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天津地區(qū)麻疹病毒分子流行病學的初步研究

發(fā)布時間:2020-11-10 02:20
   目的:了解天津市麻疹病毒(measles virus,MV)流行株的基因型并在本實驗室建立分子病毒學的研究方法。方法:將2002年天津市的麻疹散發(fā)病人尿液標本中分離到的麻疹病毒12株用EB病毒轉(zhuǎn)化的絨猴淋巴細胞(B95a細胞)復蘇后,提取其總RNA,采用逆轉(zhuǎn)錄—聚合酶鏈反應(RT—PCR)方法擴增出核蛋白(N)基因碳末端590個核苷酸片段,用BcnⅠ內(nèi)限酶進行限制性片段長度多態(tài)性分析(RFLP)后,選取了3株與PMD-18T Vector構(gòu)建重組質(zhì)粒。對重組質(zhì)粒進行核酸序列測定,并對N基因碳末端456個核苷酸進行序列系統(tǒng)樹分析。結(jié)果:RT—PCR后12份均檢測出590bp的特異性N基因目的條帶,經(jīng)RFLP后,顯示兩種類型的譜帶。通過對3株病毒重組質(zhì)粒的序列測定和分析證明,3株均為麻疹病毒H1基因型,其中1株為H1b亞型,另外兩株為H1a亞型。H1a的2株的456個核苷酸與H1b株的差異為3.07~4.17%。這3株的456個核苷酸與A基因型代表株序列的基因差異為6.36~7.23%,與H1基因型代表株的基因差異為1.53~2.41%。3株與A基因型代表株序列相比氨基酸有義突變共達16處。結(jié)論:2002年天津市麻疹散發(fā)病例的核酸序列為H基因型,本研究中所建立的實驗方法可用于今后繼續(xù)監(jiān)測我市麻疹流行株的基因變異,對我國加速麻疹控制及麻疹消除、消滅是十分必要的。
【學位單位】:天津醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2003
【中圖分類】:R181.3
【部分圖文】:

麻疹病毒,引物,RNA序列,單鏈


用QiagenRNA抽提試劑盒提取的RNA,以RNA單鏈為模板,用引物Pl和PZ擴增N基因片段,12份都產(chǎn)生了預期的590bp特異產(chǎn)物帶,陰性對照不被該引物所擴增。說明存在特異的RNA序列,電泳結(jié)果如圖1所示。

麻疹病毒,片段,內(nèi)切酶,去離子水


將麻疹病毒N基因片段用內(nèi)切酶Bcnl經(jīng)酶切后,12份中MV-9得到兩個290bp左右的片段,其余11份均被切為約290bp、80bp、230bp的三個片段。以加入去離子水為陰性對照,電泳結(jié)果如圖2所示。

麻疹病毒,瓊脂糖電泳,產(chǎn)物,片段


(二)PCR產(chǎn)物的純化及含量估計經(jīng)Promega公司的PCR產(chǎn)物純化試劑盒提純的DNA溶于去離子水中,瓊脂糖凝膠電泳如圖3。鑒于條件所限,沒有通過檢測其吸光度估計含量。
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本文編號:2877319

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