本文選題：高通量測(cè)序　切入點(diǎn)：肌張力障礙　出處：《北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院》2016年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：背景肌張力障礙(dystonia)是一種運(yùn)動(dòng)障礙性疾病,通常以持續(xù)或偶發(fā)的肌肉收縮而引起的異常運(yùn)動(dòng)或姿勢(shì)為特征。肌張力障礙的臨床表現(xiàn)根據(jù)受累肌肉的部位、收縮強(qiáng)度和不同肌肉的組合而有不同表現(xiàn)�，F(xiàn)階段對(duì)肌張力障礙進(jìn)行臨床診斷多按照臨床表現(xiàn)和病史依據(jù)醫(yī)生的臨床經(jīng)驗(yàn)進(jìn)行診斷,難以滿足臨床準(zhǔn)確診斷的要求。而各種輔助檢查也做不到準(zhǔn)確快速。臨床診斷中正急需一種快速準(zhǔn)確的診斷方法目的應(yīng)用Ion AmliSeq多重PCR定制序列捕獲系統(tǒng)結(jié)合Ion Torrent PGM高通量測(cè)序平臺(tái)檢測(cè)肌張力障礙患者的目標(biāo)基因突變,在找尋肌張力障礙致病基因新突變的基礎(chǔ)上評(píng)估高通量測(cè)序技術(shù)在肌張力障礙臨床診斷上應(yīng)用的可能性。方法使用的個(gè)性化定制panel包括25個(gè)肌張力障礙明確致病基因及相關(guān)易感基因的全部外顯子區(qū)域,應(yīng)用Ion AmliSeq多重PCR定制序列捕獲系統(tǒng)對(duì)病人的目的基因區(qū)域進(jìn)行捕獲,通過Ion Torrent PGM高通量測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行靶向重測(cè)序,對(duì)得到的變異數(shù)據(jù)進(jìn)行肌張力障礙候選基因突變分析。結(jié)果本研究共使用Ion Chip 318芯片6張,318V2芯片12張,平均測(cè)序深度為134±23,覆蓋度為96.12%±0.71%,單張芯片最高產(chǎn)生數(shù)據(jù)達(dá)到900MB(IonChip 318V2)。經(jīng)測(cè)序后數(shù)據(jù)分析和Sanger測(cè)序驗(yàn)證,在肌張力障礙的致病基因上共檢測(cè)到15(60%,15/25)個(gè)突變,其中4種為已知變異,11種為之前未報(bào)道的新突變。結(jié)論應(yīng)用Ion AmliSeq多重PCR定制序列捕獲系統(tǒng)結(jié)合Ion Torrent PGM高通量測(cè)序平臺(tái)可以完成對(duì)肌張力障礙的基因篩查工作。
[Abstract]:Background dystonia is a dystonia, usually characterized by abnormal movement or posture caused by continuous or occasional muscle contraction. The clinical manifestations of dystonia are based on the site of the affected muscle. The contractile intensity and the combination of different muscles have different manifestations. At this stage, the clinical diagnosis of dystonia is mostly based on the clinical manifestations and the history of the disease according to the doctor's clinical experience. It is difficult to meet the requirement of clinical accurate diagnosis, and all kinds of auxiliary examination can not be done accurately and quickly. In clinical diagnosis, a fast and accurate diagnostic method is urgently needed; to apply Ion AmliSeq multiple PCR custom sequence capture system combined with Ion Torrent. PGM high-throughput sequencing platform was used to detect target gene mutations in patients with dystonia. On the basis of searching for new mutations in dystonia gene, the possibility of high throughput sequencing in clinical diagnosis of dystonia was evaluated. The personalized panel used by the method includes 25 specific pathogenicity of dystonia. All exon regions of genes and associated susceptibility genes, The target gene region of patients was captured by Ion AmliSeq multiplex PCR customized sequence capture system, and targeted resequencing was carried out by Ion Torrent PGM high-throughput sequencing platform. The mutational data were analyzed by candidate gene mutation analysis of dystonia. Results in this study, Ion Chip 318 chip 6 pieces of 318V2 chip was used to analyze the mutation. The average depth of sequencing was 134 鹵23, the coverage was 96.12% 鹵0.71, and the maximum data produced by single chip was 900MB IonChip 318V2. After sequencing and Sanger sequencing, a total of 1560g / 1525) mutations were detected in the pathogenic gene of dystonia. Four of them are known mutations and 11 are new mutations that have not been reported before. Conclusion Gene screening for dystonia can be completed by using Ion AmliSeq multiplex PCR custom sequence capture system and Ion Torrent PGM high-throughput sequencing platform.
【學(xué)位授予單位】：北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：R746

