BCL3基因表達:一個新的膠質(zhì)瘤預(yù)后預(yù)測因子
本文選題:膠質(zhì)瘤 + 預(yù)后 ; 參考:《國際神經(jīng)病學神經(jīng)外科學雜志》2017年02期
【摘要】:目的研究B細胞淋巴瘤因子3(B-Cell CLL/Lymphoma 3,BCL3)基因表達與膠質(zhì)瘤預(yù)后之間的關(guān)系。方法從公用數(shù)據(jù)庫中國腦膠質(zhì)瘤基因組圖譜計劃(Chinese Glioma Genome Atlas,CGGA)和癌癥基因組圖譜計劃(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中下載了包含BCL3基因表達和患者預(yù)后的膠質(zhì)瘤數(shù)據(jù)集數(shù)據(jù),采用Gene Spring GX 11.0軟件進行歸一化,使用Cox回歸分析和Kaplan-Meier分析進行數(shù)據(jù)分析。結(jié)果在低級別膠質(zhì)瘤(Low Grade Glioma,LGG)和膠質(zhì)母細胞瘤(Glioblastoma,GBM)數(shù)據(jù)集中,BCL3基因的表達與膠質(zhì)瘤患者的總生存期(Overall Survival,OS)和無病生存期(Disease-free Survival,DFS)均顯著相關(guān)(P0.05),在Batch1和Bactch2兩個數(shù)據(jù)集中,BCL3基因表達與膠質(zhì)瘤患者的OS也均顯著相關(guān)(P0.05)。以BCL3表達水平中位數(shù)為界,將各數(shù)據(jù)集分為BCL3高表達組和低表達組,分析發(fā)現(xiàn)BCL3高表達組的死亡風險均顯著高于低表達組,而GBM數(shù)據(jù)集中BCL3高表達組的腫瘤復(fù)發(fā)風險顯著高于低表達組。結(jié)論 BCL3基因表達與膠質(zhì)瘤的預(yù)后顯著相關(guān),且BCL3基因的高表達預(yù)示著較差的預(yù)后。BCL3基因表達是一個新的膠質(zhì)瘤預(yù)后預(yù)測因子。
[Abstract]:Objective to study the relationship between the expression of B cell lymphoma factor 3(B-Cell CLL/Lymphoma 3 and the prognosis of glioma. Methods Glioma data sets containing the expression of BCL3 gene and prognosis of patients were downloaded from the Chinese Glioma Genome Atlas CGGA and the Cancer Genome Atlas CGGA, a common database, respectively. Gene Spring GX 11.0 software was used to normalize the data, and Cox regression analysis and Kaplan-Meier analysis were used to analyze the data. Results the expression of BCL3 gene in low Grade GliomaGG and GlioblastomaGG) data sets was significantly correlated with the total survival time of glioma patients, and the disease-free survival time (DFS). BCL3 gene was detected in both Batch1 and Bactch2 data sets. There was also a significant correlation between the expression and OS of glioma patients (P 0.05). According to the median expression level of BCL3, the data sets were divided into BCL3 high expression group and low expression group. It was found that the death risk of BCL3 high expression group was significantly higher than that of low expression group. The risk of tumor recurrence in BCL3 high expression group in GBM dataset was significantly higher than that in low expression group. Conclusion the expression of BCL3 gene is significantly correlated with the prognosis of gliomas, and the high expression of BCL3 gene may be a new prognostic predictor of glioma.
【作者單位】: 中南大學湘雅醫(yī)院神經(jīng)外科;中南大學臨床藥理研究所;
【分類號】:R739.4
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