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滇南主要口岸入境人群HIV-1分子流行病學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2017-04-15 15:30

  本文關(guān)鍵詞:滇南主要口岸入境人群HIV-1分子流行病學(xué)研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:人類免疫缺陷病毒感染導(dǎo)致的艾滋病是威脅全球人類健康的公共衛(wèi)生問題。根據(jù)聯(lián)合國艾滋病規(guī)劃署發(fā)布的《2013年艾滋病疫情報(bào)告》,截至2012年底,全球存活的艾滋病病毒感染者和病人3530萬(3220萬~3880萬),新發(fā)HIV感染者230萬人(190萬~270萬),艾滋病相關(guān)死亡人數(shù)160萬人(140萬~190萬)。而南亞和東南亞地區(qū)的新發(fā)感染人數(shù)為27萬(16萬~44萬),死亡人數(shù)為22萬(15萬~31萬)。東南亞地區(qū)是亞洲HIV-1感染較為嚴(yán)重的地區(qū)之一,而云南省是連通中國和東南亞國家的窗口,也是中國HIV-1基因亞型起源,流行和傳播的中心。研究云南省HIV-1的分子流行病學(xué)特征,了解它的進(jìn)化規(guī)律或傳播規(guī)律,對(duì)制定防控措施和疫苗生產(chǎn)以及治療藥物的開發(fā)等都有重要的指導(dǎo)意義。云南省位于中國的西南邊境,與緬甸、老撾和越南3國接壤,由于毗鄰全球最大的毒品生產(chǎn)地——“金三角”地區(qū),成為毒品進(jìn)入中國及其鄰國市場的主要通道。隨著我國面向東南亞對(duì)外開放和邊境貿(mào)易的發(fā)展,云南經(jīng)各邊境口岸的跨境人員也不斷增加,隨之也帶來各種傳播性疾病的跨境傳播。已有研究對(duì)中緬跨境人群HIV-1感染與基因型分布進(jìn)行了報(bào)道,但較少有關(guān)于云南省南部口岸跨境人群HIV-1感染情況的研究報(bào)告。云南省南部有紅河州河口口岸,普洱市勐康口岸,西雙版納州打洛口岸,以及西雙版納國際機(jī)場等口岸與東南亞國家直接相通,成為人員跨境和貿(mào)易往來繁忙區(qū)域。本文選擇紅河和西雙版納兩地州的入境人群進(jìn)行HIV-1分子流行病學(xué)研究,以闡明滇南主要口岸入境人群HIV-1的流行與傳播規(guī)律。研究對(duì)從2003年到2012年募集的326例滇南主要口岸入境HIV-1感染者,采集、提取并儲(chǔ)存血漿中病毒RNA,用RT-Nested-PCR方法進(jìn)行g(shù)ag-RT區(qū)(2.6kb)基因擴(kuò)增,分為gag (1155bp)、gag-prot (885bp)和RT (1010bp)3個(gè)區(qū)段,經(jīng)序列測定拼接后,成功獲得163例樣本的gag-RT區(qū)(2.6kb)序列。采用MEGA6.0軟件進(jìn)行病毒的同源關(guān)系分析以確定其基因型,發(fā)現(xiàn)HIV-1人群中存在種類多樣的HIV-1基因亞型和重組型,包括82例CRF01_AE (50.3%)、38例CRF08_BC (23.3%)、10例CRF07_BC(6.1%)、2例SGR_0708 (1.2%)、3例C(1.8%)、2例B(1.2%)和26例URFs(16%)?梢,CRF01_AE為主要流行基因型,其次流行的是CRF08_BC、 CRF07_BC,而“單亞型”B和C退之其后。在已知傳播途徑的感染者中,以性接觸為主要傳播途徑(90.1%),可能導(dǎo)致CRF01_AE的主要流行。另外,在該人群中存在多種模式的獨(dú)特重組(URFs),包括10例B/C、5例CRF08_BC/CRF07_BC、4例CRF01_AE/C、3例CRF01_AE/B、2例CRF01_AE/CRF08_BC、1例C/A1和1例CRF58_01B/B/C=Simplot分析發(fā)現(xiàn)7種URFs除C/A1、CRF58_01B/B/C重組模式只有一種重組結(jié)構(gòu)外,其他的重組模式都有2種或2種以上的重組結(jié)構(gòu)。其中B/C有4種重組結(jié)構(gòu),CRF08_BC/CRF07_BC有2種重組結(jié)構(gòu),CRF01_AE/C有4種重組結(jié)構(gòu),CRF01_AE/B有3種重組結(jié)構(gòu),CRF01_AE/CRF08_BC有2種重組結(jié)構(gòu)。在這些URFs中,CRF01_AE/C、C/A1、 CRFO1_AE/CRF08_BC和CRF58_01B/B/C 4種重組亞型在云南其他地方或中國其他地區(qū)還沒有過報(bào)道,這說明滇南主要口岸入境人群中HIV-1基因亞型分布復(fù)雜。綜上所述,滇南主要口岸入境人群中存在一定程度的HIV-1流行,且基因亞型種類較多,并存在大量的URFs重組型,入境人群成為HIV-1跨境傳播的主要攜帶者。對(duì)滇南主要口岸入境人群的HIV-1分子流行病學(xué)特點(diǎn)的闡明,有助于了解云南省HIV-1的傳播規(guī)律并預(yù)測將來的流行態(tài)勢,對(duì)制定HIV-1預(yù)防措施,以及疫苗的研制具有重要意義。
【關(guān)鍵詞】:艾滋病 HIV-1 分子流行病學(xué) 基因亞型 獨(dú)特重組 重組模式
【學(xué)位授予單位】:昆明理工大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R512.91;R181.3
【目錄】:
  • 摘要6-8
  • ABSTRACT8-16
  • 英文縮寫詞表16-18
  • 第一章 緒論18-37
  • 1.1 艾滋病病毒與艾滋病18-19
  • 1.2 AIDS的流行與危害19-23
  • 1.2.1 全球AIDS流行現(xiàn)狀19-20
  • 1.2.2 亞洲AIDS流行現(xiàn)狀20-22
  • 1.2.3 云南省HIV流行現(xiàn)狀22-23
