真菌流行病學(xué)調(diào)查及白念珠菌和熱帶念珠菌基因分型研究
發(fā)布時(shí)間:2018-12-13 13:15
【摘要】: 實(shí)驗(yàn)?zāi)康?調(diào)查北京協(xié)和醫(yī)院1999~2005年臨床分離真菌的種屬分類和分布,并研究北京協(xié)和醫(yī)院ICU病房及同一患者不同標(biāo)本來源或不同時(shí)間收集的菌株的基因分型,并以唐山市人民醫(yī)院腫瘤科病房患者分離的菌株作為參照,探討菌株的區(qū)域流行情況。 實(shí)驗(yàn)方法 錄入北京協(xié)和醫(yī)院1999~2005年臨床分離鑒定的真菌,進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)、分析。收集北京協(xié)和醫(yī)院2004和2005年臨床分離鑒定的白念珠菌和熱帶念珠菌,采用底物顯色鑒定法和API 20C鑒定試劑盒重新鑒定,再采用隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)和重復(fù)序列PCR(repetitive-sequence-based PCR,Rep-PCR)進(jìn)行分型研究;并對(duì)2005年同一患者不同標(biāo)本來源或不同時(shí)間收集的菌株通過RAPD和Rep-PCR方法進(jìn)行基因分型研究。收集唐山市人民醫(yī)院2005年腫瘤科病房患者臨床分離的白念珠菌和熱帶念珠菌,采用RAPD方法進(jìn)行同源性分析。 結(jié)果 北京協(xié)和醫(yī)院1999~2005年臨床分離的真菌構(gòu)成情況和變化趨勢(shì): 從1999~2005年臨床送檢真菌標(biāo)本明顯升高,標(biāo)本量從1727份升高到8533份,菌株檢測(cè)陽性數(shù)從554升高到2848株,陽性菌株數(shù)占送檢標(biāo)本比例為25.3%~41.5%之間。菌株陽性病例數(shù)從1999年的324升高到2005年的2010例,陽性率在17.3%~28.5%之間。 白念珠菌檢測(cè)數(shù)量從1999年的177例升高到2005年的736例,熱帶念珠菌從53例升高到171例,光滑念珠菌從45例升高到188例,煙曲霉從5例升高到144例,黃曲霉從0升高到85例。白念珠菌比例為35%~55%,光滑念珠菌比例為6.7%~14.5%,熱帶念珠菌為8.3%~16.4%,克柔念珠菌為1.2%~4.1%,近平滑念珠菌為0.3%~1.6%。煙曲霉比例由1999年的1.5%升高到2005年的7.2%,黃曲霉比例由1999年的0%升高到2005年的4.2%。克柔念珠菌2002檢出量為36株,在這幾年中所占比例最高為4.1%。2003年所檢菌株總體數(shù)量及各種屬數(shù)量降低,考慮SARS影響,醫(yī)院患者減少或患者結(jié)構(gòu)改變所致。 不同標(biāo)本來源分離的菌株分布不同:血液標(biāo)本分離的所有菌株白念珠菌占最多,依次為熱帶念珠菌、近平滑念珠菌、光滑念珠菌和新型隱球菌等;肺泡灌洗液標(biāo)本分離的白念珠菌最多,其次青霉、煙曲霉、光滑念珠菌;尿液、生殖道標(biāo)本分離的白念珠菌最多,其次為光滑念珠菌和熱帶念珠菌;腦脊液標(biāo)本分離的新型隱球菌最多,其次白念珠菌和熱帶念珠菌;呼吸道標(biāo)本分離的白念珠菌最多,其次為熱帶念珠菌和光滑念珠菌。 1999~2005年血液標(biāo)本送檢分布顯示,標(biāo)本量從1999年的4884個(gè)臨床檢測(cè)標(biāo)本上升到2005年的11287個(gè)臨床檢測(cè)標(biāo)本。所有菌株的陽性分離株從1999年的358株上升到2005年的1265株,陽性率從1999年(7.3%)到2002年(11.6%)呈上升趨勢(shì),2001年到2005年保持平穩(wěn)趨勢(shì)(10.1%~13.8%),2003年受SARS影響陽性率有所降低(比例為10.1%)。血中鑒定的真菌陽性標(biāo)本數(shù)從1999年的11例上升到2005年的106例。