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 翟紅玉,司鳳娥,蔚變霞,賀越虹;藥物所致的小兒急性肌張力障礙臨床診治體會(huì)[J];山西醫(yī)藥雜志;2002年02期

2 郝英霞,周玉萍;氟西汀致急性肌張力障礙2例報(bào)告[J];四川精神衛(wèi)生;2002年03期

3 劉寧疆,張本恕;肌張力障礙的臨床研究[J];中華神經(jīng)科雜志;2003年06期

4 杜怡峰,劉兆孔;肌張力障礙 概述[J];山東醫(yī)藥;2005年19期

5 劉寧疆 ,張本恕;肌張力障礙的分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J];國際神經(jīng)病學(xué)神經(jīng)外科學(xué)雜志;2005年04期

6 牟君,王運(yùn)良,謝鵬;肌張力障礙的研究與進(jìn)展[J];中國臨床康復(fù);2005年09期

7 Schrag A.,Trimble M. ,Quinn N. ,Bhatia K. ,江山;頑固性肌張力障礙綜合征:103例報(bào)道[J];世界核心醫(yī)學(xué)期刊文摘(神經(jīng)病學(xué)分冊(cè));2005年03期

8 李濤;葉明;李承晏;;肌張力障礙[J];臨床內(nèi)科雜志;2006年06期

9 柏興華;;在管理和治療肌張力障礙中護(hù)士的角色[J];國際護(hù)理學(xué)雜志;2006年12期

10 曹燕滔;李振洲;張昕;;陣發(fā)性運(yùn)動(dòng)誘發(fā)的肌張力障礙1例[J];武警醫(yī)學(xué);2007年07期

相關(guān)會(huì)議論文 前10條

1 萬新華;湯曉芙;李力波;王琳;;北京地區(qū)834例肌張力障礙的臨床分型及特點(diǎn)[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第七次全國神經(jīng)病學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2004年

2 董偉;朱軍;常鵬飛;;肌張力障礙動(dòng)物模型的研究進(jìn)展[A];中國醫(yī)師協(xié)會(huì)神經(jīng)外科醫(yī)師分會(huì)第四屆全國代表大會(huì)論文匯編[C];2009年

3 趙群峰;;多巴反應(yīng)性肌張力障礙1例誤診分析[A];2009年浙江省神經(jīng)病學(xué)學(xué)術(shù)年會(huì)論文匯編[C];2009年

4 彭國平;袁敏;王康;羅本燕;;發(fā)作性運(yùn)動(dòng)誘發(fā)的肌張力障礙8例臨床分析[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第十三次全國神經(jīng)病學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2010年

5 劉煥光;馬羽;胡文瀚;楊岸超;張穎;張建國;;3-硝基丙酸誘導(dǎo)繼發(fā)肌張力障礙大鼠模型的行為學(xué)研究[A];中國醫(yī)師協(xié)會(huì)神經(jīng)外科醫(yī)師分會(huì)第六屆全國代表大會(huì)論文匯編[C];2011年

6 常鵬飛;董偉;左煥琮;;山豆根中毒致全身肌張力障礙的臨床和實(shí)驗(yàn)證據(jù):新的肌張力障礙模型[A];中國醫(yī)師協(xié)會(huì)神經(jīng)外科醫(yī)師分會(huì)第六屆全國代表大會(huì)論文匯編[C];2011年

7 李宇;何志義;;多巴反應(yīng)性肌張力障礙的臨床分析報(bào)告[A];第九次全國神經(jīng)病學(xué)學(xué)術(shù)大會(huì)論文匯編[C];2006年

8 劉鼎;李國良;;夜間陣發(fā)性肌張力障礙三例臨床分析[A];第九次全國神經(jīng)病學(xué)學(xué)術(shù)大會(huì)論文匯編[C];2006年

