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血清MicroRNA作為預(yù)測多形性膠質(zhì)母細胞瘤患者預(yù)后的生物標志物

發(fā)布時間:2018-03-13 10:48

  本文選題:微小RNA 切入點:多形性膠質(zhì)母細胞瘤 出處:《天津醫(yī)科大學(xué)》2014年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文


【摘要】:多形性膠質(zhì)母細胞瘤(GBM)是在成人中最常見的原發(fā)性中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤,發(fā)病率為3/10萬。盡管近幾十年來腫瘤學(xué)已經(jīng)取得了極大的進展,通過手術(shù)、放療、化療等一系列綜合治療手段治療后多形性膠質(zhì)母細胞瘤患者的預(yù)后仍然不容樂觀,中位生存時間為14個月,復(fù)發(fā)的可能性幾乎為100%,且在相同方案治療下,并不是所有的患者都能獲得相同的治療效果。已經(jīng)證實的與預(yù)后相關(guān)的因素非常有限,包括:年齡、KPS、mini-mental status examination score、腫瘤切除率和MGMT啟動子是否甲基化。目前,雖然分子和基因表達譜的研究已經(jīng)鑒別出能夠影響GBM患者預(yù)后的因素,但是這些因素依然存在著這樣那樣的缺點。Micro RNA(mi RNA)是一種內(nèi)源性的非蛋白編碼的小分子RNA,它可以在轉(zhuǎn)錄后水平上對靶基因的表達進行負性調(diào)控。mi RNA的異常表達與很多種疾病都息息相關(guān),尤其是腫瘤。由于單個的mi RNA就能調(diào)節(jié)數(shù)以百計的下游基因,故與蛋白表達基因普相比,應(yīng)用mi RNA表達譜會獲得更多且更精準的關(guān)于癌癥分類方面的信息。目前已經(jīng)有一些研究篩選出GBM腫瘤組織中的mi RNA表達譜作為預(yù)測GBM的預(yù)后因子。近年來,隨著血清mi RNAs的發(fā)現(xiàn),mi RNAs的研究領(lǐng)域聚焦在血清mi RNAs與疾病的診斷與預(yù)后上。作為新的生物學(xué)標志物,血清mi RNAs有著快捷,方便,準確性較高等優(yōu)點。已經(jīng)有研究證實,血清mi RNAs可以作為預(yù)測非小細胞肺癌預(yù)后的生物標志物。然而,目前沒有任何研究是應(yīng)用血清mi RNA表達譜篩選的方法來預(yù)測GBM患者的生存期的。在本研究中,我們假設(shè)GBM患者血清中存在一種特定的mi RNA表達譜可以作為預(yù)測預(yù)后的指紋。為了證明這一假設(shè),我們應(yīng)用Solexa(Solexa Sequencing)技術(shù)、q RT-PCR(Quantitative Real Time Polymerase Chain Reaction)等實驗技術(shù)和IBM SPSS 19.0軟件進行統(tǒng)計學(xué)分析。最后得出結(jié)論。首先,我們從北京天壇醫(yī)院收集了127例GBM患者的血清標本,同時對這些患者進行長期的隨訪,將患者血清標本按照生存期的長短分為兩組(以中位生存期393天為界)。接下來,在兩組標本中各選出20例,每例血清取1ml混為兩種血清樣本,并提取總RNA,通過Solexa Sequencing技術(shù)檢測兩種血清標本中差異表達的mi RNAs。結(jié)果顯示,有63個mi RNAs表達量在兩種血清標本中存在差異。隨后,在差異表達的mi RNAs中,根據(jù)表達差異的大小、已有的文獻報道和本實驗室的研究成果,選出了16個mi RNAs作為下一步驗證的目標。然后根據(jù)q RT-PCR(quantitive real time polymerase chain reaction)技術(shù)對選出的這些mi RNAs的表達水平做逐一驗證,根據(jù)表達差異在2倍以上且T-test結(jié)果P值0.05的具有穩(wěn)定表達差異的mi RNAs,即:mi R-27b和mi R-148b。最后我們分別對mi R-27b和mi R-148b評估GBM預(yù)后的敏感性與特異性做了ROC曲線,曲線下面積分別為:0.872和0.818我們應(yīng)用SPSS19.0中的Kaplan-Meier方法和Cox regression對這些mi RNAs做了統(tǒng)計學(xué)分析。結(jié)果顯示GBM患者血清中mi RNAs的表達水平是獨立于年齡與性別的預(yù)后的相關(guān)因素,且與預(yù)后成負相關(guān)關(guān)系。
[Abstract]:Glioblastoma multiforme (GBM) is the most common in adults in primary central nervous system tumors, the incidence rate of 3/10 million. Although in recent decades oncology has made great progress, by surgery, radiotherapy, chemotherapy and a series of comprehensive treatment after the prognosis of patients with glioma of shape the tumor cells are still not optimistic, the median survival time was 14 months, the possibility of recurrence is almost 100%, and in the same treatment, not all patients can get the same treatment. Proven and prognosis related factors is very limited, including: age, KPS, Mini-Mental Status Examination score the resection rate of tumor, and MGMT promoter methylation. At present, although the molecular and gene expression studies have identified factors can affect the prognosis of patients with GBM, but these factors still exist such as .Micro RNA (MI RNA) disadvantage is the small molecule RNA non protein encoding an endogenous, it can be carried out on the expression of target genes at