  • 1.3 HIV病原學(xué)特點(diǎn)23-28
  • 1.3.1 HIV的基因組結(jié)構(gòu)及其編碼蛋白23-26
  • 1.3.2 HIV的復(fù)制26-27
  • 1.3.3 HIV的傳播途徑27-28
  • 1.4 HIV的診斷與治療28-31
  • 1.4.1 免疫學(xué)方法28-29
  • 1.4.2 分子生物學(xué)檢測方法29-30
  • 1.4.3 基因芯片技術(shù)的應(yīng)用30
  • 1.4.4 艾滋病的發(fā)病機(jī)制和目前的治療狀況30-31
  • 1.5 HIV基因亞型檢測方法31-34
  • 1.5.1 HIV基因分型技術(shù)31-33
  • 1.5.2 HIV重組型鑒定33-34
  • 1.6 本論文研究的目的意義和技術(shù)路線34-37
  • 1.6.1 本論文研究的目的意義34-36
  • 1.6.2 本論文研究的技術(shù)路線36-37
  • 第二章 云南省跨境流動(dòng)人口與艾滋病傳播37-46
  • 2.1 引言37-38
  • 2.2 云南省出入境內(nèi)口岸分布38-39
  • 2.3 云南省跨境流動(dòng)人口HIV-1感染者的人口學(xué)特征39-41
  • 2.4 滇南主要口岸入境人群HIV-1感染者的人口學(xué)特稱41-44
  • 2.5 討論44-45
  • 2.6 本章小結(jié)45-46
  • 第三章 云南省紅河州入境人群HIV-1基因亞型分布研究46-64
  • 3.1 引言46
  • 3.2 實(shí)驗(yàn)材料與方法46-54
  • 3.2.1 研究對(duì)象46-47
  • 3.2.2 實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備與試劑47-48
  • 3.2.3 數(shù)據(jù)分析工具48-49
  • 3.2.4 實(shí)驗(yàn)方法49-53
  • 3.2.5 數(shù)據(jù)分析53-54
  • 3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果54-60
  • 3.3.1 紅河州入境人群HIV-1人口學(xué)特征54-55
  • 3.3.2 紅河州入境人群HIV-1基因型分布特點(diǎn)55-58
  • 3.3.3 紅河州入境人群HIV-1重組型分析58-60
  • 3.3.4 03~12年紅河州入境人群CRF01_AE基因亞型的起源與進(jìn)化分析60
  • 3.4 討論60-63
  • 3.5 本章小結(jié)63-64
  • 第四章 云南省西雙版納州入境人群HIV-1基因亞型分布研究64-72
  • 4.1 引言64
  • 4.2 實(shí)驗(yàn)材料和方法64-65
  • 4.2.1 研究對(duì)象64
  • 4.2.2 實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備與試劑64-65
  • 4.2.3 數(shù)據(jù)分析工具65
  • 4.2.4 實(shí)驗(yàn)方法65
  • 4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果65-70
  • 4.3.1 西雙版納州入境人群HIV-1感染者人口學(xué)特征65-66
  • 4.3.2 西雙版納州入境人群HIV-1基因型分布特點(diǎn)66-69
  • 4.3.3 西雙版納州入境人群HIV-1重組型分析69-70
  • 4.4 討論70-71
  • 4.5 本章小結(jié)71-72
  • 第五章 滇南主要口岸入境人群HIV-1 URFS重組模式分析72-86
  • 5.1 引言72
  • 5.2 實(shí)驗(yàn)材料和方法72-73
  • 5.2.1 研究對(duì)象72
  • 5.2.2 實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備與試劑72-73
  • 5.2.3 數(shù)據(jù)分析工具73
  • 5.2.4 實(shí)驗(yàn)方法73
  • 5.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果73-79
  • 5.3.1 26例HIV-1gag-RT基因進(jìn)化樹分析結(jié)果73-74
  • 5.3.2 Simplot對(duì)26例URFs的重組斷點(diǎn)分析結(jié)果74-79
  • 5.4 HIV-1代表株近全長基因組分析79-82
  • 5.4.1 HIV-1代表株各區(qū)段進(jìn)化樹分析79-81
  • 5.4.2 HIV-1代表株Simplot分析81-82
  • 5.5 討論82-85
  • 5.6 本章小結(jié)85-86
  • 第六章 結(jié)論86-88
  • 6.1 云南省跨境流動(dòng)人口與艾滋病傳播86
  • 6.2 云南省紅河州入境人群HIV-1的流行概況86-87
  • 6.3 云南省西雙版納州入境人群HIV-1的流行概況87
  • 6.4 滇南主要口岸入境人群HIV-1 URFs流行概況87-88
  • 致謝88-89
  • 參考文獻(xiàn)89-100
  • 附錄A 攻讀碩士期間發(fā)表論文目錄100

【參考文獻(xiàn)】

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  本文關(guān)鍵詞:滇南主要口岸入境人群HIV-1分子流行病學(xué)研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

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本文編號(hào):308714

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