9 徐評(píng)議;丁紅珂;李毅;周桃峰;駱飛飛;;肌張力障礙致病基因的突變篩查[A];第十一屆全國神經(jīng)病學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2008年

10 楊揚(yáng);孫虹;黃德暉;武雷;吳衛(wèi)平;;中國多巴反應(yīng)性肌張力障礙家系患者的臨床與基因?qū)W特點(diǎn)[A];山東省2013年神經(jīng)內(nèi)科學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議暨中國神經(jīng)免疫大會(huì)2013論文匯編[C];2013年

相關(guān)重要報(bào)紙文章 前8條

1 吳小煉;口頜肌張力障礙[N];中國中醫(yī)藥報(bào);2003年

2 萬同己;謹(jǐn)防藥源性急性肌張力障礙[N];中國醫(yī)藥報(bào);2002年

3 吳小煉;口頜肌張力障礙[N];中國中醫(yī)藥報(bào);2003年

4 采寫 本報(bào)記者 葉芳 實(shí)習(xí)記者 董婷 通訊員 伍曉毅 受訪專家 廣州醫(yī)學(xué)院第二附屬醫(yī)院神經(jīng)科學(xué)研究所 殷建瑞 副教授;運(yùn)動(dòng)障礙者要學(xué)會(huì)放松[N];廣東科技報(bào);2008年

5 時(shí)仲省 高思敏 劉春陽;河南醫(yī)大新法治療肌張力障礙[N];中國醫(yī)藥報(bào);2001年

6 傅德明;利培酮致急性肌張力障礙[N];中國醫(yī)藥報(bào);2001年

7 雯心;腦深部刺激可治肌張力障礙[N];健康報(bào);2006年

8 建平;DBS療法改善肌張力障礙[N];中國醫(yī)藥報(bào);2004年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前6條

1 馬凌燕;原發(fā)性肌張力障礙的遺傳學(xué)研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2014年

2 田原;口下頜肌張力障礙全腦灰質(zhì)形態(tài)學(xué)研究、危險(xiǎn)因素及生命質(zhì)量調(diào)查[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2013年

3 張社卿;多巴敏感性肌張力障礙臨床和分子遺傳學(xué)研究[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2002年

4 陸藝;肌張力障礙性震顫臨床及電生理特征研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2014年

5 王琳;重復(fù)經(jīng)顱磁刺激對(duì)局灶型肌張力障礙的治療研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2014年

6 陳黨紅;舒筋顆粒對(duì)卒中后肌張力增高的影響及可能作用機(jī)制探討[D];廣州中醫(yī)藥大學(xué);2005年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 柳明玉;一個(gè)多巴反應(yīng)性肌張力障礙家系基因突變篩查研究[D];華南理工大學(xué);2015年

2 楊張凱;腦深部電刺激不同靶點(diǎn)治療肌張力障礙的療效分析及術(shù)后程控參數(shù)分析比較[D];第四軍醫(yī)大學(xué);2015年

3 張英;原發(fā)性局灶性肌張力障礙患者的經(jīng)顱超聲研究[D];蘇州大學(xué);2016年

4 周劍;使用高通量測(cè)序平臺(tái)對(duì)肌張力障礙患者進(jìn)行基因篩查[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2016年

5 劉瀟瀟;華東地區(qū)原發(fā)性肌張力障礙和面肌痙攣的流行病學(xué)調(diào)查[D];浙江大學(xué);2011年

6 張偉;肌張力障礙患者的認(rèn)知、情感和睡眠障礙及疼痛對(duì)生活質(zhì)量的影響[D];昆明醫(yī)科大學(xué);2013年

7 張保艷;多巴反應(yīng)性肌張力障礙的分子遺傳學(xué)研究[D];遼寧醫(yī)學(xué)院;2012年

8 張建園;多巴反應(yīng)性肌張力障礙12例臨床及基因分析[D];山東大學(xué);2013年

9 陳蕾;多巴反應(yīng)性肌張力障礙的臨床特點(diǎn)及基因?qū)W研究[D];天津醫(yī)科大學(xué);2005年

10 孫繼明;肌張力障礙疾病代謝組學(xué)的診斷探索及頸動(dòng)脈外膜剝脫手術(shù)前后小分子代謝物的差異[D];第四軍醫(yī)大學(xué);2013年

，

本文編號(hào)：1633399