the post transcriptional level of abnormal expression of negative regulation of.Mi RNA and many kinds of diseases are closely related, especially tumor. Because a single Mi downstream gene RNA can regulate hundreds of therefore, gene and protein expression of Pu compared to application of MI RNA expression profiles will get more and more information about the cancer classification precision. At present there have been some studies selected from the MI RNA GBM in tumor tissue expression as a prognostic factor of GBM. In recent years, along with the level of MI RNAs, MI RNAs the research focused on the diagnosis and prognosis of serum mi RNAs and disease. As a new biological marker, serum mi RNAs is a fast, convenient, the advantages of high accuracy. Studies have shown that serum mi RNAs can be To predict the prognosis of non - small cell lung cancer biomarker. However, there is no study on expression of serum mi RNA spectrum screening method to predict the survival of patients with GBM. In this study, we assume that there is a mi RNA specific expression profiles can be used to predict the prognosis of the fingerprint in the serum of patients with GBM. In order to prove this hypothesis, we used Solexa (Solexa Sequencing), Q RT-PCR (Quantitative Real Time Polymerase Chain Reaction) and other experimental technology and IBM SPSS 19 software for statistical analysis. Finally draw the conclusion. First, we collected from Beijing Tiantan Hospital, 127 serum samples from GBM patients, and the long-term follow-up of these patients the serum samples of patients, according to the length of survival were divided into two groups (with a median survival of 393 days for the sector). Then, in the two groups were selected from each of 20 cases, 1 cases of each serum Ml mixed into two serum samples, and total RNA was extracted and detected by Solexa Sequencing technique two differentially expressed in serum samples of MI RNAs. showed that the expression of 63 mi RNAs in two serum samples of variance. Then, differences in the expression of MI in RNAs, according to the differential expression of the size of existing the literature reports and the laboratory research results, selected 16 mi RNAs as the next test target. Then according to the Q RT-PCR (quantitive real time polymerase chain reaction) expression levels for the selected Mi these RNAs do one by one verification, according to the difference of expression in more than 2 times and the results of T-test P 0.05 with a stable expression mi RNAs, namely: Mi R-27b and MI R-148b. respectively at the end of the MI R-27b and MI R-148b to evaluate the prognosis of GBM the sensitivity and specificity of the ROC curve, the area under the curve were 0.872 and 0.818 I We used SPSS19.0's Kaplan-Meier method and Cox regression to do statistical analysis of these mi RNAs. The results showed that MI RNAs expression level in GBM patients was independent of age and sex prognosis, and negatively correlated with prognosis.

【學(xué)位授予單位】:天津醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號】:R739.41

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