陽性率從1999年到2002年呈上升趨勢(shì)(從3.1%上升到10.1%),2003年和2004年有所下降,2005年又開始回升。陽性患者例數(shù)從1999年的8例上升到2005年的47例。 1999~2005年血培養(yǎng)陽性菌株總計(jì)226例,其中可查到病例的菌株為53株,其中包括女性24株,男性29株。平均年齡52.4歲(除外一例新生兒敗血癥患者)。外科住院患者19例,ICU和MICU住院經(jīng)歷20例,血液科標(biāo)本2例,腫瘤患者21例。手術(shù)治療患者41例,中心靜脈插管28例,插管引流患者35例。 檢測(cè)到罕見部位真菌陽性菌株如眼部分離出新型隱球菌等,關(guān)節(jié)沖洗液分離出尖端賽多孢等。 隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA和Rep—PCR方法對(duì)白念珠菌和熱帶念珠菌進(jìn)行同源性分析結(jié)果如下: 2004年北京協(xié)和醫(yī)院ICU病房分離的8株白念珠菌采用RAPD方法分析顯示存在5種基因型,Rep-PCR方法有3種基因型。2005年北京協(xié)和醫(yī)院ICU病房白念珠菌采用RAPD方法基因分型共有4種基因型(B型包括B1和B2亞型),Rep-PCR方法有5種基因型(A型包括A1和A2亞型,C型包括C1和c2亞型)。同一患者不同標(biāo)本來源或不同時(shí)間采集白念珠菌標(biāo)本進(jìn)行基因型分析,共分析六名患者,其中三名患者基因型自身完全一致,三名患者基因型自身不完全一致。 本次試驗(yàn)在2004年和2005年分別檢測(cè)到ICU病房?jī)?nèi)兩種基因型的熱帶念珠菌,其中有一種基因型在2004年和2005年均有分布。同一患者不同標(biāo)本來源或不同時(shí)間采集標(biāo)本熱帶念珠菌基因型一致,,說明患者可能感染反復(fù)發(fā)作而不是重復(fù)感染或院內(nèi)存在單一菌株基因型流行為主。 2005年唐山市人民醫(yī)院腫瘤患者體內(nèi)分離的36株白念珠菌經(jīng)RAPD方法檢測(cè)顯示共有2種基因型(其中A型包括3個(gè)亞型,B型包括2個(gè)亞型)。唐山市人民醫(yī)院分離的8株熱帶念珠菌共顯示六種基因型,其中一種基因型分離于化療一病區(qū),另外五種基因型分離于化療二病區(qū)和胸外科病區(qū)。 結(jié)論 北京協(xié)和醫(yī)院1999~2005年臨床分離的真菌仍以白念珠菌所占比例最大,其次熱帶念珠菌和光滑念珠菌,近年來曲霉菌所占比例有所增高,臨床真菌送檢量及陽性檢出率都明顯升高。 不同標(biāo)本來源分離的菌株分布不同:血液標(biāo)本中所占比例最多的分別是白念珠菌、熱帶念珠菌和近平滑念珠菌;腦脊液標(biāo)本中新生隱球菌所占比例最多,其次白念珠菌和熱帶念珠菌;肺泡灌洗液中白念珠菌最多,其次青霉、煙曲霉、光滑念珠菌;尿液、生殖道分離的菌株白念珠菌最多,其次為光滑念珠菌和熱帶念珠菌;呼吸道分離的白念珠菌最多,其次為熱帶念珠菌和光滑念珠菌。 血源念珠菌感染與手術(shù)治療,中心靜脈插管等有一定的相關(guān)性。 北京協(xié)和醫(yī)院ICU病房在2004和2005年存在白念珠菌和熱帶念珠菌的克隆流行;同一患者不同標(biāo)本來源或不同時(shí)間采集標(biāo)本白念珠菌無明顯克隆流行性,熱帶念珠菌有明顯的克隆流行性。唐山市人民醫(yī)院分離的白念珠菌存在明顯的克隆流行性,熱帶念珠菌也有一定的克隆流行性。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2007
【分類號(hào)】:R181.3;R450
本文編號(hào):2376593
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2007
【分類號(hào)】:R181.3;R450
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):2376593
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