因素。10.rs3731245位點(diǎn)多態(tài)性與IS易感性有關(guān)聯(lián),突變等位基因A是IS易感因素。11.rs4977574位點(diǎn)多態(tài)性與IS易感性有關(guān)聯(lián),突變等位基因G或突變基因型GG和AG是IS易感因素。12.rs7044859位點(diǎn)多態(tài)性與LAA易感性有關(guān)聯(lián),突變等位基因A或突變基因型AA是LAA易感因素。13.rs7865618位點(diǎn)多態(tài)性與LAA易感性有關(guān)聯(lián),突變基因型GG和AG是LAA保護(hù)因素。由于各SNP位點(diǎn)納入研究仍然偏少,加上某些位點(diǎn)各研究間存在一定的異質(zhì)性,且未能考慮到基因與基因及基因與環(huán)境等相互作用,因此,本課題的結(jié)論有待未來更多研究進(jìn)一步證實(shí)。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:川北醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R743.3

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8 呂彩蘭;戴恩來;吳建軍;史正剛;魏錦慧;徐厚謙;;中西醫(yī)結(jié)合治療小兒原發(fā)性腎病綜合征隨機(jī)對照試驗(yàn)的meta分析[A];第二十九次全國中醫(yī)兒科學(xué)術(shù)大會暨“小兒感染性疾病的中醫(yī)藥防治”培訓(xùn)班論文匯編[C];2012年

9 陳靖;朱月永;鄭琦;江家驥;;細(xì)胞角蛋白18對非酒精性脂肪性肝炎診斷價值的Meta分析[A];第7屆全國疑難及重癥肝病大會論文集[C];2013年

10 馬燕燕;李霖虞;朝輝;沈哲;陳李華;厲有名;;益生菌對于非酒精性脂肪性肝病作用的meta分析[A];2013第六屆浙江省消化病學(xué)術(shù)大會論文匯編[C];2013年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前8條

1 馮哲;腫瘤易感性相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性驗(yàn)證及其基于納米材料的新型檢測方法研究[D];華中科技大學(xué);2015年

2 王衛(wèi);關(guān)節(jié)內(nèi)注射糖皮質(zhì)激素對凍結(jié)肩療效的meta分析[D];浙江大學(xué);2014年

3 嚴(yán)韻詩;中醫(yī)藥輔助治療惡性腫瘤國外文獻(xiàn)Meta分析[D];廣州中醫(yī)藥大學(xué);2014年

4 潘丁;人膝骨關(guān)節(jié)炎滑液蛋白質(zhì)組學(xué)研究及國人骨關(guān)節(jié)炎流行病學(xué)Meta分析[D];中南大學(xué);2014年

5 陳俊杰;基于Meta分析法近20年經(jīng)方治療糖尿病及并發(fā)癥臨床文獻(xiàn)整理[D];廣州中醫(yī)藥大學(xué);2013年

6 Sheikh Haroon Shabbir Uddin Aziz uddin;初始化療、初始手術(shù)治療或者手術(shù)治療聯(lián)合術(shù)后放療對于宮頸癌ⅠB期及ⅡA期患者療效的Meta分析[D];吉林大學(xué);2014年

7 桂小龍;胃癌HER-2表達(dá)與預(yù)后關(guān)系的系統(tǒng)評價和Meta分析[D];廣西醫(yī)科大學(xué);2015年

8 張歡;中國人群總膽固醇水平與腦卒中及其亞型關(guān)系的前瞻性研究暨脂聯(lián)素與心血管疾病的meta分析[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2012年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 史曉芹;幽門螺旋桿菌感染與中心性漿液性脈絡(luò)膜視網(wǎng)膜病變關(guān)系的Meta分析[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2012年

2 李恒強(qiáng);膳食鎂攝入量與腦卒中及心血管死亡關(guān)系的meta分析[D];泰山醫(yī)學(xué)院;2014年

3 楊怡;乳腺癌治療后妊娠對預(yù)后影響的Meta分析[D];福建醫(yī)科大學(xué);2015年

4 王艷濤;手術(shù)與非手術(shù)治療四部分肱骨近端骨折療效的Meta分析[D];石河子大學(xué);2015年

5 于佳;肝動脈栓塞化療聯(lián)合射頻消融治療中晚期原發(fā)性肝癌臨床療效的Meta分析[D];河北醫(yī)科大學(xué);2015年

6 楊曉亮;基于Meta分析比較中西醫(yī)結(jié)合與利培酮治療精神分裂癥療效的文獻(xiàn)研究[D];北京中醫(yī)藥大學(xué);2016年

7 馮書賢;異基因造血干細(xì)胞移植后神經(jīng)系統(tǒng)并發(fā)癥危險因素的Meta分析[D];東南大學(xué);2015年

8 崔青揚(yáng);5-羥色胺轉(zhuǎn)運(yùn)體基因多態(tài)性與冠心病合并抑郁相關(guān)性的meta分析[D];東南大學(xué);2015年

9 曹宇;中藥對老年人單純收縮期高血壓療效的Meta分析[D];北京中醫(yī)藥大學(xué);2016年

10 于懷景;蛋白C與兒童股骨頭缺血性壞死相關(guān)性的Meta分析[D];遵義醫(yī)學(xué)院;2016年

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本文編號:2154061

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