本文關(guān)鍵詞：云南省鼠疫菌多位點(diǎn)可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列分型及流行病學(xué)意義，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：[目的] 利用MLVA分子分型技術(shù)的優(yōu)勢(shì)對(duì)云南省家鼠鼠疫菌、野鼠鼠疫菌及玉龍鼠疫菌進(jìn)行分子分型，以闡明它們之間的遺傳進(jìn)化關(guān)系，更加深入了解云南省鼠疫的內(nèi)在聯(lián)系及其對(duì)人群的危害，為制定合理的防控措施提供依據(jù)。 [材料方法] 1.菌株選擇選擇不同地點(diǎn)、不同年代、不同來(lái)源的云南鼠疫菌株163株進(jìn)行分析，其中分離自家鼠的菌株139株（德宏州42株、臨滄市32株、保山市10株、普洱市17株、紅河州15株、文山州11株、西雙版納州6株、昆明市1株、玉溪市1株、廣西省3株、貴州省1株）、野鼠菌株17株、玉龍菌株7株。 2. VNTR位點(diǎn)選擇選擇國(guó)內(nèi)外文獻(xiàn)公布的對(duì)鼠疫菌有較強(qiáng)分型能力的M21、M34、YP1335、YPO0320、YPO3743、YPO2984、M29的7個(gè)位點(diǎn)。 3. DNA的提取利用QIAGEN細(xì)菌DNA提取試劑盒進(jìn)行提取制備，并將DNA濃度調(diào)整在20-100ng/ul。 4.毛細(xì)管電泳實(shí)驗(yàn)結(jié)果用Genemapper4.0分析最后結(jié)果以Excel形式保存。 5.結(jié)果分析計(jì)算多態(tài)性位點(diǎn)串聯(lián)重復(fù)數(shù)結(jié)果整理好后用Bionumerics軟件繪制聚類圖和最小生成樹(shù)。 [結(jié)果] 1.在上述7個(gè)位點(diǎn)中對(duì)云南省鼠疫菌株分型能力較強(qiáng)的有5個(gè)位點(diǎn)（M21、M34、YP1335、YPO320、YPO3743），其余2個(gè)位點(diǎn)多態(tài)性指數(shù)小于50%。 2.實(shí)驗(yàn)中163株鼠疫菌，可以分為7個(gè)群（相似度60%），14個(gè)簇(相同底色)，78個(gè)基因型(相似度100%)。玉龍鼠疫菌、野鼠鼠疫菌、家鼠鼠疫菌都有一個(gè)相對(duì)獨(dú)立的基因群。 3.2006-2008分離的7株玉龍鼠疫菌株其MLVA的基因型完全相同；所選的1982年云南家鼠鼠疫復(fù)燃以來(lái)的菌株屬于一個(gè)基因群，包括8個(gè)簇67個(gè)基因型；1954年和1964年分離的2株家鼠鼠疫菌株屬于獨(dú)立基因群，并只有一個(gè)基因型；17株云南野鼠菌株屬于另一個(gè)基因群，共有5個(gè)基因簇10個(gè)基因型。 [結(jié)論] 1.應(yīng)用上述7個(gè)位點(diǎn)對(duì)云南菌株進(jìn)行分子分型與云南菌株的生態(tài)型可以較好的吻合，并能提供更多的菌株內(nèi)在信息。 2.2006年發(fā)現(xiàn)的玉龍鼠疫疫源地，其菌株的基因型與云南家野鼠兩型鼠疫菌株都有較大的差異，結(jié)合其菌株生化特性差異，進(jìn)一步提示玉龍鼠疫疫源地是一塊新型的疫源地。 3.從整體看，分離自不同年代同一地點(diǎn)的菌株有相似的基因型，即具有一定的地點(diǎn)聚集性；而同一年代不同地點(diǎn)分離的菌株其基因型相差較遠(yuǎn)，即不具有時(shí)間聚集性。 4.本研究結(jié)果顯示利用MLVA對(duì)云南省鼠疫菌株分型，，所構(gòu)建的MLVA數(shù)據(jù)庫(kù)，有望為今后新分離菌株的溯源提供研究基礎(chǔ)。
【關(guān)鍵詞】：鼠疫菌 分子分型 可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列 多位點(diǎn)可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列
【學(xué)位授予單位】：大理學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2013
【分類號(hào)】：R181.2
【目錄】：

• 目錄3-5
• 摘要5-7
• Abstract7-9
• 前言9-14
• 材料與方法14-19
• 結(jié)果和分析19-30
• 討論30-35
• 結(jié)論與展望35-36
• 參考文獻(xiàn)36-39
• 附錄39-53
• 綜述53-60
• 參考文獻(xiàn)57-60
• 致謝60

【參考文獻(xiàn)】

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中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

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本文編號(hào)：356098