多發(fā)腦膠質(zhì)母細胞瘤的全基因組、表觀基因組分析及分子概況
本文關(guān)鍵詞: 膠質(zhì)瘤 核磁共振 多發(fā)膠質(zhì)瘤 細胞色素b5還原酶2 基因組 出處:《天津醫(yī)科大學(xué)》2016年博士論文 論文類型:學(xué)位論文
【摘要】:百分之十到二十的新發(fā)膠質(zhì)母細胞瘤發(fā)病時存在多發(fā)病灶,稱為多灶性膠質(zhì)母細胞瘤或多中心性膠質(zhì)母細胞瘤(M-GBM)。這些病人的預(yù)后要比單發(fā)膠質(zhì)母細胞瘤差。但是目前還不清楚多發(fā)膠質(zhì)瘤是否有著獨特的基因組、表觀基因組或分子基礎(chǔ)。我們從TCGA數(shù)據(jù)庫中203例有術(shù)前核磁共振圖像的新發(fā)膠質(zhì)母細胞瘤病人中,鑒定出30例多發(fā)膠質(zhì)瘤,然后綜合分析了這30例病人的全基因組基因突變、全基因組拷貝數(shù)變化、全基因組啟動子甲基化及基因表達情況,并與173例單發(fā)膠質(zhì)母細胞瘤的相應(yīng)數(shù)據(jù)進行對比。我們發(fā)現(xiàn)多發(fā)膠質(zhì)母細胞瘤缺乏IDH1、ATRX或PDGFRA突變,多發(fā)膠質(zhì)母細胞瘤病人中間質(zhì)型常見。同時,我們還發(fā)現(xiàn)CYB5R2在多發(fā)膠質(zhì)母細胞瘤病人中表達水平升高、而且CYB5R2的啟動子甲基化水平在多發(fā)膠質(zhì)母細胞瘤中降低。CYB5R2的表達水平在兩個大型膠質(zhì)瘤病人數(shù)據(jù)庫,共超過700例膠質(zhì)瘤病人中與預(yù)后負相關(guān),CYB5R2表達水平高的病人預(yù)后差。IDH1突變與CYB5R2啟動子甲基化明顯相關(guān),但CYB5R2表達水平對預(yù)后的影響卻獨立于IDH1突變。CYB5R2的表達與抗原成熟及分解過程以及免疫調(diào)節(jié)密切相關(guān)。這些結(jié)果表明,多發(fā)膠質(zhì)母細胞瘤有著一些獨特的基因組、表觀基因組特征,并且多發(fā)膠質(zhì)母細胞瘤病人預(yù)后較差,CYB5R2是一個新的表觀基因組標志物。
[Abstract]:Between 10% and 20 of the newly developed glioblastoma had multiple lesions. Known as multifocal glioblastoma or multicentric glioblastoma, the prognosis of these patients is worse than that of single glioblastoma, but it is not clear whether multiple gliomas have a unique genome. Epigenome or molecular basis. We identified 30 patients with multiple gliomas from a TCGA database of 203 newly developed glioblastoma patients with preoperative MRI images, and then comprehensively analyzed the gene mutations in the entire genome of these 30 patients. The whole genome copy number, methylation and gene expression of the whole genome promoter were compared with the corresponding data of 173 cases of single glioblastoma. We found that multiple glioblastoma lacks IDH1T ATRX or PDGFRA mutation. The expression of CYB5R2 in patients with multiple glioblastoma is higher than that in patients with multiple glioblastoma. Moreover, the promoter methylation level of CYB5R2 decreased in multiple glioblastoma. CYB5R2 expression level was found in two large glioma patient databases. In more than 700 glioma patients, the prognosis of patients with high CYB5R2 expression was negatively correlated with the prognosis. IDH1 mutation was significantly associated with methylation of CYB5R2 promoter. However, the effect of CYB5R2 expression on prognosis is independent of the expression of IDH1 mutation. CYB5R2 is closely related to antigen maturation, decomposition and immunomodulation. These results suggest that multiple glioblastoma has some unique genomes. The prognosis of patients with multiple glioblastoma is poor. CYB5R2 is a new apparent genomic marker.
【學(xué)位授予單位】:天津醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R739.41
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,本文編號:1504811
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