本文關(guān)鍵詞： 胚胎發(fā)育不良性神經(jīng)上皮腫瘤 低級別膠質(zhì)瘤 蛋白質(zhì)組學(xué) 同位素標(biāo)記相對和絕對定量技術(shù) 生物標(biāo)記物　出處：《中華全科醫(yī)學(xué)》2016年07期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的應(yīng)用同位素標(biāo)記相對和絕對定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)(iTRAQ)聯(lián)合液相串聯(lián)質(zhì)譜篩選胚胎發(fā)育不良性神經(jīng)上皮腫瘤與低級別膠質(zhì)瘤的差異表達(dá)蛋白。方法收集胚胎發(fā)育不良性神經(jīng)上皮腫瘤(編號113)與低級別膠質(zhì)瘤(編號114)各6例實體組織凍存新鮮標(biāo)本,各組標(biāo)本混合,通過蛋白質(zhì)提取,蛋白質(zhì)濃度測量(采用Bradford定量),聚丙烯酰胺凝膠電泳,蛋白質(zhì)酶解,iTRAQ標(biāo)記,SCX分離,再進(jìn)行基于QE的液質(zhì)聯(lián)用分析,得到信息數(shù)據(jù)。使用蛋白質(zhì)鑒定軟件Mascot 2.3.02,選擇Uni Prot-Human數(shù)據(jù)庫,然后進(jìn)行數(shù)據(jù)庫搜索和生物信息學(xué)分析。依據(jù)蛋白質(zhì)豐度水平,當(dāng)差異倍數(shù)達(dá)到1.3倍以上,且經(jīng)統(tǒng)計檢驗其P0.05時,視為差異蛋白。結(jié)果鑒定出了中國大陸黃種人DNT相對于低級別膠質(zhì)瘤的差異蛋白質(zhì)88個,其中上調(diào)蛋白質(zhì)44個,下調(diào)蛋白質(zhì)44個。這些差異蛋白具有不同生物學(xué)活性,并參與多種代謝及信號通路。其中重要的蛋白有水通道膜內(nèi)在蛋白1、絲氨酸/蘇氨酸激酶、細(xì)胞內(nèi)氯離子通道蛋白1、膜聯(lián)蛋白A1、谷氨酰胺合成酶、硫酸軟骨素多糖蛋白4、S100A9、S100A16、S100A13、異檸檬酸脫氫酶等。結(jié)論 iTRAQ技術(shù)實用可靠,有效篩選出胚胎發(fā)育不良性神經(jīng)上皮腫瘤與低級別膠質(zhì)瘤的差異表達(dá)蛋白。
[Abstract]:Objective to screen differentially expressed proteins between embryonic dysplasia neuroepithelial tumors and low-grade gliomas by isotope labeling and absolute quantitative proteomics combined with liquid phase tandem mass spectrometry. Methods embryonic development was collected. Frozen fresh specimens were collected from 6 cases of neuroepithelial tumors (No. 113) and 6 cases of low-grade gliomas (No. 114), respectively. The samples of each group were mixed and separated by protein extraction, protein concentration measurement (Bradford quantitative analysis, polyacrylamide gel electrophoresis, protein enzymolysis iTRAQ labeled SCX, and then analyzed by liquid / mass spectrometry based on QE). Using protein identification software Mascot 2.3.02, Uni Prot-Human database was selected, and then database search and bioinformatics analysis were carried out. Results 88 differentially expressed proteins of DNT were identified, including 44 up-regulated proteins and 44 down-regulated proteins, which had different biological activities. Important proteins include water channel, serine / threonine kinase, intracellular chloride channel protein 1, integrin A 1, glutamine synthetase, and so on. Chondroitin sulfate polysaccharide protein 4, S100A9, S100A16, S100A13, isocitrate dehydrogenase, etc. Conclusion iTRAQ technique is practical and reliable, and can effectively screen differentially expressed proteins between embryonic dysplasia neuroepithelial tumors and low-grade gliomas.
【作者單位】： 廣州軍區(qū)廣州總醫(yī)院病理科;廣州軍區(qū)廣州總醫(yī)院醫(yī)學(xué)實驗科;
【基金】：廣東省科技計劃項目(2012B031800177)
【分類號】：R739.41

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